- Free Documents

EPGENETK VE EPGENOM
quotEpigenetics is an emerging frontier of science that involves the study of changes in the
regulation of gene activity and expression that are not dependent on gene sequence.quot
National Institutes of Health Roadmap
Hastalklar ve kt alkanlklar babadan oula geebiliyor Hrriyet Mart,
Bir babann iledii gnahlar, dorudan sonraki nesillere de geiyor. Bir erkein gen yalarndaki
beslenme ve sigara alkanlklar, o kiinin olunun ve hatta torununun bile saln etkileyebiliyor.
Yeni yaplan bir aratrmaya gre kaltma bal bu etkiler, quotepigenetikquot de denilen, DNA
zerindeki nemli kimyasal deiikliklere baldr. Bu deiikliklerin halk sal zerindeki etkisi de ok byk
olabilir. rnein bugnk genlerin davranlar, ileriki yllarn sorunlarn oluturabilir.
University College Londonda genetik uzman olan Marcus Pembrey ve ekibi, erkek tarafndan
sala bal etkilerin bir sonraki nesile aktarldn iki ekilde kantladklarn belirtiyor. Bunlardan ilki,
ngilterede larda bebek sahibi aileler arasnda yaplan Avon aratrmasdr. Aratrmaya katlan
babalarn binden fazlas, ya o srada ya da gemite sigara tiryakisiydi. Bu erkeklerin de s,
sigaraya yandan nce, yani vcudun zellikle evreye bal strese ak olduu bir dnemde balamt.
Editorial
It Is Time for a Human Epigenome Project
Frank J. Rauscher, III Cancer Res . Full Text PDF
A Blueprint for a Human Epigenome Project The AACR Human Epigenome Workshop
Peter A. Jones and Robert Martienssen Cancer Res . Abstract Full Text PDF
Human Epigenome project launched February By Charlie McDermott Appeared in BioNews
The sequel to the Human Genome Project, the International Human Epigenome Consortium
IHEC, has arrived and may hold the key to treating intractable diseases such as cancer and
obesity. Recent studies mapping epigenetics chemical modifications of DNA that affect gene
expression have shown how important understanding the epigenome is for health and
disease. IHEC was launched in Paris last week, and has ambitious plans to map , reference
epigenomes within a decade. This will allow researchers to compare their findings with a
robust and trustworthy template. According to Peter Jones, University of Southern California,
US, speaking for IHEC in Paris, the project was also spurred on by a growing number of
publications on epigenetics, which he says is why researchers need to agree now on how to
standardise data.
Cover art Chromatin Iznik chini by Tayfun zelik
Epigenetics is a new peerreviewed journal available in print and online. This multidisciplinary
journal publishes original research articles and reviews covering the latest aspects of
epigenetic mechanisms and their regulation of diverse biological processes. The goal is to
foster communication and rapid exchange of information through timely publication of
important results using traditional as well as electronic formats.
We are proud to announce that as of August the DNA Methylation Society has changed its
name to the Epigenetics Society. We hope that the partnership with Landes Bioscience and
the new Epigenetics Society will be a successful one.
Department of Epigenetics, Division of Medical Genomics, Medical Research Institute
Laboratory of Plant Epigenetics
Department of Molecular Epigenetics
Kralovopolska Brno esk republika Department of Molecular Epigenetics, Institute of
Biophysics, AS CR
Head Ale Kovak
Scientific interests
Epigenetic regulation of plant transgene expression Genetics of allopolyploid nucleus
Evolution of satellite repeats
A new ambitious ECfunded research initiative on Epigenetics advancing towards systems
biology
DNA histonlar ve dier proteinlerle kromatini oluturur. Kromatin dinamik materyaldir ve
epigenetik bilgi tar. Bir organizmaki her hcre ayni genetik bilgiyi tar fakat farkl ynde geliimler
gsterir.
Epigenetik
Epigenetik DNA dizi deiimlerinin mutasyon dndaki faktrlerle oluan, gen anlatmndaki tm
deiikliklere verilen genel bir tanmlamadr. Epigenetik deiiklikler kaltsaldr fakat potansiyel
olarak geri dnebilir.
