Teknoloji BlueGnome’un teknoloji platformu, kopya sayısı analizi için mikrodizilerin üretimi, kullanılması ve analizi çevresindeki birden fazla yeniliği bir araya getirir. Teknoloji, doğası itibari ile üretim süreçlerinden protokol gelişimlerine ve istatistiksel algoritmalara kadar büyük çeşitlilik gösterirken, amacı daima aşağıdakileri sağlamaktır: Kopya sayısı ölçümlerinin, uygulamanız için doğru çözünürlükte açık ve sağlam ölçümler. MaviGenom, gereksinimlerinizi karşılamak için patentli baskı teknolojisi ile üretilmiş duyarlı BAC dizileri, özgün prob tasarımına sahip yüksek çözünürlüklü oligo dizileri ve mozaikleme yolu FISH probları sunar. Yüksek hacimli bir laboratuarda kullanım kolaylığı. MaviGenom, sonuçları normal bir sitogenetik laboratuarında açık ve hızlı bir şekilde vermek için sağlam protokoller geliştirmiştir (24-48 saat). Uygulamaya özgü sarf malzemeleri takımı optimal performans ve kolaylık için tedarik edilir. Hızlı ve bilgilendirilmiş analiz. İleri yazılım tüm MaviGenom çözümlerinin tam merkezinde bulunur ve numune/veri yönetimi, dizi analizi, kromozom ideaogramlarında görselleştirme ve detaylı raporlama ile Kalite Kontrolü denetimi fonksiyonelliğini kombine eder. Özgün istatistiksel algoritmalar ses seviyesini düşürür ve bölge aramasını geliştirir. MaviGenom’un patentli teknik yenilikleri, sarf malzemeler veya yazılım üzerinden mikrodizi kopya sayısı platformunu bir bütün olarak geliştirmeye yöneliktir. Bu teknik yenilikleri tamamlayan MaviGenom, laboratuarların mikrodizi çözümlerinden mümkün olanın en fazlasını elde edebilmeleri için bilgilendirilmiş ve duyarlı müşteri hizmetleri sunar. CytoChip Oligo dizisi, her bir araştırma için ideal çözünürlüğü sağlamak amacıyla tümü ISCA uyumlu dört formatta (2x105K, 4x44K, 4x180K ve 8x60K) mevcuttur, tüm formatlar şunları sağlar: Yapısal tasarım. Her bir CytoChip Oligo dizisi, alttelomerler ve perisentromerler dahil olmak üzere genom genişliğinde kapsama ve bir yapısal hastalık odaklı tasarım sunar. 2x105K dizi, omurgada 100 Kb’lik dengesizlikleri tespit eder ve 137 OMIM hastalık alanında 20 probluk mozaiklemeye sahiptir ve böylece kritik bölgelerdeki gen içeriğinin eksiksiz raporlamasını sağlar. CytoChip ISCA 4x44K, 8x60K ve 4x180K tasarımları sırasıyla 75 Kb, 60Kb ve 20 Kb’lik ortalama omurga probu aralıklarına sahiptir. Otomatikleştirilmiş Analiz. Tek bir tıklama ile taranmış TIFF görüntülerinden ISCN uyumlu raporlara birden fazla numunenin tamamen otomatik analizi ve raporlanması. İleri istatistiksel algoritmalar sesi azaltır ve kopya sayısı dengesizliklerinin bölgelerini aramayı otomatikleştirir. DecisionTrack görselleştirmesi dengesizliklerin gen içeriği, KSV frekansı ve veritabanında bulunan tüm diğer numuneler ile birlikte görüntülenmesini sağlar. BlueFuse Multi yazılımı operatör hatalarını ortadan kaldırır ve bilgilendirici sonuçların istenen çözünürlükte herhangi bir uzman eğitimi ihtiyacı olmadan laboratuar personeli tarafından dakikalar içerisinde elde edilmesine imkan tanır. Kapsamlı veri yönetimi. BlueFuse Multi dizi sonuçlarını ve numuneler ve protokoller ile ilgili tüm bilgileri laboratuar içerisinde yerel olarak yönetilen tek bir güvenli SQL veritabanında saklar. Kapsamlı sorgulamalar tüm numunelerin sonuçlarının konumunun hızlı bir şekilde belirlenmesini, DecisionTrack’te görüntülenmesini, karşılaştırılmasını ve rapor edilmesini sağlar. Araçlara tıklayarak online veritabanlarına ve genom tarayıcılarına doğrudan erişim sağlanabilir. KSV’lerin