Modern biyoloji, çalışmam materyali

 16. . Aşağıdaki şekilde
bir genin başlangıcını içeren bir DNA parçası
verilmiştir.
3- GGCATACTTCAGTCAAGAGACATAG -5
5- CCGTATGAAGTCAGTTCTCTGTATC -3
A.Eğer bir RNA polimeraz enzimi geni soldan sağa doğru
transkripsiyona uğratıyorsa hangi zincir kalıp görevi
görür?
B. . Üretilen mRNA dizisini yazınız (RNA molekülünün 5
ve 3 uçlarını etiketlemeye dikkat edin)?
C. Oluşacak peptidin (Protein) amino asit dizisini yazınız?
B. Aşağıdaki mutasyonlardan hangisi proteinin yapısı
üzerinde en fazla etkiye sahip olacaktır açıklayınız.
 18. Bir timin dimmerini nükleotid eksizyon tamiri ile
onarmak için hangi enzimler gereklidir?
a. Eksonükleaz, DNA polimeraz III, RNA primaz
b. Helikaz, DNA polimeraz I, DNA ligaz
c. DNA ligazı, nükleaz, helikaz
d. DNA polimeraz I, DNA polimeraz III, DNA ligaz
e.Endonükleaz, DNA polimeraz I, DNA ligaz
 DNA polimeraz III'ün işlevi nedir?
a. Çoğaltma sırasında DNA sarmalını çözmek için
b. DNA iplikçiklerinin kırık uçlarını birbirine sızdırmak için
c. Büyüyen bir DNA zincirinin sonuna nükleotidler eklemek
d. Hasar gören DNA moleküllerini indirgemek için
e. Replikasyondan sonra iki DNA zincirine (bir yeni ve bir yaşlı)
katılmak
 Replikasyon sırasında aşağıdakilerden hangisi DNA
iplikçiklerini ayırır?
a. helikaz
b. DNA polimeraz III
c. ligaz
d. DNA polimeraz I
e. Primaz
 Bir nükleozomda DNA neyin etrafına sarılır
a.Polimeraz molekülleri.
b. ribozomlar.
c. histonlar.
d. Bir timin dimeri.
e. Uydu DNA'sı.
 DNA'nın kalıp ipliğindeki üçlü baz 5 'AGT 3' dir. Bu
diziden transkripsiyonla meydana gelen kodon
hangisidir?.
3 'UCA 5'.
b. 3 'UGA 5'.
c.5 'TCA 3'.
d.3'ACU 5 '.
e.UCA veya TCA, birinci tabandaki sallantıya bağlı olarak.
 Phe-leu-ile-val polipeptid dizisini kodlayan DNA
molekülünün kalıp ipliğindeki nükleotit dizisi hangisi
olabailir?
a. 5 'TTG-CTA-CAG-TAG 3'.
b. 3 'AAC-GAC-GUC-AUA 5'.
C.5 'AUG-CTG-CAG-TAT 3'.
D.3 'AAA-AAT-ATA-ACA 5'.
e. 3 'AAA-GAA-TAA-CAA 5'.
 Aşağıdaki mRNA kodon dizisine dayalı olarak hangi
amino asit dizisi oluşturulacaktır?
5 'AUG-UCU-UCG-UUA-UCC-UUG 3'
a. Met-Arg-Glu-Arg-Glu-Arg
b. araya-Glu-Arg-Arg-Gln-Leu
c. Met-Ser-Leu-Ser-Leu-Ser
d. Met-Ser-Ser-Leu-Ser-Leu
e. araya-Leu-Phe-Arg-Glu
 Bir peptit, NH2-phe-pro-lys-gly-phe-pro-COOH dizisine
sahiptir. DNA'nın kodlayan ipliğinde aşağıdaki dizilerden
hangisi bu peptiti kodlayabilir?
a. 3 'UUU-CCC-AAA-GGG-UUU-CCC
B.3 'AUG-AAA-GGG-TTT-CCC-AAA-GGG
C.5 'TTT-CCC-AAA-GGG-TTT-CCC
D.5 'GGG-AAA-TTT-AAA-CCC-ACT-GGG
E.5 'ACT-TAC-CAT-AAA-CAT-TAC-UGA
 Aşağıdaki mRNA dizisine bağlı olarak hangi peptid
dizisi oluşur?
