Izmir Institute of Technology, Biotechnology and

İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
Biyoteknoloji ve Biyomühendislik Anabilim Dalı
Gülbahçe, Urla İzmir 35430
PROGRAMIN Biyoteknoloji Master Programı (Biotechnology Master Program)
Adı
(Name of the
Program)
Dersin Kodu
Dersin Adı
Dersin Türü
Dersin Dönemi
(Course Code) (Course Name)
(Course Type)
(Course Semester)
Biyosensörlerin Temel
Zorunlu (Compulsory)[] Güz (Fall) [X] Bahar (Spring) [ ]
BTEC585
İlkeleri (
Seçmeli (Elective) [X ]
Principles of Biosensors)
Dersin Kredisi AKTS Kredisi
Ders Uygulaması, Saat/Hafta
(Course Implementation, Hours/Week)
(Local Credits) (ECTS Credits)
Ders (Theoretical) [X ] Uygulama (Tutorial) [ ]
3
Laboratuar (Laboratory) [ ]
Dersin Dili (Course Language)
İngilizce (English)
Dersin Önkoşulları (Course Prerequisites):
Dersi Veren Öğretim Elemanı(ları) (Lecturer(s)) : Prof. Dr. Mehmet Özsöz
Dersin İçeriği: Biyosensör teknolojisinin temel ilkeleri ve biyolojik sistemlere uygulamaları
Course Description: Basic principles of Biosensors and application to the biological systems.
Dersin Amacı ve Mesleki Eğitime Katkısı: Biyosensör teknolojisinin temel ilkelerini ve uygulamalarını
anlamak. Endüstride biyosensörlerin tasarımı ve uygulanmasını gerçekleştirmek
Course Objectives: Understanding the basic principles and application of biosensors. Design and application of
to biosensor industry.
Izmir Institute of Technology,
Biotechnology and Bioengineering Graduate Program, 35430 Urla, Izmir, TR,
Tel.902327506640 Fax.902327506645 E-mail.gunessertcan@iyte.edu.tr
İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
Biyoteknoloji ve Biyomühendislik Anabilim Dalı
Gülbahçe, Urla İzmir 35430
Dersin Öğrenim Çıktıları:
1-Biyosensör teknolojisinin temel ilkelerini anlamak.
2-Genetik ve kalıtsal hastalıkların daha kolay ve ucuz bir yöntemle algılanması.
3-Biyosensör teknolojisinde yer alan elektrokimyasal biyosensörlerin ilkelerini ve uygulamalarını anlamak…
4-Kütleye dayalı biyosensörlerin temel ilkelerini anlamak.
5- Nanotanciklere dayalı yeni yöntemlerin geliştirilmesi ve bunların tanı amaçlı olarak sağlık sorunlarını çözmesi.
6-Moleküler biyolojik yöntemlerin biyosensör teknolojisine uyarlamak.
7-Moleküler yöntemlerin biyosensör teknolojisi ile beraber kullanmak
Course Learning Outcomes:
1- Understanding of basic principles of biosensors
2- Detection of genetic and heritage diseases by cheaper and easier methods
3- In biosensor technology understanding of the principles of electrochemical biosensors
4- Understanding of the basic principles of pieozo based biosensors
5-Development of new methods based on nanoparticles and solve the health problems for the diagnostic purposes
6-.Adaptation of molecular biological methods to biosensor technology
7- To use molecular methods with biosensor technology.
Ders Kitabı (Textbook):
Diğer Kaynaklar (Other References):
İşlenen Konular (Course Plan)
Hafta(Week)
Konu(Topics)
1
Biyosensörlere genel bakış: tanımı ve sınıflandırılması (General View of biosensors,
definitions and clasification)
2
Enzim bazlı biyosensörler, glukoz biyosensörü (Enzyme based biosensors; glucose biosensor).
