Tıbbi Biyoloji TBG 1-2: Tıbbi Biyolojiye giriş ve canlılık kavramı Prof. Dr. Oğuzhan Doğanlar 2016 • Büyüme ve gelişme Üreme Uyarılabilme (İrritabilite): Hareket Beslenme: Uyum (Adaptasyon): • Metabolizma Anabolizma: Katabolizma: • BİYOLOJİ: • TIBBİ BİYOLOJİ: • GENETİK: ÇEVRESEL CONTAMİNANTLAR VE İNSAN SAĞLIĞINA ETKİSİ DNA, RNA , PROTEİN ve ilgili mekanizmaları KANSER OLUŞUM VE TEDAVİSİ GENOMİKS PROTEOMİKS METABOLOMİKS 17. Y.Yılda Belçika’lı Dr. Van Helmont buğday taneleri ile bir arada bulunan kirli bir gömlekten, farelerin oluşturulmasına dair bir reçete bile hazırladı. Burada aktif öz insan terinde bulunuyordu ve bu nedenle kirli bir gömleğe ihtiyaç vardı. Francesco Redi BİYOGENEZ •Abiyogenez •Biyogenez: Evren ve dünyanın oluşumu Evren ve dünyanın oluşumu •Ototrof hipotezi OTOTROF •Hetetrof hipotezi • Stanley MILLER Harold UREY İlk Ototrof Kemosentez ile birlikte ortaya çıkmış: Ex. Archaebacteria Zor koşullarda yaşayabilen Besinini üretmek için CO2 kullanan. Yerküre Ay Mars Erken çağlarda,Dünya yoğun bir meteorid bombardımanına maruz kalmıştır. Bu olumsuz koşulların bu dönemde hayatın oluşumunu engellemiş olduğu düşünülmektedir. 4500-3800 milyon yıl önce Fosil bakteriler ?? Modern bakteri tepecikleri Meteor bombardımanının sonu, atmosfer gelişimi İlk canlı ilkel bakteri en.wikipedia.org/wiki/Image:Stromatolites_in_Sharkbay.jpg www.fas.org/irp/imint/docs/rst/Sect20/A12.html 3800-3500 milyon yıl önce Archaean extremophiles Demir oksit kayaçları Fotosentetik bakteri İlkel fotosentetik bakteriler oksijen üretmeye başladı ve atık olarak bu oksijen atmosfere karıştı http://www.globalchange.umich.edu/globalchange1/current/lectures/first_billion_years/bif.gif en.wikipedia.org/wiki/Image:Anabaena_sperica.jpg 3800-3500 milyon yıl önce •Endosimbiyotik teori www.genbilim.com Endosimbiyoz olayı ile bağlantılı olarak yapılan moleküler dizi analizleri mitokondrinin Agrobacterium, Rhizobium, riketsia türlerine dahil bir bakteriden türevlendiklerini göstermiştir. Bu bakterilerin günümüzde de ökaryotik hücre içinde yaşabilme özelliklerinin olması bu postulatı destekler niteliktedir. www.genbilim.com 1- Mitokondri ve kloroplastın prokaryotlardakine benzer (70S) ribozomlar içermelerini (Ökaryotlarda 80S), 2- Bu organellerin prokaryotlardakine benzer küçük dairesel bir DNA molekülü (plazmidler) içermelerini (Ökaryotlarda doğrusal, heliks yapılı DNA), DNA’yı saran “histon” proteinlerinin prokaryotlardaki gibi bulunmamasını (Ökaryot çekirdek DNAsında var), 4- İki organelde iki ya da daha fazla membrana sahiptir. En içte bulunan zar kompozisyonları hücredeki diğer zar yapılarıyla karşılaştırıldığında farklılık, prokaryot hücre zarıyla ise benzerlik göstermesini, 5- Mitokondri ve kloroplastlar prokaryotlardaki gibi “binary fission”a benzeyen bir süreçle bölünmelerini gerçekleştirmelerini (Ökaryotlarda mitoz), 6- Tilakoid, klorofil gibi iç yapıların siyanobakterilerin yapısına benzerliğini, 7- Transkripsiyonlarda başlangıç amino asitinin ökaryotlardaki gibi Metionin değil, prokaryotlardaki gibi Metioninin modifiye hali olan fMet aminoasiti olmasını, www.genbilim.com Acritarch • İki milyon yıl sonra ilk kompleks eukaryote hücre belirdi. • Bu hücreler enerji fabrikaları olan mitochondria taşıyordu • Eukaryote hücre oksijene ihtiyaç duyuyordu ve evrim bundan sonra bu şekilde gelişecekti. 