İZMİR ÜNİVERSİTELERİNDE “BİYOTEKNOLOJİ - BİYOMÜHENDİSLİK ALANINDAKİ ALTYAPI ve İNSAN KAYNAKLARI” BÖLÜM 1. TANIM Biyomedikal teknoloji, tıpta teşhis ve tedavi amacıyla kullanılabilecek tüm madde, malzeme, aparat ve cihazların üretimi ile ilgilenen disiplinlerarası bir teknoloji dalıdır. Hızla gelişmekte olan“Biyomedikal Teknoloji” gelişmiş ülkelerde günümüzde uluslararası düzeyde en çok yatırım yapılan bilim ve teknoloji dalları arasında ön sırada yer almaktadır. Biyomedikal teknoloji ürünleri boyut ve kapasite olarak üretimleri az, dolayısıyla küçük fakat özel mekanlarda, özel koşullarda üretilen ürünlerdir, ancak olmazsa olmaz tanımına uyan bir pazara sahiptir ve fiyatları komodite ürünlere göre çok yüksektir. Bu sektör başlıca üç alt başlıktan oluşmaktadır: • Sağlık sektöründe, ilaçlar, aşılar, büyüme faktörleri, hormonlar, proteinler, oligopeptidler, oligonükleotidler gibi, farklı amaçlar için kullanılan maddelerin modern biyoteknolojik yöntemlerle sentezi ve üretimi, kısaca “Sağlık için Biyoteknoloji”, • “Biyomateryaller” olarak gruplandırılan, yapay organlar, sert ve yumuşak doku protezleri, ve teşhis ve tedavi amaçlı aygıtların/cihazların yapımında yaygın olarak kullanılan polimerler başta olmak üzere, metaller ve alaşımlar, özel seramikler, karbon ve bunların kompozitlerinden oluşan malzemelerin geliştirilmesi ve üretimi, • Çoklu tanının aynı anda yapılmasına olanak veren ve gelecekte Biyomedikal Teknolojinin çok hızla gelişen dalları olan genomiks ve proteomiks ile ilgili uygulamalarında önemli bir role sahip olacak olan Biyoçip teknolojisi kullanılarak tanı kitleri geliştirilmesi ve üretimi, • Biyolojik materyaller içeren ve/veya bunları çeşitli ortamlarda kalitatif ve/veya kantitatif tayin ve izlenmesinde kullanılan “Biyosensörler”in geliştirilmesi ve üretimi. Biyomedikal Teknoloji, birçok gelişmiş ve gelişmekte olan ülkede olduğu gibi Türkiye’de de öncelikli desteklenmesi gereken Bilim ve Teknoloji Dallarından bir olarak görülmekte ve çeşitli plan ve programlarda yer almaktadır. 1 BÖLÜM 2. BİYO-EKONOMİLERİN BÖLGESEL ÖNEMİ Mayıs 2009’da İzmir Kalkınma Ajansı tarafından yayınlanan İzmir için Yükselen Sektörler isimli yayın, bölge ekonomisinin yükselen ve güçlü sektörlerinin tespitini amaçlamakta ve ilde belli bir düzeyin üzerinde yogunlasmıs sektörlerin rekabet güçleriyle birlikte irdelenmesini içermektedir[1]. Yoğunlaşma düzeyi düsük de olsa, son dönem bölgesel kalkınma politikalarının odaklandıgı katma degeri ve teknoloji seviyesi yüksek sektörlerin İzmir’deki durumu ve potansiyelleri değerlendirildiğinde biyomedikal teknolojiler için durum Tablo 1.de özetlenmiştir. Tablo, yüksek nokta sektörlerin rekabet gücü açısından önem tasıyan baslıklarda, “OECD Teknoloji Skalasına Göre Orta-İleri teknoloji Seviyesine Sahip Olanlar” olarak degerlendirilmis ve her başlık bir puan olmak üzere ana sektörler toplam “10”, imalat sanayi toplam “13” üzerinden puanlandırılmıstır. Buna göre İzmir İli için ana sektörler bazında yükselen sektörler incelendiğinde, 8 puan ile Tıbbi aletler; hassas ve optik aletler ile saat imalatı ön sıralardadır. İlk olarak dikkati çeken, İzmir’de, tüm dünyada katma degeri yüksek olarak kabul edilen yüksek ve ortayüksek seviyede teknoloji kullanan sanayi sektörlerinden biri olan biyomedikal’in hemen her açıdan güçlü çıkmasıdır. Bu tespit; İzmir’in ekonomik gelişmesi ve bölgesel rekabeti açısından çok önemli bir bulgudur. Dünyadaki egilimlere bakıldıgında özellikle son dönemde ekonomik gelisme ve hedef sektörlerin belirlenmesi iki farklı yaklasıma oturtulmaktadır. Bunlardan ilki üretimde kullandıgı ileri teknoloji seviyesi ve arastırma geliştirme faaliyetleri ile yarattığı yüksek katma değerle dikkati çeken: Bilgi ve iletisim teknolojileri Biyoteknoloji ve gen teknolojileri Malzeme teknolojileri Nanoteknoloji Tasarım teknolojileri Mekatronik Üretim süreç ve teknolojileri Enerji ve çevre teknolojileri kullanan sektörlerde gelişmeyi hedefleyen yaklaşımdır. Bu açıdan bakıldıgında İzmir’de yoğunlaşmamış olmasına rağmen son dönemde katma değeri veya ihracatı giderek artan ve dünyadaki eğilimlerde hedef ve stratejik sektör olarak belirlenmiş üretim alanları dikkati çekmektedir. İldeki üniversiteler ve teknoloji gelistirme bölgesinde özellikle son yıllarda ulusal veuluslar arası önemde arastırmalar ve projeler yürütülmektedir. İzmir’deki AR-GE faaliyetleri, ve üniversitelerden mezun olan kalifiye işgücünün varlığı, ildeki üretim faaliyetlerinde katma değerin artırılması ve sektörlerin sürdürülebilirliğinin sağlanmasında büyük önem taşsımaktadır. Bu noktada sanayi ve 2 üniversite işbirliğinin geliştirilmesi, ileri teknolojiye dayalı biyomedikal teknolojiler alanında AR-GE faaliyetlerinin yürütülmesi ve ilde ileri teknoloji kullanılan imalat sanayi kollarının güçlendirilmesi tüm bölgenin rekabet gücü açısından stratejik öneme sahiptir [1]. Yine bu raporda yoğunlaşmamıs ama stratejik ve yükselen sektör potansiyeli olan sektörler arasında: Araştırma ve geliştirme hizmetleri