İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD Prof. Dr. Filiz Aydın Mikrofilamanlar Mikrotubuller İntermediate (ara çaplı) filamanlar Hücre iskeletini oluşturan üç protein filaman Hücre İskeletinin Temel Elemanları MİKROFİLAMANLAR (7 nm) • Aktin (F ve G) MİKROTUBULLER • Tubulin (alfa, beta, gamma) (25 nm) •Keratinler •Nörofilaminler •Vimentin ARA FİLAMANLAR (IF) •Desmin (10nm) •GFAP •Laminler •Nestin •Periferin İntermediate Filamanlar Protein yapılı, sert ve dayanıklı filaman yapısıdır Tüm hücrelerde bulunurlar Hücrelerin birbirleri ile ve hücre matriksi ile ilişki kurarak destek sağlarlar. Intermediate Filamentler Epitel hücreler, kas hücreleri ve sinir aksonlarında bol miktarda bulunur Sitoplazmada ve çekirdek zarında bulunur Heterojen bir grup molekülden meydana gelir Yüksek gerilim gücüne sahiptir Polariteye sahip değillerdir ve nükleotit bağlamazlar Hücre transportuna katılmaz Tüm ökaryotlarda bulunmazlar (Bitki- yok!) -helikal domain Amino termal uç karboksi termainal uç Keratinler Vimentin Nörofilaman proteinleri Nüklear laminler İntermediate filamanlar; *baş (amino uç) *kuyruk (karboksil uç) *gövde (orta bölge)’den oluşur Intermediate Filamanlar İnsanlarda 70 değişik gen tarafından kodlanmaktadır. Alfa-helikal gövde kısmı yaklaşık olarak 310 aa. rezidüsünden ibarettir. C ve N ucundaki non-helikal kısımları farklı yapı ve özellik gösterir. Intermediate Filamanlar Ara çaplı filamanlar daha stabil yapıda ve daha az dinamik özelliktedirler. Diğer filaman yapılarına göre daha yavaş toplanır ve dağılırlar Baş domainin fosforilasyonu in vivo şartlarda Ara çaplı filamanların depolimerizasyonuna neden olur Ara çaplı proteinler toplanması hem yan yana hemde uc uca eklenmeler ile gerçekleşir Bu filamanların organizasyonu çeşitli IFAP (intermediate filaments associated proteins) aracılığı ile sağlanır Polimerizasyon/depolimerizasyon mikrotubul ve mikrofilamanlardan farklıdır Polimerizasyon/depolimerizasyon mikrotubul ve mikrofilamanlardan farklıdır İki monomer sarmalleşerek Dimerleri İki Dimer bir araya gelerek Tetramerleri, İki Tetramer bir araya gelerek Protofibrilleri, Dört ayrı protofibril bir araya gelerek Silindir yapılı IF (ara çaplı filaman) Yapısını meydana getirir. Intermediate Filamentler Intermediate (Ara çaplı) filamanlar Mikrotubul ve mikroflamanlardan farklı olarak Hücreye hareketlilik kazandırmazlar IFAPs also crosslink intermediate filaments to the plasma and nuclear membranes, microtubules, and microfilaments Intermediate Filament Associated Proteins (IFAPs, green) connect Intermediate Filaments (blue) to microcubules (red). Hücrelerde bağlantı bölgelerinin yapılarına katılırlar İntermediate Filamentlerin Memelilerdeki Sınıfları IF protein Polipeptid sayısı Doku dağılımı Tip I Asetik keratinler ≥ 15 Tip II Bazik Keratinler ≥ 15 Epitel Çok sayıda alt tipi bulunmakta olup Sitoplazmik plaklar Epitel dezmozom ve hemidezmozom yapısına katılırlar Tip III Desmin Glial fibriller asetik proteinler Vimentin Periferin 1 1 1 1 Tip IV NF-L NF-M NF-H İnterneksin 1 1 1 1 nestin 1 Gelişen nöron ve kas hücrelerinde Tip V Lamin A Lamin B Lamin C 1 1 1 Gelişen sentral sinir sistemi Nöro-epitelyal kök hücreler Tüm hücreler(nüklear laminler) İskelet kası,kalp kası ve düz kas Glial hücreler ve astrositler Çeşitli mezankimal hücreler Nöronlar Akson ve dentritlerde Medulla spinalis, optik sinirlerde Nüklear laminler Diğer Ara çaplı filaman yapılarından farklıdır: Merkezi bölge uzun Nüklear lokalizasyon sinyaline sahip İki yönlü bir tabaka şeklinde düzenlenir Dinamik bir yapıya sahip Ara çaplı filaman (IF) yapısının önemi? Hastalıkla ilişkisi; Lamin-A gen mutasyonu Emery-Dreifuss musküler distrofisi Dilate kardiyomyopatiler Progeria Lamin a ve emerin mutasyonları iskelet ve kas hücreleri kadar yağ, kemik ve nöronal dokuyuda etkiler (laminopati) Epidermis derinin en dıştaki tabakasıdır. Esas olarak "Keratinosit" adı verilen hücrelerden oluşur. Epidermis bullosa simplex. Mekanik dirence karşı hücreler birbirleri ile ilişkilerini ve bağlantılarını korur,doku bütünlüğü sağlanır normal Genlerde meydana gelen mutasyon sonucu keratin filamanların basınca karşı direnci düşer. Küçük bir sıkışma mutant hücrelerde kopmalara neden olur (epidermolysis bullosa simplex). Etkilenen doku su toplar. mutant Hücre iskeletine katılan proteinlerde meydana gelen mutasyonlar Hastalıklara neden olabilir Hastalık tanısının konmasında yardımcı olabilir Tedavi amaçlı olarak fonksiyonel özelliklerinden faydalanılabilinir. IF proteinleri Teşhis Sitokeratinler Epitalyal orjinli farklılaşmamış tümörler, karsinomlar adenokarsinomlar Glial fibriller asitik proteinler Bazı glial tümörler Vimentin Bağ dokusu tümörleri Desmin Kas tümörleri Hücre iskeletine bağlı hastalıklar Kardiyovasküler sendromlar Nörodejenaratif hastalıklar Pulmoner fibrozis Blisterli deri hastalıkları Kanser (invazyon)