Epigenetik Sonu olarak Bir bireydeki tm hcreler ayni genetik bilgiyi tamalarna karn farkl
fenotipik yapdadrlar. Epigenetik deiimler farkl gen setlerinin anlatm ile kazanlrlar. Epigenetik
deiimler bir sonraki generasyonlara aktarlrlar. Bu durum DNA da kaltsal bir mutasyon
olmakszn gerekleir.
Epigenetik deiimlerde kimyasal etiketler DNA nukeotidleri/histonlarda yer alrlar. DNA
metilasyonu, asetilasyon, fosforilasyon vb.
Bu etiketler nereden gelirler
evre
D evre
hormonlar metabolizma cinsiyet yalanma
scaklk diet ilalar Kimyasallar evre kirlilii Ia maruz kalma vb.
Epigenetik Ayni genom, farkl fenotip, farkl gen anlatm profili
Epigenetik, u sorular cevaplamaya almaktadr
Fenotipi belirleyen nedir ok hcreli bir organizmada rnein bir karacier hcresi olan hepatosit ile
bir kas hcresi olan miyosit tamamen ayn genotipi paylarlarken, nasl olur da, apayr yine de
stabil gen ekspresyon profillerine ve de farkl ve bamsz hcre fonksiyonlarna sahip
olabilmektedirler
veya lenfositler gibi Fibroblastlar farkllamam hcreler, nasl hcre blnmesi yoluyla fenotiplerini
stabil bir ekilde korumaktadrlar
Nasl, bir farkllamam kk hcre, bazen blndnde iki yeni kk hcre verirken, bazen de bir kk hcre
ve de bir farkllam hcre verebilmektedir
Memelilerin, bizim de dahil olduumuz Eutheria infraclassisine ait dii bireylerinin her
hcresinde ayni nkleoplazma iinde bulunan ve de neredeyse zde DNA dizinlerine sahip iki X
kromozomundan biri inaktive edilmektedir. ki X kromozomundan hangisinin inaktive edilecei
nasl belirlenmektedir ve de inaktivasyon hangi yolla/yollarla gereklemektedir
Tamamen ayn genotipe sahip monozigotik ikizlerin, nasl olur da hastalklara genetik
yatknlklar farkl olur evremiz ve de yaam tarzmz bizi gen ekspresyonumuzu dolaysyla bizi ne
kadar, nasl etkiler Bu etkiler bizden sonraki generasyonlara da aktarlr m
Epigenetik
DNA modifikasyonlar sitozin metillenmeleri vb. Histon kromatin modifikasyonlar Kromatin
yapsna balanan oklu protein kompleksleri Genomik imprinting Paramutasyon RNA
interferens ve mikro RNAlar RNA aracl ile DNA metilasyonu Transgen sessizlemesi
Viruslerle gen sessizlemesi
Epigenetik Mekanizmalar
Dorudan etkileyenler
DNA Modifikasyonlar
. DNA Metilasyonu
. Nonkovalent DNA Modifikasyonlar . Transkripsiyon faktrleri ile feedforward otoreglasyon
Dolayl yoldan etkiyenler Posttranskripsyonel mekanizmalar mRNA Kromatin sessizletirmesi
Modifikasyonlar
Nonkovalent Modifikasyonlar
. Histon takaslar
. Histon katmlar . Kromatin tadilat . Nonkoding RNA ile etkileim . Dier ajanlarla etkileimler .
Uzunmesafe kromozom etkileimleri
Kovalent Modifikasyonlar Histon Modifikasyonlar . Asetilasyon . Metilasyon . Fosforilasyon
. bikitinasyon . Smoylasyon
Epigenetik DNA metilasyonlar Metilasyon bir DNA modifikasyonudur ve DNA ilevini deitirir.
mCler DNAda rastgele bir dalm gsterirler.
DNA y oluturan nukleotidler DNA
methyl sitosin mutasyonlar tayin edilemez ve tamir edilemezler.