Eczacılık ürünlerinin, tıbbi kimyasalların ve botanik ürünlerinin imalatı Temel eczacılık ürünleri imalatı Farmasötik preparat imalatı İnsan sağlığı ile ilgili hizmetler Hastane hizmetleri Tıp ile ilgili uygulama faaliyetleri ön sıralarda yer almaktadır. Bütün bu sektörler bir arada degerlendirildiginde İzmir’de yükselen ve stratejik sektörlerin üç ana grup olarak ele alınabileceği görülmektedir. Birinci grup İzmir’in tarımsal üretimiyle ilişkili sanayi sektörleridir. İkinci grup mevcuttaki AR&GE, üniversite ve kalifiye işgücü olanaklarından yaralanılarak daha da gelistirilebilinecek ileri teknolojiye dayalı sektörler, ve bunların en başında yaralan biyomedikal sektörü raporlanmıştır. Son grup diger sektörleri destekleyen ve İzmir’in metropoliten kent ve hizmet merkezi olma özelligini daha da artıracak iş destek faaliyetleridir [1]. Bu sektörler İzmir ili içinde birbirleriyle ilişkili ve tamamlayıcı konumdadır. Bu tamamlayıcılık olusturulacak stratejilerin ve politikaların belgesi olacak bölge planıyla pekiştirilmesi planlanmıştır [1] . Sonuç olarak İzmir’de yoğunlasmıs yükselen ve stratejik sektörlerin başında yaralan biyomedikal teknolojiler ve biyomühendislik konusunda bölgemiz belirli potansiyel değere ulaşmış bir kapasiteye sahiptir. Aşağıda sunulan halihazırda varolan Üniversite araştırıcı ve araştırma olanakları ile ilgili veriler bu gelişme planını destekler niteliktedir. Kaynakça: [1.] İzmir için Yükselen Sektörler, İzmir Kalkınma Ajansı, Mayıs 2009 3 BÖLÜM 3. BÖLGE ÜNİVERSİTELERİNDE MEVCUT BULUNAN LİSANSÜSTÜ ANABİLİM DALI PROGRAMLARI Tablo 3.1 Ege Üniversitesi’nde Mevcut Bulunan İlgili Anabilim Dalları ve Lisansüstü Programlar Fen Bilimleri Biyoloji, Fizik, Kimya, Biyokimya, İstatistik, Mühendislik Bilimleri Biyomühendislik, Bilgisayar, Elektrik-Elektronik, Gıda, Tekstil ve Kimya Mühendisliği Çok Disiplinli A.B.D. Biyoteknoloji, Nükleer Bilimler, Uluslararası Bilgisayar Sağlık Bilimleri Tıp Halk Sağlığı, Parazitoloji, Biyokimya, Tıbbi Biyoloji, Spor Hekimliği, Histoloji ve Embriyoloji, Biyofizik, Tıp Tarihi ve Deontoji, Fizyoloji, Anatomi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları, Adli Tıp, Psikiyatri, Radyasyon Onkolojisi, Tıp Eğitimi, Biyoistatistik ve Tıbbi Bilişim Diş Hekimliği Protetik Diş Tedavisi, Periodontoloji, Ortodonti, Pedodonti, Oral Diagnoz ve Radyoloji, Ağız Diş ve Çene Hastalıkları Cerrahisi, Diş Hastalıkları ve Tedavisi Eczacılık Farmasötik Toksikoloji, Farmakognozi, Farmasötik Kimya, Farmakoloji, Biyokimya, Analitik Kimya, Farmasötik Botanik, Farmasötik Teknoloji, Farmasötik Biyoteknoloji, Farmasötik Mikrobiyoloji, Radyofarmasi Tablo 3.2 İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü (İ.Y.T.E.)’de Mevcut Bulunan İlgili Anabilim Dalları ve Lisansüstü Programlar Anabilim Dalı Lisansüstü Program(lar) Bilgisayar Mühendisliği Bilgisayar Yazılımı Yüksek Lisansı Moleküler Biyoloji ve Genetik Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisansı Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı Biyoteknoloji ve Biyomühendislik Biyoteknoloji Yüksek Lisansı (İnterdisipliner) Biyomühendislik Doktora Programı Elektrik-Elektronik Mühendisliği Elektronik ve Haberleşme, Uydu Haberleşme (Tezsiz) Yüksek Lisansları, Elektronik ve Haberleşme Doktorası Endüstri Ürünleri Tasarımı Endüstri Ürünleri Tasarımı Yüksek Lisansı Fizik Fizik Yüksek Lisansı ve Doktorası 4 Gıda Mühendisliği Gıda Mühendisliği Yüksek Lisansı Gıda Mühendisliği Doktora Programı Kimya Kimya Yüksek Lisansı ve Doktorası Kimya Mühendisliği Kimya Mühendisliği Yüksek Lisansı ve Doktorası Makina Mühendisliği Makina Mühendisliği Yüksek Lisansı ve Doktorası Malzeme Bilimi ve Mühendisliği (İnterdisipliner) Malzeme Bilimi ve Mühendisliği, Malzeme Bilimi Yüksek Lisansları ve Doktorası Matematik Matematik Yüksek Lisansı ve Doktorası Mühendislik Yönetimi (II. Eğitim) Mühendislik İşletmeciliği (Tezsiz) Yüksek Lisansı Tablo 3.3 Dokuz Eylül Üniversitesi (D.E.Ü.)’de Mevcut Bulunan İlgili Anabilim Dalları ve Lisansüstü Programlar Anabilim Dalı Lisansüstü Program(lar) Elektrik ve Elektronik Mühendisliği (FBE) Elektrik ve Elektronik Mühendisliği Bilgisayar Mühendisliği (FBE) Bilgisayar Mühendisliği Multidisipliner (SBE) Medikal Informatik Multidisipliner (SBE) Biyomekanik Biyofizik (SBE) Biyofizik SBE: Sağlık Bilimleri Enstitüsü FBE: Fen Bilimleri Enstitüsü 5 BÖLÜM 4. ÜNİVERSİTELERDE SÜRDÜRÜLEN BİYOMÜHENDİSLİKLE İLİŞKİLİ BÖLÜMLER ve ARAŞTIRMALAR 4.1 Ege Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Biyomühendislik Biyoproses Mühendisliği(*) Biyoproses Tasarımı, Biyokataliz, Biyoseperasyon Yeni ve ekonomik biyoreaktörlerin tasarımı. Biyolojik olayların daha kolay anlaşılması için, matematik modelleme ve simulasyon. Biyoenstrümantasyon ve ölçek büyütme, sulu ve çözgen ortamda biyokataliz. Membran ayırımı, süperkritik akışkanlarla ayırım, biyolojik materyalin ayırma ve saflaştırma yöntemlerinin optimizasyonu. Kromatografik ve ekstraktif biyoseperasyon işlemleri, adsorpsiyon, iki fazlı sıvı polimer