AKCİĞER KANSERLİ OLGULARDAN İİAB İLE ELDE EDİLEN ÖRNEKLERE DOP-PCR VE CGH UYGULANARAK DNA ARTIŞ VE AZALIŞLARININ ANALİZİ İbrahim KESER1, Gülay ÖZBİLİM2, Ahter D. TORAMAN1, Elif PEŞTERELİ2, Güven LÜLECİ1 Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı1, Patoloji Anabilim Dalı2, 07070, Antalya Kanser multifaktöriyel ve multistep bir etkileşim sonucu ortaya çıkmaktadır. Genetik yapıdaki değişiklikler, kanser oluşumunda en önemli rolü oynamaktadır. Kanserin genetik temelinin araştırılmasında sitogenetik, moleküler genetik ve moleküler sitogenetik yöntemler kullanılmaktadır. Bizde bu çalışmamızda, dünyada ve ülkemizde sık görülen akciğer kanserinin genetik temelini, akciğer kanseri tanısı konulan 15 hastadan ince iğne aspirasyon biyopsisi (İİAB) ile elde edilen örneklere DOP-PCR (Degenerated Oligonucleotide Primer-Polymerase Chain Reaction) ve CGH (Comparative Genomic Hybridization) kullanarak DNA artış ve azalışlarını araştırmayı amaçladık. CGH ile analiz edilen 15 hastadan tespit edilen DNA artışları; kromozom 18p (6/15), 12p (5/15), 11p (4/15) ve 3q (4/15) gözlenirken, azalışlar kromozom 19 (3/15) ve Y (4/14) olarak bulundu. Bunlardan başka değişik kromozomlarda DNA artış ve azalış bölgeleri tespit edilmiştir. Çalışmanın bulguları literatür ile uygunluk göstermekte, ayrıca bugüne kadar herhangi bir onkogen veya tümör süpresör genin tanımlanmadığı kromozomal artış (Xq26qter, 18q, 3q28-qter, 4p, 5p, 12q24.1-qter) ve azalış (4p15-pter, 4q34-q35, 19, Y) bölgeleri tanımlandı. Örnek sayısının az olmasına rağmen, bulgularımızın ameliyata gerek duymaksızın İİA biyopsi örneklerine CGH’in uygulanabilirliğini, akciğer kanserlerinin genetik temelinin araştırılmasında ve hastanın prognozunun takibinde önemli olduğunu ortaya koymaktadır. Anahtar Kelimeler: Akciğer kanseri, İİA Biyopsisi, CGH, DOP-PCR, DNA artışı ve azalışı, Onkogen, Tümör baskılayıcı gen ANALYSIS OF DNA GAINS AND LOSSES IN LUNG CANCER SAMPLES OBTAINED WITH FNAB USING CGH İbrahim KESER1, GülayÖZBİLİM2, Ahter D.Toraman1, Elif PEŞTERELİ2, Güven LÜLECİ1 Departments of Medical Biology and Genetics1 and Pathology2, Faculty of Medicine, Akdeniz University, TR-07070, Antalya/TURKEY Cancer is a multifactorial and multistep process. In this process, the changes in the genetic structure play an important role in progression and transformation of cancer. Cytogenetic, molecular cytogenetic, and molecular cytogenetic methods are used to investigate the genetic base of cancer. In this study, we aimed to identify the DNA gains and losses in 15 lung cancer samples obtained with FNAB (fine needle aspiration biopsy) using CGH (comparative genomic hybridization) and DOP-PCR (degenerated oligonucleotide primer-polymerase chain reaction). The DNA gains were found at chromosomes 18p (6/15 cases), 12p (5/15), 11p (4/15), 3q (4/15), and the DNA losses were found as whole chromosomes 19 (3/15) and Y (4/14). In addition, DNA gains and losses were identified in different loci of different chromosomes. As result, novel sites for candidate oncogene(s) or tumor suppressor gene(s) were found the gains of chromosomes Xq26-qter, 18q, 3q28-qter,4p,5p, 12q24.1-qter, and the losses of chromosomes 4p15-pter, 4q34-q35, 19 and Y. Although we have a few cases, our findings suggested that CGH, DOP-PCR, and FNAB techniques can apply without require an operation in an investigation, classification, of the genetic base and progression of the lung cancer. Key Words: Lung cancer, FNAB, CGH, DOP-PCR, DNA gain and loss, oncogene, tumor suppressor gene