5 '. . . UUUUCUUAUUGUCUU 3 '
a.leyi-sis-tyr-ser-phe
b.cyc-phe-tyr-cys-ley
c.phe-leu-ile-met-val
d.leyi-pro-asp-lys-gli
e.phe-ser-tyr-cys-ley
Şekilde molekülü üretmek için hangi enzim kullanıldı?
a.
ligaz
b.
transkriptaz
c.
Bir kısıtlama enzimi
d.
RNA polimeraz
e.
DNA polimeraz
Restriksiyon enzimlerinin enzimatik fonksiyonu nedir?
a. Uzayan DNA dizisine yeni nükleotidler eklemek
b. Replikasyon sırasında nükleotidlere katılmak
c.Transkripsiyon sırasında nükleotidlere katılmak
d.Nükleik asitleri belirli bölgelerden kesmek
e.Şeker fosfat omurgalarının kopmalarını onarmak için
a
Aşağıdaki şekilde olay yerinden elde edilen DNA baz dizisiyle
şüphelilerden elde edilen baz disizi verilmiştir? Buna göre
olay yerinden elde edilen DNA örneği hangi şüpheliye aittir.
Sanger sekanslama yöntemiyle dideoksinükleotitler kullanılarak elde edilen bir
örneğe ait reaksiyon karışımı jel elektroforezinde yürütüldükten sonra aşağıdaki
bantlar elde edilmiştir. Buna göre bu örneğin DNA baz dizisi yazınız. .
 Ökaryotik DNA'nın prokaryotik hücrelere klonlanması
için
A) Hem ekzon hem de intronlu DNA kullanılmalıdır
B) İntronsuz DNA eklenmelidir
C) Hem ekzon hem de intronlu RNA kullanılmalıdır
D) eksonları ökaryotik DNA'dan uzaklaştırılmalıdır
E) intronlar ökaryotik DNA'ya geri eklenmelidir
 Ökaryotik DNA'nın prokaryotik hücrelere klonlanması
sürecinde, ters transkriptazın rolü
A) olgun mRNA'dan çift sarmallı ökaryotik cDNA yapmak
B) öncü mRNA'dan olgun mRNA yapmak
C)Ökaryotik DNA'dan bakteri DNA'sı yapmak
D) İntronlu çift sarmallı DNA’yı geri eklemek
E) DNA'dan mRNA yapmak
cDNA ile ilgili hangisi doğrudur?
A) Hem intronlar hem de eksonlar ile birlikte prokaryotlara
klonlanabilen DNA
B) Prokaryotlara klonlanabilen sadece intronlu DNA
C) prokaryotlara klonlanabilen sadece eksonları olan
ökaryotik DNA
D) öncül mRNA yapmak için kullanılır
E) Replikasyonda görev alır
 Insersiyonel inaktivasyon (Yabancı DNA’nın plazmite
eklenmesiyle inaktivasyon) sonucunda hangisi gözlenir.
A) yabancı DNA eklenirse, beta galaktosidaz markeri inaktive
edilir ve beyaz koloniler oluşur.
B) yabancı DNA eklenirse, beta galaktosidaz markeri inaktive
olur ve mavi koloniler oluşur.
C) yabancı DNA eklenirse, beta galaktosidaz markeri aktive
edilir ve beyaz koloniler oluşur
D) yabancı DNA eklenirse, beta galaktosidaz markeri
etkinleştirilir ve mavi koloniler oluşur
E) X gal maddesi maviye dönüştürülür ve mavi koloniler
oluşur.
 Eğer konukçu hücreler ampisiline duyarlıysa ve ampisilin
içeren bir ortama ekildiklerinde
A) sadece ampisiline dirençli vektörü almamış hücreler
büyüyebilir
B) sadece ampisiline dirençli vektörü alan hücreler
büyüyebilir
C) tüm hücreler büyür
D) ampisilin inaktive edilir
Lac z gen markörü ile ilgili hangisi doğrudur?
A) β galaktosidazı kodlar, β galaktosidaz ise x-gal maddesini
parçalar
B) β galaktosidazı kodlar, β galaktosidaz ise x-gal'i
parçalanmaya dirençli hale getirir.
C) ampisilin direncini kodlar
D) beyaz koloniler oluşumuyla ilgili kodlama yapar
E) Yukardakilerin hepsi de doğrudur
 Geleneksel DNA parmak izi işleminde, toplanan DNA
hangisiyle küçük parçalar haline getirilir.