sistemleri ve miseller kullanarak ayırma. Hücre dışı ortamın kontrolü ile protein üretiminin kontrolü, besin elementleri transportu, özel tipteki biyoreaktörlerin tasarımı, biyoreaktör çalışma koşullarının belirlenmesi Biyomedikal Mühendislik(*) Biyomedikal Tanı, Biyomedikal Terapi, Biyomateryaller, Biyomekanik Tanı ve terapide kullanılacak invasif ve non-invasif tekniklerin geliştirilmesi. Redoks enzimleri ile elektriksel iletişim kurma, biyosensörler, elektroenzimatik sentezler, fizyolojik olayların ölçüm ve analizi. Biyoreoloji, kan dolaşımı ve hastalıkların modellenmesi, hücrelerle ve dokularla olumlu etkileşim kurabilen sentetik biyomateryallerin geliştirilmesi. Yapay organ ve implantların geliştirilmesi, temel mühendislik ilkeleri yardımıyla vücut yapı ve fonksiyonlarının modellenmesi (Kardiyovasküler ve mukoskeletal sistemler). Doku ve organ rejenerasyonu, polimer-hücre etkileşimleri. Permeabilite, presipitasyon, koagülasyon, mikrosirkülasyon ve transport gibi olayların moleküler düzeyde tanımlanması. Biyolojik olarak parçalanabilir polimerler, biyokompatibilite ve toksikoloji, kontrollü salınım ve tedavi. Membran sistemlerinin biyomedikal uygulamaları (Diyaliz gibi). Yaşam desteği sistemlerinin geliştirilmesi ve rehabilitasyonun temel ilkeleri. 6 Genetik Mühendisliği(*) Hücre Mühendisliği, Doku Kültür Mühendisliği Yeni klonlama teknikleri, rekombinant ve non-rekombinant hücreler. Gen izolasyonu, aşı araştırmaları, plazmid kararlılığı, elektroporasyon. Hayvan ve bitki hücrelerinin üretim/çoğalma kinetiği, metabolizmaları. Hibridoma teknikleri, yeni proteinlerin üretimi, sentetik polimer - hücre sistemleri yardımıyla, yarı-yapay organlar (karaciğer, pankreas) geliştirilmesi. Tablo 4.1 Ege Üniversitesi’nde Biyomühendislik Alanında Çalışma Yapan Öğretim Üyeleri FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ Mühendislik Bilimleri Biyomühendislik Bölümü AD/SOYAD ÜNVAN Y.L. Derecesi Doktora Derecesi İLGİ ALANLARI Ahmet ÖZTARHAN Prof. Dr. University of Manchester Institute of Science and Technology (UMIST) University of Manchester Institute of Science and Technology (UMIST) Plasma Physics Plasma Physics MEVVA iyon implantasyonu yöntemi ile yüzey modifikasyonu Polimerik biyomalzemeler Omurilik implantları Biyomedikal Amaclı Tekstil Uygulamaları Nanomalzemeler Rengin ELTEM Murat ELİBOL Prof. Dr. Prof. Dr. Ege Üniv. Fen Fak. Ege Üniv. Fen Fak. Biyoloji Bölümü Biyoloji Bölümü Mikrobiyoloji A.B.D. Mikrobiyoloji A.B.D. Fırat Üniversitesi The University of Manchester (Formerly UMIST) Kimya Mühendisliği Bölümü Chemical Eng. S. İsmet DELİLOĞLU GÜRHAN Prof. Dr. Ankara Üniversitesi, Veterinerlik Fak., Uzmanlık Yük. Okulu Selçuk Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Yüksek Okulu, Viroloji Mikrobiyal biyopolimer üretimi Biyopolimer üretimi (aljinat, kitosan) Kök hücre ve somatik hücre kültürleri Orta ölçekli Mab üretimi Biyomateryal 7 karakterizasyonu çalışmaları Erdal BEDİR Prof. Dr. Hacettepe Üniv. Hacettepe Üniv. Sağlık Bilimleri Enst. Sağlık Bilimleri Enst. Farmakognozi Farmakognozi Meltem CONK DALAY Prof. Dr. E.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Su ürünleri E.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Su ürünleri Kemal Korkmaz Doç Dr. Dokuz Eylul Univ. Tip Fak., Tibbi Biyoloji AB. Dali Dokuz Eylul Univ. Tip Fak., Tibbi Biyoloji AB. Dali Gaye ÖNGEN Doç. Dr. Ege Üniversitesi, Gıda Müh. Ege Üniversitesi, Gıda Müh. Rekombinant protein üretimi Özlem YEŞİL ÇELİKTAŞ Yrd. Doç. Dr. Chalmers University of Technology, Management of Production Ege Üniversitesi, Biyoteknoloji Anabilim Dalı Super kritik CO2 Aylin ŞENDEMİR ÜRKMEZ Yrd. Doç. Dr. Boğaziçi Üniversitesi University of Illinois at Urbana-Champaign Biyomalzeme üretimi ve karakterizasyonu Biyomedikal Mühendislik Materials Science and Engineering Emel SOKULLU URKAC Uzman İ.Y.T.E. Fen Bilimleri Enst. Ege Üniversitesi Malzeme Bilimi ve Müh. Biyomühendislik Spirulina Doku mühendisliği İyon implantasyonu yöntemi ile yüzey modifikasyonu Polimerik biyomalzemeler Nanomalzemeler Ayşe NALBANTSOY Sultan GÜLÇE İZ Ar. Gör. Ar. Gör. Ege Üniversitesi Ege Üniversitesi Biyoloji Biyoteknoloji Ege Üniversitesi Ege Üniversitesi Biyomühendislik Biyomühendislik Orta ölçekli Mab üretimi DNA aşı modeli geliştirilmesi Biyomateryal karakterizasyonu çalışmaları Tekstil Mühendisliği North Carolina State University Güldemet BASAL Yrd. Doç. Dr. North Carolina State University Kitosan biyopolimerlerden elektroçekim ile farklı yüzeyler oluşturmak Faz değiştirici yüklü, biyopolimer kabuklu mikro kapsül 8 Gıda Mühendisliği Bölümü Sibel KARAKAYA Sedef Nehir El Prof. Dr. Prof. Dr. Ege Üniversitesi, Ege Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü Gıda Mühendisliği Beslenme Beslenme E.Ü.Müh.Fak.Gıda Müh.Böl. E.Ü.Müh.Fak.Gıda Müh.Böl. Nanotüp üretimi Kimya Mühendisliği Bölümü Şerife Helvacı Prof. Dr. Ege Üniversitesi, Mühendislik Fak.,Kimya Mühendisliği Bölümü Ege Üniversitesi, Mühendislik Fak.,Kimya Mühendisliği Bölümü Sümer PEKER Prof. Dr. O.D.T.