İSTANBUL MEDİPOL ÜNİVERSİTESİ MOLEKÜLER HÜCRE BİYOLOJİSİ VE BİYOKİMYA DERS ÇIKTI TABLOSU Dersin Kodu ve Adı BYKD112193, HSED112193, MKBD112193, SNBD112193, KAND112193 Ders Saati Cumartesi 10.00-14.00 Bölüm/Program Biyokimya Doktora Programı, Histoloji ve Embriyoloji Doktora Programı, Mikrobiyoloji Doktora Programı, Sinirbilim Doktora Programı, Klinik Anatomi Doktora Programı Dersin Dili Türkçe Dersin Türü Seçmeli Dersi Verenler Gürkan Öztürk, Turan Demircan, Bilal Kerman, Deniz Atasoy, Esra Cagavi, Nesrin Emekli, Türkan Yiğitbaşı, Süleyman Yıldırım, Yasemin Yozgat Dersle İlgili Görüşme Saatleri Cumartesi 14.00-16.00 Dersin Amacı Bu dersin amacı ökaryot ve prokaryot hücrenin yapısını ve metabolizmasını bir bütün halinde multidisipliner yaklaşımla öğretmektir. Öğrenme Çıktıları ve Alt Beceriler 1.Hücre.Mekaniği, Hücre iskeleti 2.Mitoz, Mayoz Bölünme 2.1. Hücre bölünmesini açıklar. 2.2. Somatik hücre bölünmesi olan Mitoz bölünmeyi tanımlar. 2.3. Gamet hücrelerinin oluşumunu sağlayan Mayoz bölünmeyi bilir. 2.4. Mitoz ve Mayoz bölünmenin moleküler mekanizmalarını bilir. 2.5. Genetik bilginin bir hücreden diğerine ve canlılığın devamında nasıl aktarıldığını kavrar. 3.Apopitoz,Nekroz,Yaşlanma 4.Sinyal İleti Mekanizmaları 5.Kök Hücre 5.1. Kök hücreyi tanımlar. 5.2. Kök hücre çeşitlerini açıklar. 5.3. Kök hücrelerin kendini yenileme ve farklılaşma mekanizmalarını açıklar. 5.4. Embriyonik ve erişkin kök hücrelerin klinik uygulama alanlarını bilir. 5.5. Uyarılmış pluripotent kök hücrelerin üretim ve moleküler mekanizmalarını kavrar. 6. Hücre Yenilenmesi ve Farklılaşması 6.1. Erişkin Kök hücrelerinin vücuttaki normal işlevlerini açıklar. 6.2.Uyarılmış pluripotent kök hücreleri kullanarak hastalık modellemesini kavrar. 7.Hücre Biyokimyası 7.1.Diyetle alınan besinlerin enterositlere girişini bilir. 7.2.Enterositlerde yeniden sentez yapıldığını kavrar. 7.3.Ekzojen ve endojen moleküllerden enerji üretimini kavrar. 7.4.Metabolitlerin detoksifikasyonunu (üre sentezi, H2O2 v.b) bilir. 7.5.Çeşitli reaksiyonlarda görev alacak moleküllerin sentezi, yıkılması ve metabolizmadaki rollerini kavrar. 8-Karbonhidratlar ve enerji metabolizması 8.1.Diyetle alınan karbonhidratların yapısal özelliklerini ve organizmadaki akıbetini bilir. 8.2. Havanın oksijeni ile şekerler arasındaki ilişkiyi kavrar. 8.3. Glukozun emilimini ve glukoz taşıyıcı proteinleri bilir. 8.4. Glikozdan enerji üretim yollarını özümler 8.5.Glukozun diğer moleküllere ve diğer moleküllerin glukoza dönüşüm yollarını bilir 8.6. Diyetle alınan glukoz ve kan şekeri ayarının nasıl regüle edildiğini kavrar. 8.7. Post translasyonal modifikasyonda mono ve oligosakkaritlerin önemini kavrar. 8.8. Enzimatik olmayan glikozillenmenin mekanizmasını ve önemini kavrar. 9.Nükleik Asitler 9.1. Purin ve pirimidin bazlarının denova sentez yollarını bu yollarda aktivasyon ve inhibisyon mekanizmalarını sorgular. 9.2.Purin ve pirimidin bazlarının normalde ve patolojik durumlarda yıkım yollarını bilir. 9.3.Genetik bilgiyi taşımada nükleik asidlere ait özellikleri kavrar. 