MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK BÖLÜMÜ DERS BİLGİ PAKETİ Dersin Kodu / Adı MBG302 /MOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN YÖNTEMLER II Sınıfı / Dönemi Dili Düzeyi Türü Kategorisi Kredisi Eğitim Şekli Ön Koşul Dersler Öğretim Üyesi Diğer Öğr. Üyeleri Yardımcılar Ders Saatleri 3/Bahar Türkçe Lisans Zorunlu Temel bilimler Teori 3 Yüz yüze Yok 3 Uygulama 0 Laboratuar 0 Yok Gündüz: Gece: Dersin Alt Limit Değeri 35 Dönem Sonu Sınavı Barajı 40 ETKİNLİK Değerlendirme Ölçütleri Dersin Amacı AKTS Kredisi 5 Adet Yüzde (%) Ara Sınav 1 20 Kısa Süreli Sınavlar - - Ödevler 4 20 Dönem Ödevi/Projesi - - Laboratuar - - Diğer - - Dönem Sonu Sınavı 1 60 Moleküler Biyoloji, Moleküler Genetik, Gen Mühendisliği, Mikrobiyoloji ve Biyoteknoloj konularla ilgili olarak laboratuar tekniklerinin öğretilmesi deney yapabilme becerisinin kazandırılmasıdır Öğrenim Çıktıları Bu ders Real Time PCR, klonlama, blotlama teknikleri ve gen silme gibi moleküler biyolojide kullanılan tekniklerin temel konularını içerir Ders İçeriği ve Programı Haftalar Konular 1 Real Time PCR -Prob ve primer dizaynındaki stratejik noktalar nelerdir. -Kantitatif gen analizi nedir. -Kantitatif gen analizi nasıl yapılır -Verilerin değerlendirilmesi ve hesaplamalar. -Veri yorumlama 2 Mikrosatellit uygulamaları -Mikrosatellit markırlar ve genom üzerindeki dağılımları Mikrosatellit markırlarılar ve kullanımları -Mikro ve makrosatellit markırların kullanım amaçlar 3 SSCP uygulamaları -SSCP uygulamalarının kullanım alanları -SSCP uygulamaları ve amaçları - Kullanılan çözeltiler ve özellikleri 4 Gen klonlama ve bakteri üretimi -Klonlama vektörleri ve konakçılar -Gen klonlanmasında dikkat edilecek noktalar. -Plazmit izolasyonları -Klonlanmış ürünlerin kontrolü 5 Rekombinant DNA teknolojisi -Rkombinat DNA teknolojisi ve tarihi seyri -Restriksiyon enzimleri ve özellikleri -Ligasyon ve klonlamanın kontrolü 6 Rekombinant DNA teknolojisi yöntemleri ile protein üretimi -Protein üretimi ve aşamaları -Konakçı ve vektör seçimi -Gen klonlama stratejileri -Ürün elde etme ve saflaştırma basamakları 7 Southern blot tekniği -DNA ve mtDNA izolasyonu -DNA’nı kimyasal ve fiziksel özellikleri -DNA izolasyon aşamaları ve kullanılan solüsyonlar -Kullanılan solüsyonlar ve özellikleri -Prob yapma ve kütüphane taranması 8 Western blot tekniği -SDS jelinde proteinlerin nitroselüloz membrana transferi -Blotlama basamağında, spesifik olmayan bağlanmaları engellenmesi -Spesifik antikorlarla inkübasyonu 9 Dot-blot / Slot-blot - Blotlamanın amacı ve kullanım alanları -Kullanıla kimyasal solüsyonlar ve özellikleri 10 ELISA tekniği -Elisa tekniğinin özellikleri -Elisa tekniğinde dikkat edilmesi gereken hususlar -Metodun kullanım alanları -Karşılaşılan problemler ve çözüm önerileri 11 Gen silme - Gen silme tekniğinin özellikleri - Gen silme tekniğinde dikkat edilmesi gereken hususlar -Metodun kullanım alanları -Karşılaşılan problemler ve çözüm önerileri 12 Gen