Ü. Ege Üniv. Kimya Mühendisliği Kimya Mühendisliği Stanford University Stanford University Nano boyutta ZnO Üretimi Makine Mühendisliği Bölümü Hasan YILDIZ Doç. Dr. Biomekanik Bilgisayar Destekli Tasarım Sayısal Yöntemler Mehmet SARIKANAT Yrd. Doç Dr. EU Fen Bil. Enst. EU Fen Bil. Enst. Makine Muh. A.B.D Makine Muh. A.B.D Makine Teo. Ve Din. Mekanik Bilgisayar Destekli Tasarım Sayısal Yöntemler Elektrik Elektronik Mühendisliği Bölümü Mehmet ENGİN Yrd. Doç. Dr. Marmara Üniversitesi Kocaeli Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Enstitüsü Biyosensörler EEG tasarımı EKG simülatör tasarımı Ömer MERMER Yrd. Doç Dr. Ege Üniversitesi Iowa Universitesi Elektrik&Elektronik Muhendisligi Fizik Bolumu Prof. Dr. Ege Üniversitesi Ege Üniversitesi Nükleer Bilimler Ens./Nükleer Uygulamalar Nükleer Bilimler Ens./Nükleer Uygulamalar Ege Üniversitesi, Nükleer Bilimler Enstitüsü Ege Üniversitesi, Nükleer Bilimler Enstitüsü Çok Disiplinli A.B.D. Perihan UNAK Fatma YURT LAMBRECHT Prof. Dr. 9 Manyetik nanoparçacık üretimi Radyofarmasi Nükleer Kimya Fen Bilimleri Kimya Bölümü Nursel ACAR Yar. Doç. Dr. Ege Üniv. Fen Fak. Ege Üniv. Fen Fak. Kimya Bölümü Kimya Bölümü Prof. Dr. Ege Üniv. Fen Fak./Biyoloji Böl. Ege Üniv. Fen Fak./Biyoloji Böl. Fizikokimya Biyoloji Bölümü Sabire KARAÇALI Sitoloji, moleküler biyoloji, hücre biyolojisi, TEM Nefise Ülkü KARABAYYAVAŞOĞLU Doç. Dr. Seçkin SOYA Ar. Gör. Ege Üniv. Fen Fak. Ege Üniv. Fen Fak. Biyoloji Böl. Biyoloji Böl. E.Ü. Fen Fak. Ege Üniversitesi Biyomühendislik Bölümü Biyomühendislik Ege Üniversitesi Karbon nanotüplerle modifiye enzimatik ve mikrobiyal biyosensörlerin hazırlanması Biyoloji Böl. İn vivo toksikoloji Biyokimya Bölümü Azmi TELEFONCU Prof. Dr. Ege Üniv. Fen Fak. Kimya Freie Universitaet Berlin Biochemie Erhan DİNÇKAYA Prof. Dr. Ege Üni.Fen Bil. Enst. Kimya A.B.D., Biyokimya Bilim Dalı Ege Üni.Fen Bil. Enst. Kimya A.B.D., Biyokimya Bilim Dalı Biyosensörler Nurdan PAZARLIOĞLU Doç. Dr. Ege Üniversitesi, Kimya Ege Üniversitesi, Biyokimya Proteolitik Enzim İmmobilizasyonu Suna TİMUR Doç. Dr. Ege Universitesi, Kimya Ege Üniversitesi, Biyokimya Fonksiyonel nanopartiküllerin sentezi Prof. Dr. İstanbul Teknik Üniversitesi Nükleer Enerji Enstitüsü Ege Üni.Fen Fak. Nükleer fizik Fizik Bölümü Saim SELVİ 10 SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ Tıp Fakültesi Kemal TÜRKER Prof. Dr. E.Ü. Tıp/ Fizyoloji E.Ü. Tıp/ Fizyoloji Elektrofizyoloji, EMG Lütfiye KANIT Prof. Dr. Ege Üniv. Tıp Fak. Ege Üniv. Tıp Fak. Fizyoloji Madde bağımlılığı Gürbüz ÇELEBİ Prof. Dr. Robert Kolej Yüksek Okulu Clark Univ. Biyomedikal fizik Mehmet ZİLELİ Prof. Dr. Ege Üniv. Tıp Fak. Ege Üniv. Tıp Fak. Nöroşirürji Omurilik implantları Prof. Dr. Ege Üniv. Tıp Fak. Prof. Dr. Ege Üniv. Tıp Fak Ege Üniv. Tıp Fak Ortopedi ve Travmotoloji Ortopedi ve Travmotoloji Doç. Dr. ODTÜ, İstatistik Ankara Üniversitesi Biyoistatistik Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyometri Tıbbi bilişim Tayfun DALBASTI Semih AYDOĞDU Mehmet N. ORMAN Nöroşirürji Nöroşirürji Ege Üniv. Tıp Fak. Nöroşirürji Diz biyomekaniği Bilgisayar modelleme Hülya ÜÇERLER Doç. Dr. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Anatomi Anabilim Dalı Nöroanatomi, stereoloji Gülperi ÖKTEM Doç. Dr. E.Ü. Tıp/Histoloji-Embrioloji E.Ü. Tıp/Histoloji-Embrioloji Akış sitometrisi Sedat Çağlı Doç. Dr. Ege Üniv. Tıp Fak. Nöroşirürji Ege Üniv. Tıp Fak. Nöroşirürji Biyomalzemeler Doç. Dr. Ege Üniv. Tıp Fak. Ege Üniversitesi Tıp Fak. Endoskopik plastik cerrahi, mikrocerrahi ve rekonstrüktif cerrahi Yrd. Doç. Dr. Celal Bayar Üniversitesi,Halk Sağlığı Ege Üniversitesi, Fizyoloji Sinir bilim Uz. Dr. Tıp/ Ortopedi ve Travmatoloji Tıp/ Ortopedi ve Travmatoloji Kırık iyileşmesi ve kemik grefleri Ufuk BİLKAY Taner DAĞCI Seyithan ÇETİNKAYA Plastik Cerrahi 11 Omurilik implantları Diş Hekimliği Fak. Serhat ÇINARCIK Prof. Dr. Ege Üniv. Diş Hek. Fak. Ege Üniv. Diş Hek. Fak. Periodontoloji Bülent ZEYTİNOĞLU Prof. Dr. Ege Üniv. Diş Hek. /Ağız Diş Çene Hastalıkları Cerrahisi Ege Üniv. Diş Hek. /Ağız Diş Çene Hastalıkları Cerrahisi Oral implantoloji Ümit TUNCAY Prof. Dr. Hacettepe Üniv. Diş Hek. Ağız Diş Çene Hastalıkları Cerrahisi Ege Üniv. Diş Hek. Biomateryaller Tayfun GÜNBAY Prof. Dr. Ege Üniv. Diş Hek. /Ağız Diş Çene Hastalıkları Cerrahisi Ege Üniv. Diş Hek. /Ağız Diş Çene Hastalıkları Cerrahisi İleri implant cerrahisi Maksillofasiyal cerrahi Aydın BIÇAKÇI Prof. Dr. Diş Hek./Protetik Diş Tedavisi Diş Hek./Protetik Diş Tedavisi Kron-köprü protezleri, totalparsiyel protezler, Engin ARAS Prof. Dr. Université de MontpellierProthèse Maxillo-Faciale Université de Montpellier Prothèse Maxillo-faciale Çene yüz protezleri, oral ve maksillofasiyal implantoloji Atilla USER Prof. Dr. Ege Univ. Diş Hek./Protetik Diş Tedavisi Ege Univ. Diş Hek./Protetik Diş Tedavisi Porselen restorasyonlar, implant protezler, hassas tutuculu protezler Gökhan YILMAZ Prof. Dr. A. Ü. Diş Hek. Fak. Hek.. E.