DNA metilasyonu en iyi karakterize kimyasal modifikasyondur. Memelilerde, neredeyse tm
DNA metilasyonlar CpG dinkleotidlerinin sitozin rezidlerinde gerekleir. Genomun yksek
younluktaki CpG blgelerine CpG adacklar denir, ve de bu adacklarn DNA metilasyonu,
transkripsyonu basklama yoluyla gen sessizletirmesine neden olur.
metillenmi CpG adas
relaxed chromatin structure Kapal kromatin yaps of a nonimprinted gene
Metilasyon gametogenezde silinir ve embiryogenezde oluur. .
DNA demetilasyonu erken embiryo dnemi
s s s P Aphidikolin lk met. P P
M
M
M
P M s hcre
Mayer, W., Niveleau, A., Walter, J ., Fundele, R. amp Haaf, T. Nature ,
s hcre
DNA metilasyon paterninin kurulmas
Metilasyon patterni genomlarda her yeni generasyonda yeniden dzenlenir. Sense anlaml
metilasyon epigenetik bir olaydr. Tm metilasyon erken embiryogenezde oluur ve yeniden
dzenlenir.
Epigenetik deiimler birok Mendel Kurallarna uygun olmayan kaltm biimini aklar.
American Society for Microbiology
SAME GENOME, DIFFERENT EPIGENOME Variability in CpG methylation at the agouti
locus causes differences in coat color among genetically identical mice. Maternal nutrition
affects the phenotype of offspring by influencing the degree of CpG methylation at the agouti
locus. Reprinted with permission, Molec Cell Biol, Aug
DNA Metilasyonu
Nonagouti olarak da bilinen, fare agouti lokusu, cilt rengini etkilemektedir. En iyi allm DNA
metilasyon sistemidir.
/
DNA metilasyon zellikleri
Transkripsiyonal silencing Genomu transposizyondan koruma Genomik imprinting X
inaktivasyonu Doku spesifik gen anlatm
Histon kromatin modifikasyonlar
Protein ekspresyonu DNA tarafndan kromatinin eitli modifikasyonlar ile etkilenirNhiston
terminalindeasetilasyon, metilasyon, fosforilasyon , ubiquitilasyon ve Smoylasyon gibi.
Epigenetik kromatin regulasyonu
A. DNA dzeyinde . sitozin metilasyonu B. Histon modifikasyonu histon kodunda
....
Histon Histon Histon Histon
asetilasyonu metilasyonu fosforilasyonu ubiquitilasyonu
Histon asetilasyonu
Asetillenmi histonlar kromatini aarlar ve transkripsiyon oluur. Histonlar HAT histon asetilaz
ile asetillenirler.
Histon deasetilasyonu
Deasetillenmi histonlar skca paketlenirler ve transkripsiyon faktrlerine kapaldr. Histonlar
HDAC histon deasetilaz ile etkilenirler.
HAT Histon AseTilaz, HDAT Histon DeAseTilaz
Histon Asetilasyonu
HipoasetilasyonN kleozomlar aras gl balantlar
Histone deacetylase
Asetilasyonun fonksiyonu vardr
. Pozitif ykl lizin rezidlerini ntralize eder. Hiperasetilasyon sar . Histon ular ile yapsal
Nkleozomlar aras zayf balantlar proteinler arasndaki Histon ular DNAy snrlamaz ve
transkripsiyon balantlar destabilize eder. faktrleri DNAya balanabilir.
Histon fosforilasyonu H
. Histonlar mitoz srasnda fosforillenirler. . Histonlar signal iletiiminde de fosforilasyon
gsterirler.
Genomik imprinting
Baz genler sadece maternal genomda ve bazlar ise sadece paternal genomda gen anlatm
yaparlar. Genomic Imprinting quotParent specific expression or repression of genes or
chromosomes in offspring. Online Medical Dictionaryquot
Genomik imprinting
nsanda yaklak kadar gen imprinttir. rnein igf, h, igfr ve Angelman ve Prader Willi genleri.
syndromes
nsanda Mendel Kaltm
Hangi ebeveynden gelirse gelsin kaltm edeerdir.
nsan genomunda imprint gsteren blgeler
Maternal homologsol Paternal homologsa
imprinting
paternal allelin ekspresyonu
imprint genler metillenmitir ve kromatin yaps deimitir
CpG adas
imprint olmayan gende kromatin gevek yapdadr.
promotr metilasyonu nemlidir.