10.Lipidler ve Enerji metabolizması 10.1.Lipitlerin yapısını ve özelliklerini tanımlar 10.2.Yağ asidlerinin özelliklerini ve önemini kavrar 10.3. Esansiyel yağ asitlerini ve kardiyak hastalıklardaki rolünü sorgular. 10.4.Lipoproteinlerin önemini tartışır 10.5.Apoproteinlerin lipit metabolizmasındaki önemini tartışır 10.6. Yağ asidleri ile esterleşen alkolleri kavrar 10.7. Lipit metabolizma bozukluklarının ve lipidlerin ateroskleroz gelişimindeki önemini sorgular 10.8.Enerji metabolizmasında lipidlerin önemini kavrar 11.Kanser Enerji metabolizmaları 11.1.Kanser hücre enerji metabolizmasının, normal hücreden farklı olduğu bilir 11.2.Warburg etkisini tartışır. 11.3.Kanser hücresinin glukozu fazla kullanmasındaki mekanizmaları sorgular. 11.4.Kanser hücresinin metabolizmasında Hipoksi ile indüklenebilir faktör–1 alfa (HIF–1α)’ın rolünü bilir. 12.İnsan Mikrobiyomu ve Taksonomi 12.1. Mikroorganizmaların kısa gelişim kronolojisi 12.2. İnsan mikrobiyotası 12.2. İnsan mikrobiyotası 12.3. Mikrobiyal taksonomik yöntemler 13.Prokaryot Hücre 13.1. Bakteri hücre fonksiyonel anatomisi ve yüzey elementleri 13.2. Bakteriyel metabolizma: anabolik/katabolik yolaklar 14.Prokaryot DNA replikasyonu 14.1. Bakteriyel genomlar ve yeni nesil DNA dizinleme yöntemleri 14.2. Bakteri DNA yapısı 14.3. Bakteriyel DNA replikasyonu, Mutasyonlar, gen ifadesi, Protein sentezi 14.4. Genetik transfer ve rekombinasyon Genel Yeterlilikler Eleştirel düşünen,sorgulayan,yaratıcı ve üretken olmaları istenir. 1.Hücre.Mekaniği,Hücre iskeleti 2.Mitoz, Mayoz Bölünme 3.Apopitoz,Nekroz,Yaşlanma 4.Sinyal İleti Mekanizmaları 5.Hücre Yenilenmesi ve Farklılaşması 6.Kök Hücre Haftalara Göre İşlenecek 7.Hücre Biyokimyası Konular 8.Karbonhidratlar ve enerji metabolizması 9.Nükleik Asitler 10.Lipidler ve Enerji metabolizması 11.Kanser Hücresinin Enerjiyi Kullanması 12.İnsan Mikrobiyomu ve Taksonomi 13.Prokaryot Hücre 14.Prokaryot DNA replikasyonu Öğretim ve Teknikleri Anlatma,gösterme,laboratuvar uygulamaları,örnek olay inceleme Dersin Koşulları Öğrenciler düzeli olarak derslere ve laboratuvar çalışmalarına katılmalı,tartışmalarda aktif olmalı ,ödevleri yapmalıdır. Ders Notu Kaynaklar Önerilen Kaynaklar Yiğitbaşı T, Emekli N. Biyokimya Laboratuarı, 2.Baskı. İstanbul Medipol Üniversitesi Yayınları, Akademi Basın Yayın, İstanbul 2013. Emekli N, Yiğitbaşı T.Klinik Biyokimya. İstanbul Medipol Üniv.Yayınları Dağıtım: Nobel Tıp Kitapevi, 2015. Emekli N. Temel ve Uygulamalı Biyokimya, 4.Baskı.Akademi Basın Yayın, İstanbul 2006. Marks Basic Medical Biochemistry A Clinical Approach.Lieberman M,Marks,AD. Lippiccott Williams Wilkins. 2010. Microbiology: An Introduction (11th Edition), Gerard J. Tortora Molecular Biology of THE CELL, 5th edition Bruce Alberts et al. Garland Science, UK Prof. Dr. Hasan Veysi Güneş "Moleküler Hücre Biyolojisi", İstanbul Kitabevi, 2. Basım, 2014. Alberts • Bray • Hopkin • Johnson • Lewis • Raff • Roberts • Walter "Essential Cell Biology" 4th Edition, Garland Science Publishers, 2013. Alberts, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter “Molecular Biology of the Cell” Sixth Edition, Garland Science Publishers, 2015.