Ü. Diş Hek. Fak. Dental materyaller ve dental teknoloji, hareketli protezler, sabit protezler Celal ARTUNÇ Prof. Dr. İstanbul Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi Ege Üniversitesi Dişhekimliği Fakültesi Protetik Diş Tedavis Seramik protezler, implant destekli protezler, biyofonksiyonel protezler, teleskop tutuculu protezler Birgül ÖZPINAR Prof. Dr. Ege Üniv. Diş Hek. Fak. /Protetik Diş Tedavisi Ege Üniv. Diş Hek. Fak. /Protetik Diş Tedavisi Protetik diş tedavisi Özant ÖNÇAĞ Prof. Dr. Ege Üniv. Sağlık. Bilim. Enst.. Ege Üniv. Sağlık. Bilim. Enst. Diş Hekimliği Fak. Diş Hekimliği Fak. Engelli çocuklar, endodonti, dental travma Ege Üniversitesi, Dişhekimliği Ege Üniversitesi, Dişhekimliği, Diş Hastalıkları ve Tedavisi Bilge Hakan ŞEN Prof. Dr. Ağız Diş Çene Hastalıkları Cerrahisi Protetik Diş Tedavisi 12 Endodonti mikrobiyolojisi, endodontik immünoloji, dental materyaller, SEM uygulamaları Şule SÖNMEZ Prof. Dr. E.Ü.Dişhekimliği Fakültesi E.Ü.Dişhekimliği Fakültesi Doğal antimikrobial maddelerin periodontal tedavide kullanılabilirlikleri Ahmet Tunç İLGENLİ Prof. Dr. Ege Üniversitesi, Dişhekimliği Fakültesi, Periodontoloji A.D E.Ü.Dişhekimliği Fakültesi, Periodontoloji A.D. Rejeneratif tedavi yöntemleri, oral implantoloji, destekleyici periodontal tedavi F.Bahar SEZER Doç. Dr. Ege Üniversitesi, Dişhekimliği Fakültesi Ege Üniversitesi, Dişhekimliği Fakültesi İmplantoloji ağız hastalıkları biyomateryaller Fatih ARIKAN Sema ÇINAR Ar. Ege Üniversitesi Ege Üniversitesi Gör. Dişhekimliği Fakültesi Dişhekimliği Fakültesi Ar. Ankara Üniversitesi Ege Üniversitesi Gör. Dişhekimliği Fakültesi Dişhekimliği Fakültesi Rejenerasyon, transplantasyon, implant Hücre kültürü, ilaca bağlı dişeti büyümeleri, periodontal rejenerasyon Eczacılık Fak. Prof. Dr. O.D.T.Ü. Ege Üniversitesi, Temel Eczacilik Bilimleri Analitik Kimya K. Arzum ERDEM GÜRSAN Prof. Dr. Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Analitik Kimya A.B.D Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Analitik Kimya A.B.D Analitik Kimya Gülten KANTARCI Doç. Dr. Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Taşıyıcı sistemlerin organizmada biyodağılımı H. Yeşim KARASULU Doç. Dr. Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Mikroemülsiyon formülasyonlarının in vitro-in vivo değerlendirilmesi Metiner TOSUN Doç. Dr. Ege Üniversitesi, Saglik Bilimleri Enstitüsü, Farmakoloji University of Cincinnati, College of Medicine, Pharmacology TRPC gen ailesinin karsinogenezde gen susturma ile arştırılması Mine ÖZYAZICI Yar. Doç. Dr. Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Nanopartiküler Sistemlerin Hazırlanması İpek ÖZCAN Ar. Gör. Ege Üniversitesi, Eczacılık Ege Üniversitesi, Eczacılık Nanopartiküler ilaç M.Şengün ÖZSÖZ 13 Biyosensörler Biyosensörler Fakültesi Fakültesi Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi taşıyıcı sistemlerin tasarımı Taner ŞENYİĞİT Ar. Gör. Kortikosteroitlerin dermatolojik formülasyonlarının hazırlanması ve in_vitro invivo değerlendirilmesi Seda UYSAL Ar. Gör. Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Nanopartiküler Sistemlerin Hazırlanması Emel Öykü ÇETİN Ar.Gör. Hacettepe Un, Saglik Bilimleri Ens., Biyofarm. Farmakokin BD Ege Univ, Saglik Bilimleri Ens., Biyofarm. Farmakokin. BD In vitro salınım çalışmaları Evren H. GÖKÇE Ar. Gör. Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Katı lipit nanopartikül formülasyonlarının geliştirilmesi Aysu YURDASİPER Ar.Gör. Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi Mikrojel formülasyonlarının hazırlanması Genetik Hastalıkları Araştırma Merkezi Özgür ÇOĞULU Doç Dr. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Haluk AKIN Yar. Doç. Dr. İ. Ü. Cerrahpaşa Tıp Fak. Dicle Üniversitesi Fakültesi Ege Üniversitesi Tıp Genetik Tıbbi Genetik Tıp Fakültesi * E.Ü’de biyomühendislik, biyomedikal mühendisliği ve biyoteknoloji alanında çalışmakta olan ve projeler yürüten Fen Bilimleri, Mühendislik ve Tıp Fakültelerinde görev yapmakta olan ve yukarıdaki Tablo’ya eklenebilecek bir çok öğretim üyesi bulunmaktadır. Yukarıdaki Tablo, EBİLTEM’in “Sağlık konusunda projeleri olan araştırmacılara” yaptığı çağrıya cevap ileten öğretim üyelerinin isimlerini içermektedir. Bu girişim, konuyla ilgili çalışmaları olan tüm araştırmacılara açıktır. 14 Tablo 4.2 Ege Üniversitesi’nde Mevcut Alanda Yürütülmekte Olan Biyomühendislik Alanı ile İlgili Projeler Mühendislik Fakültesi Biyomühendislik Bölümü Proje Kodu Proje Adı Proje Yürütücüsü Ahmet Öztarhan, Prof. Dr. Sinir Dokusu Rejenerasyonu ve Desenli Yaygın Sinir Ağları Oluşturulması Uygulamalarına Yönelik İyon Işınları ile Modifiye Edilmiş ve Elmasa Benzer Karbon Filmler (DLC) ile kaplanmış TÜBİTAK 108M391 Polimerik Yüzeylerin Oluşturulması BAP 09/BİL/026 Ahmet Öztarhan, Prof. Dr. İyon İmplantasyonu ve Yüzey Pürüzlülüğünün Fibroblastik ve Osteoblastik Hücre Tutunmalarına Etkilerinin BAP İncelenmesi Ahmet Öztarhan, Prof. Dr. İyon İmplantasyonunun Tekstillere Kazandırdığı TÜBİTAK 108M394 Özellikler S. İsmet Gürhan, Prof. Dr. İmplant