1900 milyon yıl önce Grypania •Bundan yarım milyon yıl sonra çok hücreli hayat belirdi • Grypania helezonik bir tüptü 2 mm genişliğinde ve 5 cm uzunluğunda Çin, Hindistan ve Kuzey Amerika 1400 milyon yıl önce Kırmızı algae en.wikipedia.org/wiki/Image:Sexual_cycle.svg 1200 myö, kırmızı alg seksüel çoğalmaya evrimleşti 1200 milyon yıl önce Milattan 630 myö, bitki, hayvan ve fungi benzerleri oluştu Ediacara hızla dünya yüzeyine yayıldı 630-542 milyon yıl önce Eurypterid • 500 myö deniz canlıları Beslenme veya çiftleşme İçin karayı geçici olarak ziyaret etmeye başlarlar İlk ayak benzeri taşıyıcılar oluşur 500 milyon yıl önce Ciğerotları Kurtçuklar ve bazı bitkiler koloni oluşturmaya başlar, 460 myö 460 milyon yıl önce Fosil millipedes Fosil dışkı içeren bitkiler Bitkiler üzerindeki, Dışkı artıkları 420 myö 420 milyon yıl önce 380 milyon yıl önce gövde yaprak ve tohum 380-370 milyon yıl önce • Ormanlarla aynı zamanda Panderichthys • balıklara benzer, ayağımsı çıkıntıları olan canlılar Lchthyostega 380-365 milyon yıl önce Hylonomus lyelli Karada yumurta Bones found in Canada show that reptile evolved, 315 mya 315 milyon yıl önce % species extinct Yokoluş yoğunluğu Hayat neredeyse tamamen yok olur. Bu büyük yokoluş 251 myö Dev dalgalar ile gerçekleşir ve “Big Five” Büyük beş kitlesel yokoluş adını alır 251.4 milyon yıl önce yaklaşık 220 myö, yokoluştan kısa bir süre sonra dinazorlar belirir. Bu leptiller sonraki150 myö dünyanın dominant türüdür! 220-65 milyon yıl önce upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d6/SArchaeopteryxBerlin2.jpg www.dinohunters.com/History/Microraptor.htm Microraptor Küçük kanatlı Bir dinazor Archaeopteryx Bilinen ilk kuş türü 155 milyon yıl önce • Memeliler dinazorlar ile aynı Zamanda evrildi. Ancak kısıtlı Bir yaşam alanı buldu. • Bir çoğu küçüktü nocturnal ve böcek yiyerek besleniyordu. Buda memelilerin neden sıcak kanlı olduğuna bir kanıt oldu. 220 milyon yıl önce Ölüm (kader) krateri Quartz şok dalgası 65 myö civarında jeolojik kanıtlar dünyaya 10 km çapında bir Meteorun çarptığını göstermektedir. Bu dinazorların sonu olmuştur. 65 milyon yıl önce Neanderthal en.wikipedia.org/wiki/Image:Neanderthal_2D.jpg Mağara sanatı en.wikipedia.org/wiki/Image:Lascaux2.jpg 2 myö, insan belirdi. Önce ateşe hükmetmeyi öğrendi, sosyalleşti, Doğayı yönetmeyi öğrendi ve dünya üzerindeki en güçlü tür oldu 2 milyon yıl önce Bugün Adineta vaga Evidence for extensive horizontal gene transfer from the draft genome of a tardigrade Thomas C. Boothbya,1, Jennifer R. Tenlena,2, Frank W. Smitha, Jeremy R. Wanga,b, Kiera A. Patanellaa, Erin OsborneNishimuraa, Sophia C. Tintoria, Qing Lic, Corbin D. Jonesa, Mark Yandellc, David N. Messinad, Jarret Glasscockd, and Bob Goldsteina