Belirlenmesi. CytoChip Oligo, MaviGenom’un DecisionTrack’te görüntülenen 1400’den fazla numunenin veritabanından harmanlanan KSV açıklamaları ile birlikte sağlanmaktadır. Bununla birlikte, daha güçlü olan, kopya sayısı dengesizliğinin olduğu yerleri ve bölgelerin sıklığını, amaca en uygun numune veri tabanına – kendinizin – dayanarak araştırabilme kabiliyetidir. Sonuçların FISH onayı. CytoChip Oligo, dengesizliklerin fiziksel konumlarının onaylanmasını sağlamak için 26,000’den fazla ön-etiketli BlueFish probuna sahip tam mozaikleme yolu kütüphanesi ile desteklenir. Bilgilendirilmiş destek. Eğitimli laboratuar personelinden detaylı yardım almak için MaviGenom’un destek hattını arayın. *ISCA (Uluslararası Standart Sitogenetik Dizi) Baldwin ve ark. Genetics in Medicine (Tıpta Genetik Bilimi), Haziran; 10(6):415-29 CytoChip Oligo sadece araştırma amaçlı kullanım içindir ve tanısal prosedürler amaçlı kullanımlar için değildir. Cancer CytoChip Cancer, uluslararası düzeyde kabul edilen bir kansere özgü tasarımı ile bir oligo dizisidir. Neredeyse 20,000 oligo probu kanserde öneme sahip olan genom bölgelerini kapsar; bunlara Sanger Cancer Gene Census’undan 423 gen ve 130’dan fazla kanserle ilişkili genomik bölge de dahildir. Hedeflenen tasarım, mevcut en iyi problar ile, bir eksona en az bir prob ve her bir gene en fazla 200 prob olmak üzere, seçilen genlerin her bir eksonunu kaplamayı ve geni yandan kuşatan her iki tarafta ek bir 15 Kb'ı kaplamayı amaçlamaktadır. Kanserle bağdaşık alanlar, bölgedeki mevcut en iyi problar ile eşit olarak kapsanmıştır. Geriye kalan problar, genler ve bölgeler arasındaki araları doldurmak için genom boyunca dağıtılmıştır. CytoChip Cancer popüler 4x180K formatında ve de yüksek hacimli talepler için artık 8x60K formatında mevcuttur. Parça numaraları şöyledir; 4081-1 - CytoChip Cancer 4x180K v1.0 pul dahil (16 dizi, 4 ünite) 4081-2 - CytoChip Cancer 8x60K v1.0 pul dahil (32 dizi, 4 ünite) Tüm CytoChip Cancer dizileri, tamamen otomatik bir şekilde yorumlanabilir veriler meydana getiren ve araştırılabilir tek bir veri tabanı oluşturan BlueFuse Multi yazılımı ile birlikte tedarik edilir. Analiz edilen sonuçlar, genleri ve diğer yararlı bilgileri görüntüleyen DecisionTracks ile incelenebilir. BlueFuse Multi’den alınan bu ekran görüntüsü, hematolojik kanserlerden dengesizlik bilgileri içeren müşteri izleri ile birlikte görüntülenen bir numune göstermektedir. Mevcut örnekte, akut miyeloid lösemi için tipik bir durum olan kromozom 7’nin uzun kolunda bir kayıp vardır (AML kayıp izi). Yapısal Düşük miktarlarda kötü kalite DNA içeren yapısal numuneleri incelemek için, karyotipleme, FISH ve qPCR’in bir birleşimi kullanılmaktadır. Bu tekniklerin faydası kesin olarak kanıtlanmış olsa da, bunlar inceleme kapsamına pratik bir sınır koyarlar, kültür oluşturmanın gerekli olduğu durumlarda gecikmelere neden olurlar ve kromozom morfolojisi kötü olduğunda yorumlaması zordur. CytoChip Focus Constitutional, bu kısıtlamaların üstesinden gelmek ve karyotiplemeyle karşılaştırılabilir bir fiyattan bu zorlayıcı numunelerin otomatik ve nesnel analizini yapmak için özgün arrayCGH teknolojisini kullanır. Doğrudan kandan, salyadan, amniyotik sıvıdan veya koryonik villuslardan çıkartılan DNA ile çalışarak, CytoChip Focus Constitutional aşağıdakileri sağlar: Kullanıcı tarafından ayarlanabilen, hastalık odaklı, tasarım. Kendisini kanıtlamış BAC teknolojisi, genom boyunca 1 Mb çözünürlüğe kadar ve ayrıca yapısal bozukluklarla bağlantılı 97 bölgede 100 Kb çözünürlük sağlar. Bu hastalık bölgelerinin bir alt kümesini incelemek veya genomu 1-10 Mb çözünürlüklerde taramak için özel tasarımlar oluşturulabilir. Daha az öznellik. Yüksek seviyede çoğaltma ve düzeltme, kültür edilmemiş hücrelerden alınan sadece 50 ng amplifiye edilmemiş DNA’nın genomik dengesizliğinin güvenli şekilde tahmin edilmesini sağlar. Sonuçlar açıktır, farklı operatör tarafından tekrarlanabilir ve yorumlaması kolaydır. Hızlı iş bitirme süreleri. 