malzemesi olarak kullanılan biyomateryallerin in vitro sitotoksisite ve genotoksisitelerinin AR-FON araştırılması S. İsmet Gürhan, Prof. Dr. Organik Hidroksilapatit ile Sentetik Ortamda Hazırlanan Hidroksilapatitin Biyouyumluluk ve Kemik Grefti Yerine Kullanılabilirliğinin in vivo ve in vitro Ortamlarda İncelenmesi AR-FON S. İsmet Gürhan, Prof. Dr. Kültür Ortamında Farklılaşan Sıçan ve Köpek Kemik İliği Stroma Hücrelerinin, Kemik Dokusunda Yara Tamiri Üzerine Etkileri, Stroma Hücrelerinin İmplant Materyalleri ile Etkileşimi ve TÜBİTAK Yönlendiren Faktörler. EBİLTEM Kimya Mühendisliği Bölümü Şerife S. Helvacı, Prof. Dr. Nanoboyutta 15 TiO2 TÜBİTAK 104M255 taneciklerinin Nanoreaktör Yöntemiyle Üretimi Sümer Peker, Prof. Dr. Mikroemülsiyon Yöntemi ile Nanoboyutta ZnO Üretimi TÜBİTAK 104M382 Gıda Mühendisliği Bölümü Sedef Nehir El, Prof. Dr. Bazı Gıdalarda ve Farklı Koenzim Q10 Preparatlarıyla Zenginleştirilmiş Gıdalarda in vitro Koenzim Q10 Biyoyararlılığının Saptanması BAP 09/BİL/013 Sibel Karakaya, Prof. Dr. Alfa-Laktalbümin Nanotüplerin Eldesi ve Model Sindirim Sistemindeki Davranışı - Tekstil Mühendisliği Bölümü Güldemet Başal, Yrd. Doç. Dr. Tek Eksenli ve Koaksiyel Yapıda Biyopolimer Nanoliflerin Elektrolif Çekim Yöntemi ile Üretilme Olanaklarının Araştırılması Guldemet Basal, Yrd. Doç. Dr. Mikrokapsüllenmiş Faz Değiştiricilerin ve Fonksiyonel İpliklerin Elastik Bandajların Konfor Özelliklerinin İyileştirilmesinde Kullanımı - Guldemet Basal, Yrd. Doç. Dr. Medikal Tekstil Uygulamaları için Antibakteriyel Ajan İçeren Mikrokapsüllerin Hazırlanması BAP 09/TKUAM/005 Elektrik Elektronik Mühendisliği Mehmet Engin, Yrd. Doç. Dr. EKG Sinyallerinin Mobil Telefon Üzerinden İletildiği Sistemin Tasarımı - Mehmet Engin, Yrd. Doç. Dr. Prototip EEG Ölçüm Sistemi Tasarımı Mehmet Engin, Yrd. Doç. Dr. Programlanabilir Simülatör Tasarımı Mehmet Engin, Yrd. Doç. Dr. Kan Şekeri (Glukoz) Tayini için Non-invaziv Elektrokimyasal Ölçüm Cihazına ait Donanım ve Yazılımların Tasarımı ve Gerçekleştirilmesi - 16 EKG - Sağlık Bilimleri Eczacılık Fakültesi Aysun PABUÇCUOĞLU, Prof. Dr. Memeli hücrelerinde EndoplazmikRetikulumilişkili protein yıkımı(ERİY)mekanizmasının substrata spesifik farklılıklarının ve regülasyonunun incelenmesi BAP 09/BİL/004 Şengün Özsöz, Prof. Dr. Telomeraz Aktivitesinin Elektrokimyasal Olarak Saptanması - Şengün Özsöz, Prof. Dr. Polimer Zincir Tepkimesi (PZT) Ürünü Dizinlerin StreptaVidin ile Kaplanmış Tek Kullanımlık Perde Baskılı Elektrodlarda (PBE) Enzime Dayalı Amperometrik Yöntemlerle Algılanması - Prof. Dr. Nanomalzemelere dayalı elektrokimyasal sensörlerin tasarımı ve biyomoleküler algılamaya yönelik uygulamaları TÜBİTAK Metiner Tosun, Doç. Dr. TRPC Gen Ailesinin Karsinogenezdeki İşlevsel Ekspresyon Kalıbının PostTÜBİTAK SBAG3953 Transkripsiyonel Gen susturma ile araştırılması 09/BİL/003 H. Yeşim Karasulu, Doç. Dr. Nanoproksen içeren farklı transdermal mikroemülsiyon formülasyonlarının in vitroin vivo değerlendirilmesi üzerine çalışmalar - H. Yeşim Karasulu, Doç. Dr. Pankreasa Hedeflenebilen Aprotinin İçeren Mikroemülsiyon Formülasyonlarının Hazırlanması ve İn Vitro-İn Vivo Değerlendirilmesi Üzerine Çalışmalar BAP - 09/BİL/001 Evren Gökçe, Yrd. Doç. Dr. İmmünosüpresan Madde içeren oküler katı lipit nanopartikül formülasyonlarının geliştirilmesi İn Vitro Ex Vivo İn Vivo değerlendirilmesi - K. Arzum Erdem Gürsan, 17 Mine Özyazıcı, Yrd. Doç. Dr. Nanopartiküler Sistemlerin Hazırlanmasında Önçalışmalar - Devrim Demir Dora, Yar. Doç. Dr. Gen Tedavisine Yönelik Viral Olmayan DNA Taşıyıcı Sistemlerin Geliştirilmesi - Emel Öykü Çetin, Araş. Gör. Periodontal Hastalıkların Tedavisinde Kullanılan Lokal Kontrollü Salım Sistemlerinin İncelenmesi Y. Lisans Proj. Aysu Yurdasiper, Araş. Gör. Nonsteoridal Antienflamatuvar İlaçlar (NSAID) Kullanılarak Mikrojel Formülasyonlarının Hazırlanması ve İn Vitro İn Vivo Değerlendirilmesi Y. Lisans Proj. Taner Şenyiğit, Araş. Gör. Kortikosteroitlerin Dermatolojik formülasyonlarının hazırlanması ve in_vitro invivo değerlendirilmesi Y. Lisans Proj. İpek Özcan, Araş. Gör. Kemiğe Hedeflemek için Sentezlenen Biyolojik Parçalanabilen Polimerler Kullanılarak Hazırlanan Nanopartiküler İlaç taşıyıcı sistemlerin tasarımı ve in vitro in vivo değerlendirilmesi Y. Lisans Proj. Diş Hekimliği Fakültesi Serhat Çınarcık, Prof. Dr. Ortodontik Braket Tel Ataşman ve Mini İmplant Vida Başlarının Titanyum Dioksit ile kaplanarak bunlara ağız ortamında ultraviole ışınlar yardımıyla Antibakteriyel Özellik Kazandırılması - Doç. Dr. Özant ÖNÇAĞ Travma Görmüş Genç Sürekli Dişlerde Apeksifikasyon Tedavisinde Kullanılan Farklı Dental Materyallerin Sitotoksisitelerinin Hücre Kültürü Düzeyinde Karşılaştırmalı Olarak Araştırılması AR-FON Doç. Dr. Özant ÖNÇAĞ Apeksifikasyon ve Kök Kanal TÜBİTAK Tedavisinde Kullanılan Kök EBİLTEM Kanal Yıkama 18 Solusyonlarının Ve Kanal Dolgu Patlarının Hücre Kültürü Düzeyinde Sitotoksisite ve Genotoksisitelerinin Karşılaştırmalı Olarak Araştırılması Klorheksidin içeren cam iyonomer siman restoratif materyalinin, çeşitli klorheksidin içeren dental Doç. Dr. Fahinur ERTUĞRUL materyallerle karşılaştırmalı olarak incelenmesi. E.