A) prob molekülleri.
B) kesim enzimleri.
C) jel elektroforezi.
D) denatürasyon.
E) melezleme.
Kesim enzimiyle ortaya çıkan binlerce farklı boyuttaki DNA
parçası, hangisiyle ayırdedilir?
A) prob molekülleri.
B) kısıtlama enzimleri.
C) jel elektroforezi.
D) denatürasyon.
E) melezleme.
PCR reaksiyon tüpünde hangisi yer almaz?
A) primer
B) DNA ligaz
C) DNA polimeraz.
D) ilgi DNA
E) deoksiribonükleotitler.
PCR esnasında hangi primer amplifiye (çoğaltılacak) edilecek
dizinin merkezine doğru 3' ucu olan DNA'ya bağlanır?
A) sadece ileriye yönelik primer
B) sadece ters primer
C) hem ileri hem de ters primerler
D) ileri ve ters primerlerden sadece birisi
E) ne ileri ne de ters primer bağlanır
Aşağıda, tek bir PCR döngüsü sırasında meydana gelen
olaylar hangi sırayla gerçekleşir?
1. DNA nükleotidlerinin Taq polimeraz ile eklenmesi
2. Primerler ve hedef DNA arasında tamamlayıcı baz
eşleştirme
3. Hedef DNA ipliklerinin ısı ile ayrılması (Denaturasyon)
A) 1, 2, 3
B) 2, 1, 3
C) 2, 3, l
D) 3, 2, 1
E) 3, 1, 2
Sanger dizilişini gerçekleştirmek için aşağıdakilerden hangisi
gereklidir?
A) tek sicimli DNA
B) DNA polimeraz
C) dört deoksiribonükleotid A, T, C, G
D) dideoksinükleotitler
D) Yukarıdakilerin hepsi
Tüp içine bir dideoksiribonükleotid eklendiğinde
A) replikasyon devam eder
B) ipliğin kopyalanması durur
C) ipliğin replikasyonu etkilenmez
D) ipliğin replikasyonu hızlanır
E) Dideoksinükleotitlere yeni nükleotitler bağlanabilir
gen klonlama sırasında uygulanan aşağıdaki olaylar sırasıyla
hangisinde belirtilmiştir?
1 = Bakteriyal plasmid’e gen ekleme
2 = İstenen geni içeren organizmadan DNA izolasyonu
3 = Klonlanmış genin bakteri hücrelerine dahil edilmesi
4 = Restriksiyon enzimiyle DNA’nın parçalara ayrılması
A) 1, 2, 3, 4
B) 2, 1, 4, 3
C) 2, 3, 4, 1
D) 2, 4, 1, 3
E) 2, 4, 3, 1
AGC kodonunun AGA'ya değiştirilmesi bir ____
mutasyonudur.
A) missense
B) nonsense
C) frameshift
D) deletion
E) Translokasyon
. Aşağıdaki DNA moleküllerinden hangisi en dayanıklıdır?
a)
CTGCATAC
b) GAAATTTC
GACGTATG
CTTTAAAG
c) AGTCGAAT
d) GCGTGCAC
TCAGCTTA
CGCACGTG
e) GGATCCTG
CCTAGGAC

Aşağıdaki şekilde DNA çift sarmalının kalıp ipliğinden transkripsiyonla
meydana
gelen bir m-RNA ve translasyonla meydana gelen bir protein molekülünün sentezi
verilmiştir. Buna göre protein molekülündeki amino asit dizisinden yola çıkarak mRNA ve DNA’nın kalıp ipliğinin nükleotid dizilerini yazınız (Bu sorunun çözümü için
verilen amino asit tablosuundan yararlanınız.) (6 PUAN).
AMİNO ASİT TABLOSU

Aşağıdaki şekilde I nolu DNA dizisinden oluşan m-RNA sentezini görmektesiniz.
Şekil II ve III’de ise sırasıyla yer değiştirme ve baz silinmesi şeklinde 2 mutasyon
görülmektedir. Buna göre
a) I nolu DNA dan sentezlenen proteinin amino asit dizisini
b) II nolu DNA dan sentezlenen proteinin amino asit dizisini
c) III nolu DNA dan sentezlenen proteinin amino asit dizisini
Şekillerin altındaki kutlara yazınız (Bu sorunun çözümü için verilen amino asit
tablosundan yararlanınız) (6 PUAN).