Metil CpG balayan proteinler
imprinted imprint blge ekspresyon Promotr
Neden imprint
ou imprint genler fetal byme ile ilikili
paternal ekspresyon fetal bymeyi arttrr. maternal ekspresyon fetal bymeyi azaltr.
Teori
Paternal ekspresyon
Fitnessi arttrr.
Maternal ekspresyon
Diinin oalma gcn arttrr.
mprinting ve insan hastalklar .Kromozom
Angelman sendromu
PraderWili sendromu
PraderWili sendromu PWS
/, Deiik anomaliler Orta dzeyde mental gerilik maternal imprint ve
paternal ekspresyon PWS.
Angelman syndrome AS
leri dzeyde mental gerilik eitli anomallikler /, paternal imprint ve
maternal ekspresyon AS ubiquitin ligase gene
mprint genler q
maternal imprint ve paternal ekspresyon PWS
IC
paternal imprint ve maternal ekspresyon AS ubiquitin ligase gene
UBE mutations on maternal gtangelman syndrome
Polycomb/Trithorax Sistemleri Polycomb ve Trithorax adl protein gruplar, evrim sresince
korunmu, ok nemli epigenetik efektrlerdir. Hem Polycomb hem de Trithorax protein gruplar,
kromatini yeniden ekillendirerek DNAnn gen transkripsiyonu iin ihtiya duyduu faktrlere
ulaabilirliini deitirirler. Bu ekilde, Polycomb protein grubu, kromatin dzeyinden ileyerek genleri
sessizletirirken, Trithorax grubu da sz konusu genleri aktifletirirler. Bu gruplar hem
Drosophilada hem de insanda allmtr ve de geliim asndan nemli genleri kontrol ettikleri ayrca
bu gen ekspresyon kalplarn, stabil bir ekilde ezberledikleri grlmtr.
Epigenetik kaltm
Tek gen
paternal veya maternalanlatm Imprinting Bir veya dier allel bir hcrede anlatm yapar fakat
asla ikisi birden yapmaz, random/mozaik monoallelik anlatm
Tm kromozom Xinaktivasyonu
mozaik
Xinaktivasyonu
XX
A , XY B , XX C , XXX
D , XXXX E XXXXX
Imprinting ve Xinaktivasyonu
Kodlama yapmayan uzun RNA Xist ekspresyonu Xinaktivasyon blgesinde Xinactive specific
transcript.
Paramutasyon Bir allelin ekspresyonunun dier allele ilgili olarak deimesi.
Bir paramutabl allel paramutagenik allele ilikiden sonra paramutant allel olur. Paramutant
allel sonraki generasyonlarda genelde stabildir.
Msrda paramutasyon
lokus Paramutable allel Paramutagenik allel Reversible Paramutant DNA metilasyon allel
paramutagenik u
r
Rr
Rsc
evet
evet
evet
b
BI
B
hayr
hayr
hayr
pl
plRh
plmah
evet
evet
hayr
Ribognome
Britten ve Davidson RNA karyotlarda hangi genler alacak hangileri almayacak karar verir.
miRNA, siRNA, rasiRNA oluumu farkl ilevleri ayni Sadece mi RNAlar insan genlerinin / n
dzenler. Bu RNA lar olmakszn kk hcreler kaybolur, beyin kaslar geliemez, iekler ekil alamaz,
ilevsel sentromerler oluamaz,......
Kk RNAlarn oluumu
zel endonukleaz Dicer ift iplikli RNA iin dsRNA ve siRNA balanan protein Argounate dsRNA,
siRNA nukleotidya dnebilir. da Petuniada kosupresyon ve .yzyln sonunda RNA silencing
RNAi gsterilmitir. miRNA nukleotidlik hairpinyaplardan oluur. te miRNA geni bulunmutur. si
insan, i insan virsleri kkenlidir ve tanesi . yzylda bulunmutur.