Ü. Diş Hekimliği Fak., pedodonti AD. BAP Fizyoloji Doç, Dr. Ersin O. KOYLU Elektrospin tekniği ile polimer kaplanmış yüzeylere ekilen sinir hücreleri üzerinde nikotinin nöroprotektif BAP etkilerinin incelenmesi 08/ BAM/001 Fen Bilimleri Biyokimya Bölümü Azmi Telefoncu, Prof. Dr. Karbon Nanotüplerle Modifiye Enzimatik ve Mikrobiyal Biyosensörlerin TÜBİTAK Hazırlanması ve Uygulamaları BAP Erhan Dinçkaya Gıda Güvenliğinde büyük önem taşıyan Aflatoksin Analizleri için Elektrokimyasal Empedans Spektrokopisi Esaslı TÜBİTAK Biyosensör Teknolojilerinin Geliştirilmesi BAP Nurdan Pazarlıoğlu, Doç. Dr. Sentetik Polimer Lif Yüzeylerinin Enzimatik/Kimyasal Modifikasyonu ile Nanotekstillerin Geliştirilmesi - Nurdan Pazarlıoğlu, Doç. Dr. Medikal Uygulamalar için Polihidroksialkanoatlara Proteolitik Enzim İmmobilizasyonu - Nurdan Pazarlıoğlu, Doç. Dr. Beyaz Çürükçül Fungus Pycnoporus cinnabarinus’dan Üretilmiş Antibakteriyal Boya ile Yün Liflerinin Boyanması* - 19 Nurdan Pazarlıoğlu, Doç. Dr. Tekstil Sanayinde Kullanılan Sentetik Polimer Mamullerin Medikal Tekstil Materyali olarak Kullanılmak üzere Biyoaktif Bileşiklerle Modifikasyonu - Suna Timur, Doç. Dr. Fonksiyonel Nanopartiküllerin Sentezi, Biyo-görüntüleme ve İşartleme Sistemlerinin Geliştirilmesinde Kullanılmaları, TÜBİTAK Nanobiyoteknolojik Yaklaşımlar ve Kanser DPT Diagnostiğine Yönelik Uygulamalar BAP Kutsal Kesici Bazı Diatomelerin (Bacillariophyceae) izolasyonu, Kültürü ve Polimerik Malzemelerde Katkı Malzemesi Olarak Kullanımı - Kimya Bölümü Zekeriya Dursun, Doç Dr. Metal Nanopartikül Modifiye Polipirol Film Elektrotların Hazırlanması ve Elektrokatalitik Etkinliklerinin İncelenmesi TÜBİTAK BİDEP Nursel Acar, Yar. Doç. Dr. Poliaromatik Hidrokarbonların Biyolojik Sistemlerde Varolan Aromatik Biyomoleküllerle ve Bazı İlaç Molekülleriyle Temel ve Uyarılmış Haldeki Etkileşimlerinin Fotofiziksel ve Hesapsal Yöntemlerle İncelenmesi BAP 09/BİL/007 Nükleer Bilimler Bölümü Perihan Ünak, Prof. Dr. Radyoiyot, Radyoiyot işaretli Urasil ve Urasil Glukuronit Konjüge Manyetik Nanoparçacıklar - Perihan Ünak, Prof. Dr. Tc(CO)3+ ile Radyo İşaretli DPenisilamin Bağlı Manyetik Nanoparçacıkların Hazırlanması - Fatma Yurt LAMBRECHT, Prof. Dr. Tümör Görüntüleme Ajanı Olarak Teknesyum-99m İşaretli Bombesin Benzeri BAP 09/BİL/025 Peptid Konjugasyonu; 20 HYNIC-Litorin’in Hazırlanması ve Değerlendirilmesi in vitro Mehmet Bayburt, Yard. Doç. Dr. Kuantum Nokta (QDs) Özellikli Nanoparçacıkların Hazırlanması ve Nükleer Dedeksiyon Sistemlerindeki Uygulama Potansiyelinin Araştırılması - Serap Teksöz, Yar. Doç. Dr. Guanin ve Türevlerinin M(CO)3 + (M=Tc ve Re) korları ile işaretli manyetik özellikli nanoparçacıklarının oluşturulması - Genetik Hastalıkları Araştırma Merkezi Özgür ÇOĞULU, Doç. Dr. Özgür ÇOĞULU, Doç. Dr. Özgür ÇOĞULU, Doç. Dr. Haluk AKIN, Yrd. Doç. Dr. Haluk AKIN, Yrd. Doç. Dr. Maternal Plazmada fetal DNA Analizi ile Fetal RhD nin Saptanması Düşük Materyalinde Matriks Metalo Proteinaz 2 ve 9 Gen Polimorfizmlerinin Araştırılması İnsanda Kuyruk Oluşumuna Yol Açabilecek Gen Bölgelerinin Array-CGH Yöntemiyle Araştırılması Duedonal Ülser Hastalığında Sekretin Gen Ekpresyonunun Araştırılması Spontan Abostuslarda VEGF Gen Polimorfizmlerinin Araştırılması BAP 09/GHUM/002 BAP 09/GHUM/003 BAP 09/GHUM/004 BAP 09/GHUM/001 BAP 09/GHUM/005 * E.Ü’de biyomühendislik, biyomedikal mühendisliği ve biyoteknoloji alanında çalışmakta olan ve projeler yürüten Fen Bilimleri, Mühendislik ve Tıp Fakültelerinde görev yapmakta olan ve yukarıdaki Tablo’ya eklenebilecek bir çok öğretim üyesi bulunmaktadır. Yukarıdaki Tablo, EBİLTEM’in “Sağlık konusunda projeleri olan araştırmacılara” yaptığı çağrıya cevap ileten öğretim üyelerinin isimlerini içermektedir. Bu girişim, konuyla ilgili çalışmaları olan tüm araştırmacılara açıktır. 21 4.2 İ.Y.T.E. BİYOMÜHENDİSLİKLE İLİŞKİLİ BÖLÜMLER ve ARAŞTIRMALAR BİYOTEKNOLOJİ VE BİYOMÜHENDİSLİK ANABİLİM DALI (İYTE) Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programı içerisindeki temel biyoteknoloji, biyomühendislik, etik alanlarındaki dersler verilecektir. Biyomühendislik doktora programı çerçevesinde biyomekanik, biyotransport, biyoenstrümantasyon, biyomalzemeler, nanobiyoteknoloji vb. Bölümlerin altyapıları haricinde ayrıca Biyoteknoloji ve Biyomühendislik Merkezi Laboratuvarlarının araştırma olanakları kullanılabilir. BİLGİSAYAR MÜHENDİSLİĞİ ANABİLİM DALI (İYTE) Bilgisayar Mühendisliği Yüksek Lisans Programı içerisindeki tıp ve biyolojide bilgisayar uygulamaları alanlarındaki dersler için Bilgisayar Mühendisliği Bölümü öğretim üyesi desteği ve ilgili laboratuvarları kullanma olanağı sağlayacaktır. BİYOLOJİ ANABİLİM DALI (İYTE) Biyoloji Yüksek Lisans Programı içerisindeki moleküler biyoloji, genetik, gen regülasyonu, hücre biyolojisi, makromoleküllerin fonksiyonları ve yapıları, genomik, kanser