2 günlük bir protokol, zaman tüketici kültürleme olmadan hızlı sonuçlar verir, böylece laboratuarın iş akışı artarak daha hızlı incelemeler yapabilir. Daha yüksek iş hacmine sahip uygulamalar için protokoller tamamen otomatik hale getirilebilir. Mozaik saptama çerçevesi. Karmaşık kontroller, dikkatlice seçilmiş klonlar ve gelişmiş yazılım analizi, % 10’a kadar olan klonal hücre nüfuslarında geniş ölçekli yapısal değişikliklerin saptanmasını sağlar. Endüstri lideri yazılım. BlueFuse Multi, kullanımı kolay olan yazılım paketi sayesinde tamamen otomatik veri analizi, sonuçların depolanması ve sofistike DecisionTrack görselleştirmesi sağlar. Tuşa basarak yapılan analiz dengesizliklerin detaylı bir listesini çıkartır ve bunlar gen içeriğine ve KSV sıklığına göre incelenebilir. Tam bir denetleme izi sağlanmış olur. FISH izlemi. Each clone on the CytoChip Focus Constitutional üzerindeki her bir klon, karmaşık düzenlemelerin incelemesinde tam esneklik sağlamak için etiketlenmiş BlueFish olarak sipariş edilebilir. Hematoloji Hematolojik numunelerin sito-genetik özellikleri, G-bantı karyotipleme ve fluorescent in-situ hybridization (FISH)’in bir birleşimi yoluyla incelenir. Bu tekniklerin faydası kesin olarak kanıtlanmış olsa da, FISH incelemenin kapsamına pratik bir sınır koyar ve ayrıca hücre kültürü gerçekleştirme ihtiyacı sürece gecikmelerin ve değişkenlerin eklenmesine neden olur. CytoChip Focus hematoloji dizisi, tüm hücre nüfusunu, hematolojik habislerle bağlantılı olan kopya sayısı dengesizlikleri açısından incelemek için arrayCGH kullanarak bu kısıtlamaların üstesünden gelir. Doğrudan kemik iliğinden veya kandan alınan DNA üzerinde çalışarak, CytoChip Focus dizisi şunları sağlar: Hastalık odaklı tasarım. Bilinen hematolojik habislerle bağlantılı olan 50’den fazla bölgenin taranması, incelemenin başlangıcında en yüksek oranda ilgili bilginin edinilmesini sağlar. Omurganın yazılımla düzeltilmesi ve bilinen kopya sayısı poliformizlerinden (KSP) kaçınmak için klonların dikkatli şekilde seçilmesi, yalnızca güvenle yorumlanabilecek sonuçların dizi tarafından bildirilmesini sağlar. Mozaik hücre nüfuslarında, koya sayısı dengesizliğinin saptanması. Sofistike kontroller, yenilikçi çoğaltma ve gelişmiş matematik, Focus dizinin hücrelerin % 10 gibi az bir oranında bile anormallikleri bulmasını sağlar. Birincil habislerdeki dengesizlikler, tamamen karakterize edilirken, olası olarak henüz fenotipe katkıda bulunmayan ikincil habis hücreletin varlığı incelenir. Tamamen otomatik veri analizi ve DecisionTrack teknolojisi. Kopya sayısı varyasyonunu yorumlamak için kullanılan gelişmiş algoritmalar, dengesizliklerin detaylı bir listesini verir ve bunlar Mavigenom’un yenilikçi DecisionTrack teknolojisi kullanılarak gen içeriği ve KSV sıklığı açısından detaylı olarak incelenebilir. Hastalık araştırması için tam bir çözüm. İncelemelerin raporlanmasını geliştirmek için, numune bilgileri ve ilgili sonuçlar Mavigenom’un BlueFuse Multi veritabanında güvenle