23 Türkiye Doğal Alabalık (Salmo trutta L., 1758

advertisement
1. Ulusal Alabalık Sempozyumu 14-16 Ekim 2008 - ISPARTA
Türkiye Doğal Alabalık (Salmo trutta L., 1758) Populasyonlarında
Mikrosatelit DNA Varyasyonu
Serdal ARSLAN1, Fevzi BARDAKCI2
1
Cumhuriyet Üniversitesi, Fen Edebiyat Fak. Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, 58140, SİVAS
2
Adnan Menderes Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, AYDIN
sarslan@cumhuriyet.edu.tr
Bu çalışmada, Türkiye’deki 27 doğal alabalık populasyonunun mikrosatelit DNA varyasyonu
araştırılmıştır. Toplam beş mikrosatelit lokusu bu amaçla analiz edilmiştir. Çalışılan alabalık
populasyonlarında lokusların tümü polimorfik olup ortalama alel sayısı 7.4 olarak bulunmuştur.
İncelenen populasyonların önemli bir kısmının Hardy-Weinberg dengesinde olmadığı görülmüştür ve
araştırılan beş lokus için ortalama gözlenen heterozigotluk 0.254 olarak tespit edilmiştir. Mikrocoğrafik
alanda aynı havza ya da nehir sisteminde bulunan populasyonların da kendine özgü alelleri olduğu
saptanmıştır. Ayrıca, populasyonların ikişerli karşılaştırılması sonucunda elde edilen FST değerlerinin
çoğu istatistiksel olarak önemli bulunmuştur. Makrocoğrafik alanda farklı havza sisteminde bulunan
populasyonlar arasında % 45.7 oranında varyasyon tespit edilmiştir. Ayrıca daha önce mitokondri
DNA’sı analizleriyle ortaya konulan Türkiye’deki alabalıklarının mitokondri soy hatları, mikrosatelit DNA
belirteçleri analizi ile de desteklenmiştir. Ancak mtDNA verilerine göre Tigris (TI) soy hattına ait olan
Çatak populasyonu, mikrosatelit DNA veri analizlerine göre Adriatic (AD) soy hattı içinde olan Fırat
Nehri’nin populasyonlarıyla birlikte kümelenmiştir. Mikrosatelit DNA ve mtDNA verileri, alabalıkların AD
mitokondri soy hattı ile TI mitokondri soy hattı arasında muhtemel ikincil temasların olduğuna işaret
etmektedir.
Anahtar kelimeler: salmo trutta, mikrosatelit dna, alabalık.
Microsatellite DNA Variation Native Brown trout (salmo trutta l., 1758)
Populations in Turkey
In the present study, microsatellite DNA variations were investigated in twenty seven brown trout
populations in Turkey. A total of five microsatellite loci were analyzed for this purpose. All the loci were
polymorphic and average number of alleles were 7.4 in the brown trout populations studied. Most of
the populations did not show in the Hardy-Weinberg equilibrium and average observed heterozygosity
were 0.254 for the five loci in question. It was found that even populations in a micro-geographic
region, same basin or river system, had unique alleles. In addition, most of the Fst values obtained by
the pairwise comparison of the populations were statistically significant. Populations from different
macrogeographic regions, different sea and river basins, 45.7 % genetic variation was determined.
Additionally, the mitochondrial DNA lineages of the brown trout in Turkey that have previously been
identified by the mitochondrial DNA analyses were supported by the analysis of the microsatellite DNA
markers. However, Çatak population which belongs to Tigris (TI) lineage was clustered together with
the Euphrates populations within the Adriatic (AD) lineage according to the data analysis of the
microsatellite DNA. Data of the both mitochondrial DNA and microsatellite DNA indicated the possible
secondary contacts between AD and TI lineages of the brown trout.
Keywords: salmo trutta, microsatellite dna, brown trout.
S.D.Ü. Eğirdir Su Ürünleri Fakültesi
23
Download