3
4
Kütleye bağlı biyosensörler, quartz kristal mikrodenge(Mass based biosensors ,Quartz crystal
microbalance)
Optik biyosensörler (Optic biosensors) (Surface plasmon resonance)
5
Elektrokimyasal DNA biyosensörleri ve Teranostik: Bireysel tanı ve tedavilerde öngörülen
yöntemler (Electrochemical DNA biosensors and Theranostics :the proposed process of
diagnostic therapy for individual patients)
6
Ara sınav ve sonuçların tartışılması (Midterm and discussion of the results)
Izmir Institute of Technology,
Biotechnology and Bioengineering Graduate Program, 35430 Urla, Izmir, TR,
Tel.902327506640 Fax.902327506645 E-mail.gunessertcan@iyte.edu.tr
İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
Biyoteknoloji ve Biyomühendislik Anabilim Dalı
Gülbahçe, Urla İzmir 35430
7
DNA, yapısı, özellikleri, iki zincir arasındaki bağlar (hidrojen bağları ve hidrofobik
etkileşimler), polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) (DNA; structure, properties, bond between
two strands (Hydrogen bonds and hydrophobic interaction), Polmer Chain Reaction (PCR))
8
Elektrokimyasal DNA biyosensörleri tasarımı; a) gen haritasının belirlenmesi b) PCR
bölgesinin belirlenmesi c) PCR bölgesinde hedef ve prob dizilerin belirlenmesi d) Sentetik
hedef ve prob dizilerinde hibridizasyonun optimize edilmesi e) Gerçek PCR dizileri ile çalışma
f)PCR örneklerinin denaturasyonu g)Asimetrik PCRın gerçek örneklere uygulanması (Design
of electrochemical DNA biosensors; a)Identification of gen map b) Determination of PCR
region c) Determination target and prob sequences of PCR region d) Optimization of
hybridization with the synthetic target and prob sequences e) Working with real PCR samples
f) Denaturation of PCR samples g) Application of asymmetric PCR for real samples)
9
Hibridizasyonu belirleme stratejileri a) işaretleme ile b) işaretlemesiz (Detection strategies of
hybridization event ; a)labeled b) label-free)
10
DNA hibridizasyonu için nükleik asit dizileri a)peptit nükleik asitler b)Inozin (Nucleic acid
sequences for the DNA hybridization a) Peptic nucleic acids b)Inozin)
11
Halkalı yapı rezonansına bağlı biyosensörler (Ring resonator based biosensors)
12
Yüzeye tutturma yöntemleri a) Elektrostatik b)Adsorpsiyon e)Kovalent (Surface attachment
methods a)electrostatic b) adsorption c) covalent)
13
İmmunokromatografik yöntemler (ICT) (Immunochromatographic methods (ICT))
14
Öğrenci grubu seminerleri: Derste öğrenilenler ışığında biosensör uygulamalarının tartışılması
(Student Group Seminars:Discussion of the biosensor application with the gained knowledge)
Ölçme ve Değerlendirme(Assessment Criteria)
Faaliyetler(Activities)
Adedi
(Quantity)
Yıl İçi Sınavları(Midterm Exams)
Değerlendirmedeki Katkısı, %
(Effects on Grading, %)
%25
Kısa Sınavlar(Quizzes)
4
%10
Ödevler(Homework)
3
%15
Projeler(Projects)
Laboratuar Uygulaması(Laboratory Work)
Diğer Uygulamalar(Other Activities)
Final Sınavı(Final Exam)
%50
Hazırlayan Kişiler (Prepared by): Prof. Dr. Mehmet Özsöz
Izmir Institute of Technology,
Biotechnology and Bioengineering Graduate Program, 35430 Urla, Izmir, TR,
Tel.902327506640 Fax.902327506645 E-mail.gunessertcan@iyte.edu.tr
İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
Biyoteknoloji ve Biyomühendislik Anabilim Dalı
Gülbahçe, Urla İzmir 35430
Tarih (Date)
16 Haziran 2011 (16 June 2011)
Izmir Institute of Technology,
Biotechnology and Bioengineering Graduate Program, 35430 Urla, Izmir, TR,
Tel.902327506640 Fax.902327506645 E-mail.gunessertcan@iyte.edu.tr