depolanabilir. Zaman içerisinde, yüksek çözünürlüklü, düzeltilmemiş veri havuzu, yeni hasta göstergelerinin ve klinik sonuçlarla ilgili değerli araştırmaları desteklemede kullanılabilir. Uygun maliyetli. Geliştirilmiş protokoller ve gelişmiş çoğaltma sayesinde, genom genişliğindeki bir tarama için dizi başına iki numune, numune başına bir hibridizasyon kullanılarak, güvenilir sonuçlar elde edilebilir (5 FISH probuna karşılık gelmektedir). ArrayCGH, karyotiplemede ve geleneksel CGH’de mümkün olandan daha yüksek çözünürlükte genomik kopya sayısı dengesizliğini incelemek için kullanılır. CytoChip’ler, yapısal genetik bozukluklarla bağlantılı olan kopya sayısı varyasyonu saptamasını geliştirmek için tasarlanmış yüksek kaliteli BAC mikro-dizileridir. CytoChip’ler, sito-genetikçilere daha fazla bilgi sağlamak için 20’den fazla ülkede 120’nin üzerinde kurumda kullanılmaktadır. Çalışmakta olan CytoChip örnekleri görmek için, buraya tıklayın. CytoChip V3, yeni performans standartları belirlemek için tasarlanmıştır. Daha fazla ilgili bilgi. Sab-telomerleri ortalama 250 Kb çözünürlükte inceleyin, mosaisizmi güvenilir şekilde saptayın ve ortalama 100 Kb çözünürlükte 110 bilinen genetik hastalığı inceleyin. Genom’un tamamını, polimorfizmi en aza indirgerken pathojenik varyantları saptamak için geliştirilmiş bir çözünürlük olan yarım megabase’de ekrana getirin. Daha kolay yorumlama. BlueFuse Multideki gelişmiş algoritmalar, DecisionTrack teknolojisi kullanılarak gen içeriği ve KSV sıklığı açısından kolaylıkla incelenebilecek dengesizliklerin detaylı bir listesini oluşturur. DecisionTrack, hangi dengesizliklerin potansiyel olarak patojenik ve hangilerinin muhtemelen zararsız olduğuna ilişkin hızlı, bilgili ve denetlemeli kararlar yapmaya olanak tanır. Daha sonra, ISCN’ye uygun raporlar, tek bir tıklamayla oluşturulabilir. Basit doğrulama. CytoChip’ler geniş bir doğrulamaya sahip Roswell Park Kanser Kurumunun BAC kütüphanesinden gelen klonlarla imal edilir, böylece tüm sonuçlar için tam bir “RP” sınıflandırması sağlanmış olur. Sonuçların fiziksel yerini doğrulamak ve ebeveyn numunelerini incelemek için CytoChip üzerindeki her bir klon etiketlenmiş FISH probu olarak sipariş edilebilir. Esnek tasarım. Her bir CytoChip üzerindeki iki hibridizasyon alanı, hacme, maliyete ve numune kalitesine bağlı olarak dye swap tasarımları veya her dizi için iki numune seçeneği sunar. Konusunda bilgili destek. Eğitimli laboratuar personelinden ayrıntılı yardım almak için Mavigenom’un destek hattını arayın. “17p’lik bir duplikasyon numunesini incelerken, var olan ticari dizimiz yalnızca 2 ardıl olmayan klon saptarken, CytoChip aynı bölgede 22 klonun çoğaltıldığını saptadı. Prob yoğunluğundaki bu artış, ve geliştirilmiş performans sonuçların hem güvenilirliğini hem de yorumlama kolaylığını son derece arttırdı.” Dr. Karen Swisshelm, Colorado Genetik Laboratuarı Direktörü “CytoChip’leri kullanmak ve yorumlamak çok kolay. Yüksek çözünürlükte kopya sayısı dengesizliğini incelemek için bunları rutin olarak kullanıyoruz.” Udo Koehler, Sitogenetik bölüm başı, Medizinisch Genetisches Zentrum Munich “CytoChip’ler yalnızca karyotiplemeyle elde edilebilenden daha fazla bilgiyi, daha hızlı şekilde elde edebiliyor.” Marcel Nelen, PhD, Klinik Moleküler Genetikçi, Tıbbi Genetik Bölümü, UMC Utrecht Pek çok bilim adamına göre hamile kalmada veya sürdürmede başarısızlığın temel faktör embriyodaki hücrelerin yanlış sayıda kromozom içermesidir, bu duruma anöploid denir. 