Ribognome The Big World of Small RNAs
Phillip D. Zamore and Benjamin Haley
RNAi ile Gen sessizletirilmesi nt RNAs
dsRNA ilem nt siRNAs hedef mRNA ykm
tanma
amplifikas yon
kopyalama ilem sekonder siRNAs
dal m
siRNAlar
siRNA yabanc DNA, transpozonlar ve tekrarlanan dizileri sessizletirir. Bitkilerde siRNAlar,
dsRNAnn Dicerbenzeri proteinler tarafndan ntlik uzunlukta kesilmesi ile oluur. siRNAlar AGO
proteinleri ile birleerek susturucu kompleksleri meydana getirir. Susturucu kompleksler RNA
hedefleri zerinde posttranskripsiyonel olarak alr onlar keser veya translasyona mdahale eder.
Bu kompleksler kromatin zerinde de DNA metilasyonu veya histon modifikasyonlar ile
sessizleme salar.
microRNAlar miRNAlar
miRNAlarn siRNAlardan olutuu dnlmektedir ve benzer ekilde retilip ilem grr. Bitkilerde olduka
korunmu az sayda miRNA ve korunmam ok sayda miRNA vardr. miRNAlar, spesifik MIR
genleri tarafndan kodlanr ancak transacting dzenleyici proteinler olduklar iin baka genlerle
alr. miRNAlar bitkilerde geliimsel ve fizyolojik olaylar dzenler.
Baz korunmu miRNAlarn hedefleri
miRNA gen ailesi
Hedef gen ailesi
SPL transkripsiyon faktrleri ARF transkripsiyon faktrleri HDZIPIII transkripsiyon faktrleri AP
transkripsiyon faktrleri ARF transkripsiyon faktrleri zerinde alan TAS tasiRNA Slfat tayc
Protein ubikitinasyonu
lev
Geliimsel zamanlama Oksin cevab, geliim
Geliim, polarite Geliimsel zamanlama, ieksel organ tayini Oksin cevab, geliim
Slfat alm Fosfat alm
Adapted from Willmann, M.R., and Poethig, R.S. Conservation and evolution of miRNA
regulatory programs in plant development. Curr. Opin. Plant Biol. ..
Small RNAlar genomun dzenlenme ve savunmasna katk salar ve baz ifti elemesi ile
sessizleme zgnln dzenler. siRNA hedefleri ok tekrarlara sahip heterokromatin, transpozonlar,
virsler veya dier patojenleri kapsar. miRNA ve siRNA hedeflerigeliimsel zamanlama veya
motifi etkileyen dzenleyici genler, besin dengesi ve stres cevabn ierir.
Epigenetik, gelime ve nuklear klonlama Reik
et al. . Science Rideout et al. . Science Donor hcre nukleusu
Blastosit
Yenidoan
Erikin
ES Hcreler
blastosit
blastosit
Fibroblast
. blastosit
. of blastosit
Verici kromatin oosit iinde yeniden modellenir.
Extensive Changes in the Human Epigenome During Development CMMT NEWS RELEASE
May th, In close partnership with the laboratory of Dr. Wendy Robinson at the Child amp
Family Research Institute, Dr. Michael Kobors team from the Centre for Molecular Medicine
and Therapeutics reports unexpected plasticity in the human epigenome in an article
published in the
Chromatin.
journal Epigenetics and
The human body contains more than different cell types that form distinct tissues such as
brain, kidney, and skin. Despite looking very different and performing very different functions,
all these cells contain roughly the same , genes. However, the pattern and extent by which
these genes are active differs from cell type to cell type, with these signatures being
controlled by persistent epigenetic mechanisms. The latter refers to regulation of the genome
that does not involve sequence changes to the DNA but rather chemical modifications of the
material that packages the almost m of cellular DNA into the tiny cell nucleus. In the present
study, Dr. Kobors laboratory measured DNA methylation, one key epigenetic mark, in various
tissues from fetuses, including those with chromosomal trisomy and trisomy . While the
presence of an extra chromosome only resulted in minor changes in the DNA methylation
pattern, these differed significantly between the tissues. Even more dramatic were the
changes when the team compared the fetal tissue DNA methylation pattern to stem cells or
corresponding adult tissues. Coauthor and lead team member from the Kobor laboratory,
Sarah Neumann, says quotThis work provides us with snapshots of DNA methylation as it
changes from the time that you comprise a few cells to when youre a full grown adult our
DNA code doesnt do that. According to Dr. Kobor, this now puts his team in an ideal position
to decipher the influences that lead to these agedependent changes, and how these might
be misregulated in diseases.