susturma -miRNA lar ve genel özellikleri -miRNA veritabanları ve miRNA bulma Gen susturmada genel prensipler ve teknik yöntemler 13 Gen transferi ve Transgen üretimi -Gen transferi ve kullanım alanları -Gen transfer teknikleri -Gen tranferinde transgenin kontrolü -Trangenik canlılar ve kullanım alanları 14 Protein izolasyonu -Protein izolasyonu ve aşamaları -Ürün kullanımı Ders Kitapları Setlow, J.K.,2007. Genetic Engineering, Principles and Methods. Plenum Press, New York. ve/veya Kaynakları Yardımcı Kitaplar 1. Temizkan,G., Arda, N.,2004. Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler. Nobel Tıp Kitapevi. 2. Balbás,P., Lorence, A.,2004.Recombinant Gene Expression. Humana Press Inc. 999 Riverview Drive, Suite 208,Totowa, New Jersey 07512 Dokümanlar - Dersin Öğrenim Çıktıları ve Program Yeterliliklerine Katkı Düzeyi ÖÇ No Ders Öğrenim Çıktısı Katkı Yaptığı Prog.Y a Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler hakkında bilgi edinilir Moleküler biyolojide kullanılan yöntemlerin amaçları ve 2 kullanımında dikkat edilmesi gereken noktalar öğrenilir Kullanılan yöntemler ile ilgili çözelti ve tampon hazırlama 3 hakkında teorik bilgi öğrenilir Elde edilen verilerin nasıl değerlendirileceği konusunda 4 bilgi öğrenilir Moleküler biyoloji ve genetikle ilgili olarak deney 5 yapabilme yeteneği kazanır Moleküler Biyoloji ve Genetikle ilgili probleme çözüm 6 önerileri getirebilir. Katkı Düzeyi (1: Düşük 2:Düşük ~ Orta 3: Orta 4: Yüksek 1 b Katkı Düzeyi b 1 2 1, 4 3 4 Ö.Y. c 5 x 1,3 5: Mükemmel) Ölçme Yöntemi ( 1: Yazılı Sınav, 2: Sözlü Sınav, 3: Ödev/Proje, 4: Laboratuar Çalışması / Sınavı, 5: Seminer / Sunum ) c PY. No a Program Yeterlilikleri 1- Alanında yer alan temel kavramları anlayıp yorumlayabilme 2- Kazanmış olduğu teorik bilgiyi pratikte kullanabilme ve sorunlara çözüm önerisi getirebilme 3- Sahip olduğu bilgiyi uygun şekilde aktarabilme 4- Bulunduğu anabilim dalındaki veya farklı disiplinlerdeki kişilerle bir araya gelip takım çalışması yapabilme 5- Etkileşim içerisinde olduğu diğer bilim dalları ile ilgili temel düzeyde bilgi sahibi olabilme 6- Elde ettiği sonuçları bilim dünyasına arz edebilme 7- Bilimsel, sosyal, kültürel, dini ve ahlaki değerlere duyarlı olabilme ve kişisel sorumluluk farkındalığı kazanabilme 8- Alana ait bilgileri bilim etiği çerçevesinde sosyal ve bilimsel değişiklikleri göz önüne alarak sorgulayabilme 9- Varsa alanı ile ilgili eğitim sorunlarına duyarlı olup çözüm getirebilme 10- Mesleki alandaki gelişmelerin yanı sıra sosyal alandaki gelişmeleri takip edebilme, bunlarda aktif olarak rol alabilme 11- Kazandığı bilgileri farklı disiplinlerden edindiği bilgilerle birleştirerek yorumlayabilme bilme 12 Alanının gerektirdiği düzeyde bilgisayar yazılımı ile birlikte bilişim ve iletişim teknolojilerini kullanabilme 13 Yazılı ve sözlü olarak kendini ifade edebilme 14 Bir yabancı dili kullanarak alanındaki bilgileri takip edebilme ve meslektaşları ile iletişim kurabilme