24sure bilim adamlarının anöploid taramasını yapmasını ve bir yumurta ya da embriyoda doğru sayıda kromozom bulunduğunu doğrulamasını sağlayan ilk dizi teknolojisidir. Pek çok araştırmacı bunun tüp bebek tedavisi sırasında transfer edilen embriyonun şansını arttırarak, başarılı bir hamilelik sağlayacağına inanmaktadır. 24sure benzersizdir, çünkü moleküler seviyedeki kromozonların binlerce bağımsız ölçümünü yapmaktadır. Embriyonun veya sınırlı sayıdaki kromozonun bir mikroskop altında görsel olarak incelenmesine dayanan önceki tekniklere göre, bunun daha kesin ve net olduğuna inanılmaktadır. 24sure otomatikleştirilmiş ve nesneldir, bu da sonuçlara son derece güven duyulabilir anlamına gelir. 24sure ile bir tarama 12 saat gibi kısa bir sürede tamamlanabilir. 24sure ilk ve ikinci kutup küreciğinde, blastomer biyopsilerinde ve trofektoderm biyopsilerinde tarama yapmak için kullanılabilir. 24sure+’da sab-kromozal anöploid’in sınıflandırılmasını sağlamak için gelişmiş bir genomik taramaya sahiptir, örn. genellikle tekrarlayan düşük vakalarıyla ilişkili dengesiz translokasyonlar. 24sure’un canlı doğum oranı üzerindeki etkisi, devam etmekte olan çeşitli araştırmaların da konusu durumundadır. 24sure hakkında daha fazla bilgi için, lütfen ürün broşürünü indirin ve www.24suretest.com adresine göz atın. 24sure yalnıza araştırmalar içindir ve teşhis prosedürlerinde kullanılmaz. ArrayCGH, tüm genomdaki yerlerden kopya sayısı varyasyonunun (KSV’ler) çeşitli bölgeler belirleyebilen yüksek çözünürlüklü bir ekran sunar. Mevcut uygulama, tüm ilgili KSV’lerin FISH ile teyit edilmesi uygulamasıdır (florasan yerinde hibridizasyon). BlueFish Tilepath’ın sadece araştırma amaçlı probları tüm genoma yayılan kaliteli FISH probları sağlayarak bu gereksinimlerin karşılanmasını sağlar. Tüm genomun kapsanması. BlueFish Tilepath kütüphanesi 26,000’den fazla prob içerir; türünün en genişidir. BlueFish problarının yüksek dereceli yoğunluğu ilgili bölgede doğru probun mevcut olmasını sağlar. Standart. BlueFish probları Roswell Park Kanser Enstitüsü'nden alınan ticari bir lisans kapsamında sağlanır.Bilinen RP terminolojisine literatür ile herhangi bir uygulamaya yönelik en iyi probun kolaylıkla tanımlanmasını sağlayan belli başlı tüm genom tarayıcılarında yaygın olarak atıfta bulunulmaktadır. Online hizmet. Kapsamlı çevrimiçi sipariş olanakları klonların, RP terminolojisi, sitogenetik bant ve orta nokta konumuna göre seçilmelerini sağlar. SpectrumGreen™ or SpectrumOrange™ muadili olmak üzere etiket seçimi yapılır; bunun ardından gereken prob üretim için sunulur ve teslimat ise tipik olarak 14 gün içinde gerçekleşir. Daha kolay yorumlama. Doğrudan etiketleme ve basit protokoller, metafaz kromozomlarındaki KSV'lerin hızlı, hassas ve belirli bir şekilde doğrulanması için yüksek sinyal ve düşük artalan sağlar. Tüm BlueFish Tilepath probları, MaviGenom’un CytoChip’inde kullanılan sıkı kalite kontrolü ve üretim prosedürlerine tabi tutulur. Genomun, Tilepath problarında yansıtılacak olan önemli çapraz homoloji bölgeleri içerdiği bilinmektedir, bu durum prob seçiminde göz önüne alınmalıdır. BlueFish kalite kontrolü dokümantasyonunu indirmek için buraya tıklayın (oturum açma gerektirir). Sipariş bilgisi Açıklama Model no. BlueFish Tilepath probu 4142-1 BlueFish’i laboratuarınızda değerlendirmek amacıyla iki ücretsiz prob için lütfen bizimle iletişime geçin. BlueFish sadece araştırma amaçlı kullanım içindir ve tanısal prosedürler amaçlı kullanımlar için değildir.