primordial germ hcreler Parentorigin imprint silinir mitoz spermatogonia / oogonia mitoz
Primer spermatosit / oosit mayoz Parentorigin imprint kurulur sperm / yumurta fertilizasyon Ar
demetilasyon Parentorigin zigot imprint kalkar mitoz DNA remetilasyon balar erken embiryo
mitoz germ hc. stem hc. Kromatin plastisitesi mitoz erikin somatik hcreler Kromatin snrlanr
Kanser epigenetii
Feinberg and Vogelstein DNA metilasyon kayb
Feinberg and Tycko,
Alternative CpG Metilasyon modelleri Kanser
Differences in DNA methylation patterns between normal cells and cancer cells. A typical
CpG island near the transcription start site of a sample gene is constituted by a CpGrich
region that in normal cells is mostly unmethylated , while the downstream areas within the
body of the gene and more contain a low frequency of CpG dinucleotides. Those
downstream CpGs are predominantly methylated . This DNA methylation pattern allows the
gene to be actively transcribed arrowtranscriptional start site. In a cancer cell the
promoterassociated CpG island is often hypermethylated and transcriptionally silenced arrow
with X, whereas the downstream CpG sites are hypomethylated. Numbered boxes represent
exons , and . Each lollipop indicates a CpG dinucleotide open circles represent unmethylated
cytosines, closed circles represent methylated cytosines. HAT, histone acetyltransferases A,
transcriptional activators TF, transcription factors DNMT, DNA methyltransferases MBP,
methylcytosinebinding proteins HDAC, histone deacetylases R, transcriptional repressors.
BRCA amp BRCA sporadik meme kanserinde rol oynar.
Promotr hipermetilasyonu BRCA
inaktivasyonunda nemli rol oynar. Kapal kromatin yaps oluumuna yol aar.
Kanserlemede ok sayda ilikili epigenetik mekanizmalar rol oynar. Gen aktivasyonu
Hipometilasyon ve imprint kayb Histon hiperasetilasyonu Histon HK hipermetilasyonu
Noncoding RNA alterasyonlar Gen inaktivasyonu Kusurlu DNA metilasyonu promoter CpG
adalarndabir ok tumr supressr gende Metilbalayan proteinler Histon deasetilasyonu Histon
HK hipermetilasyonu Histon HK hipermetilasyonu Noncoding RNA alterarasyonlar
KANSERDE EPGENETK KUSURLAR GENETK KUSURLARDAN FAZLADIR
Seminar Mining the Cancer epigenome why is it important May
Presenter Professor Susan Clark, Senior Principal Research Fellow, Group Leader,
Epigenetic Research Laboratory, Garvan Cancer program, The Garvan Institute of Medical
Research
Lamarck Jean Baptiste Pierre Antoine deMonet, Chevalier de Lamarck
Annual Reviews
Human Epigenome Project HEP Data
The Human Epigenome Consortium is a public/private collaboration that aims to identify and
catalogue Methylation Variable Positions MVPs in the human genome. As a prelude to the
fullscale Human Epigenome Project HEP, we have recently completed a pilot study of the
methylation patterns within the Major Histocompatibility Complex MHC a region of
chromosome that is associated with more diseases than any other region in the human
genome. We have identified MVPs in the vicinity of the promoter and other relevant regions
of approximately loci within the MHC in tissues from a range of individuals. This will provide
an unprecedented insight into the complex relationship between genetics and epigenetics
that underlies both normal cellular homeostasis and disease states, in particular autoimmune
diseases. For the pilot project, we developed an integrated genomicsbased technology For
Instructions click platform. The pipeline involves the automated bisulphite treatment of DNA
from minute tissue biopsies, genespecific bisulphite PCR and largescale sequencing of PCR
amplicons. Analysis and quantification of methylation patterns is achieved by mass
spectrometric and microarray assays.
here
Pombe Genome Browser
Welcome to the Schizosaccharomyces pombe Epigenome Home Page. This page is a
gateway that provides access to comprehensive analysis of the epigenetic profile of the S.
pombe genome. It makes use of the UCSC genome browser to integrate disparate genomic
data sets, generated by Shiv Grewals laboratory, under one common interface. At the
moment, this site contains information related to distributions of histone modifications such
as methylation of histone H at lysine and lysine , heterochromatin and RNAi components,
and siRNAs described in Cam et al. Nature Genetics , . As more data sets become available,
they will be added and integrated with existing data sets
Epigenom almalarnda genomda metilasyon profili gsteren blgelerin tanmlanmas iin kullanlan
yntemler
DNA metilasyon haritalamalar DNA bislfit uygulamas Restriksiyon enzim teknikleri
Mikroarray ChIP Histon modifikasyon ChIP haritalamalar Kromatin yapsnn Kromatin
fraksiyonlamas fiziksel incelemeleri
Epigenetik Mekanizmalarn Kaltm
Hcreye kimliini kazandran, yani fenotipini ortaya kartan epigenetik mekanizmalarn, mitoz
srasnda bir sonraki hcre soyuna nasl aktarld, maalesef halen bir merak konusudur. ekilde, bu
bilginin, Ayn organizmalarda, sonraki generasyonlara nasl aktarld da pek anlalamamtr.
Epigenetik Mekanizmalarn Kaltm
Ancak, bu epigenetik iaretlerin ya da bu epigenetik reglasyonun dlden dle aktarldna dair
saysz kant mevcuttur. Drosophilalarn oluumundan sorumlu Erikin embriyonik hcreler,
ortamlarndan karldklarnda, blnmeye devam ederler. Gelimekte olan embriyoya geri
konduklarnda da, bacak veya kanat gibi, ilikili olduklar yapy oluturmaktadrlar. Hcreler kendi
kimliklerini hatrlamakla yetinmiyorlar, bu bilgiyi hcre blnmesinde dier hcrelere de aktaryorlar.
Epigenetik Mekanizmalarn Kaltm
Geni apl bir aratrma, annenin davranlarnn, bebein DNAsn etkileyebildiini gsteriyor. Bu
etkinin potansiyel mekanizmas anne st ile beslenen farelerin, glkokortikoid reseptr kodlayan
geninin DNA metilasyonundaki deiimi ile aklanmaktadr. Embriyonik farelerin, antiandrojenik
bir bileik olan vinklozine maruz kalmalar spermatogenesisin azalmasna neden olmutur. Ve
de, bu fizyolojik etki, sonraki bir ok generasyonda da gzlenmitir.
Epigenetik Mekanizmalarn Kaltm
Bitkilerle yaplan bir alma, aadaki sonular ortaya koymutur Strese maruz kalan bitkiler, gen
ekspresyonlarn deitirerek, deien ortama adaptasyon salamlardr. Bunun iin gerekirse
genomlarn destabilize bile etmilerdir. Bylelikle yeni bir fenotip ortaya karmlardr. Yeni fenotipe
sahip bitkiler, stres ortamndan uzaklatrlmalarna ramen, drt generasyon boyunca bu
adaptasyonu korumulardr. yani stresten
ortaya kan adaptif fenotipik deiiklikler sonraki nesile kadar aktarlmtr.
Strese maruz kalmann hafzas mevcuttur ve de bu hafza dlden dle aktarlabilmektedir.
EpigenomikKromatin modifikasyonlarnn
ve transkripsiyon faktrleri ile genom ilikilerinin aratrlmas.
Epigenomics Large scale analysis of chromatin modifications and transcription
factors/genome interactions
karyotlarda gen anlatm dzenlenmesi mRNA transkripsiyon kromatin yeniden modellenmesi
epigenetik aktivatrler, repressrler, transkripsiyon faktrleri, vb.. mRNA ilenmesi mRNA
transport mRNA ykm RNA interferans sessizleme translasyonal kontrol proteinlerin sentezi
posttranslasyonal kontrol protein ykm, vb.
Genetik alannda yapacanz almalara Epigenom almalarnn da eklenmesi temel genetik
kavramlarla aklayamadnz pek ok olayn daha iyi aklanmasna katklar salayacaktr.