biyolojisi ve immünoloji alanlarındaki derslerde Biyoloji Bölümü öğretim üyesi desteği ve ilgili laboratuvarları kullanma olanağı sağlayacaktır. ELEKTRİK-ELEKTRONİK MÜHENDİSLİĞİ ANABİLİM DALI (İYTE) Elektronik ve Haberleşme Yüksek Lisans ve Doktora Programları içerisindeki yapay sinir ağları, görüntü işleme, biyoenstrümantasyon ve patern tanıma alanlarındaki derslerde Elektrik-Elektronik Mühendisliği Bölümü öğretim üyesi desteği ve ilgili laboratuvarları kullanma olanağı sağlayacaktır. FİZİK ANABİLİM DALI (İYTE) Fizik Yüksek Lisans Programı içerisindeki yüzey fiziği ve analiz teknikleri, katıların elektrik ve magnetik özellikleri, atomik ve moleküler yapılar alanlarındaki derslerde Fizik Bölümü öğretim üyesi desteği ve ilgili laboratuvarları kullanma olanağı sağlayacaktır. GIDA MÜHENDİSLİĞİ ANABİLİM DALI (İYTE) Gıda Mühendisliği Yüksek Lisans ve Doktora Programı içerisindeki biyomalzeme, enzim mühendisliği, biyolojik sistemlerde modelleme, deneysel tasarım ve biyoproses alanlarındaki derslerde Gıda Mühendisliği Bölümü öğretim üyesi desteği ve ilgili laboratuvarları kullanma olanağı sağlayacaktır. KİMYA ANABİLİM DALI (İYTE) Kimya Yüksek Lisans ve Doktora Programları içerisindeki nanobilim ve nanoteknoloji, yüzey ve arayüzey bilimi, enstrümantal analiz, kristolografi, biyokimya alanlarındaki 22 derslerde Kimya Bölümü öğretim üyesi desteği ve ilgili laboratuvarları kullanma olanağı sağlayacaktır. KİMYA MÜHENDİSLİĞİ ANABİLİM DALI (İYTE) Kimya Mühendisliği Yüksek Lisans ve Doktora Programı içerisindeki ısı, kütle ve momentum transferi, biyokimya mühendisliği, akışkanlar mekaniği, biyomalzeme, biyotransport, biyoreaktör ve biyomühendislik alanlarındaki derslerde Kimya Mühendisliği Bölümü öğretim üyesi desteği ve ilgili laboratuvarları kullanma olanağı sağlayacaktır. MAKİNA MÜHENDİSLİĞİ ANABİLİM DALI (İYTE) Makina Mühendisliği Yüksek Lisans ve Doktora Programı içerisindeki robotik, biyomekanik, hesapsal zeka, olasılıksal muhakeme, biyomalzeme, ısı transferi, sayısal akışkan dinamiği alanlarındaki derslerde Makina Mühendisliği Bölümü öğretim üyesi desteği ve ilgili laboratuvarları kullanma olanağı sağlayacaktır. 23 Tablo 4.3 İYTE’de Biyomühendislik Alanında Çalışma Yapan Öğretim Üyeleri Görev Aldığı Lisansüstü Programlar Yüksek Lisans Derecesi Doktora Derecesi Devrim Balköse Ege Üniversitesi, Kimya Mühendisliği Ege Üniversitesi, Kimya Mühendisliği Kimya Mühendisliği, Biyoteknoloji, Prof. Dr. Durmuş Ali Demir Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fizik Bölümü Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fizik Bölümü Fizik, Biyoteknoloji Prof. Dr. Kayhan Erciyeş University of Salford, Elektronik Mühendisliği Ege Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği, Elektronik ve Haberleşme, Unvan Ad Soyad Prof. Dr. Bilgisayar Mühendisliği Biyoteknoloji Prof. Dr. Levent Artok Çukurova Üniversitesi, Organik Kimya Çukurova Üniversitesi, Organik Kimya Kimya, Biyoteknoloji Prof. Dr. Muhsin Çiftçioğlu Ortadoğu Teknik Üniversitesi , Kimya Mühendisliği Iowa State University, ABD, Kimya Mühendisliği Kimya Mühendisliği, Biyoteknoloji, Prof. Dr. Semra Ülkü Ortadoğu Teknik Üniversitesi , Kimya Mühendisliği Ortadoğu Teknik Üniversitesi, Kimya Mühendisliği Kimya Mühendisliği, Biyoteknoloji, Prof. Dr. Şebnem Harsa Ege Üniversitesi, Gıda Mühendisliği The University of Reading, Whiteknights, Reading, Berkshire, U.K., Gıda Mühendisliği Gıda Mühendisliği, Biyoteknoloji Doç. Dr. Ahmet Eroğlu Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Analitik Kimya Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Analitik Kimya Kimya, Biyoteknoloji Prof. Dr. Ahmet Yemenicioğlu Ankara Üniversitesi, Gıda Mühendisliği Ankara Üniversitesi, Gıda Mühendisliği Gıda Mühendisliği, Biyoteknoloji Doç. Dr. Anne Frary Prof. Dr. Barış Özerdem Doç. Dr. Durmuş Özdemir - Cornell University, Bitki Islahı Biyoloji, Biyoteknoloji Dokuz Eylül Üniversitesi, Dokuz Eylül Üniversitesi, Makina Makina Makina Mühendisliği, Biyoteknoloji Mühendisliği Mühendisliği Ege Üniversitesi, Nükleer Teknoloji Clemson University, Analitik Kimya 24 Kimya, Biyoteknoloji Doç. Dr. Funda Tıhmınlıoğlu Ege Üniversitesi, Kimya Mühendisliği The Pennsylvania State University, ABD, Kimya Mühendisliği Kimya Mühendisliği, Biyoteknoloji, Prof. Dr. Mustafa Güden Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Metalurji University of Delaware, Malzeme Bilimi Makina Mühendisliği, Biyoteknoloji Mühendisliği Doç. Dr. Orhan Öztürk Michigan State University Colorado School of Mines Fizik, Biyoteknoloji Prof. Dr. Sacide Alsoy Altıkaya Ege Üniversitesi, Kimya Mühendisliği The Pennsylvania State University, ABD, Kimya Mühendisliği Kimya Mühendisliği, Biyoteknoloji, Doç. Dr. Serdar Özçelik Ankara Üniversitesi, Fizik Mühendisliği City University of New York, Kimya Kimya, Biyoteknoloji Doç. Dr. Talat Yalçın Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fiziko Kimya Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fiziko Kimya Kimya, Biyoteknoloji Doç. Doç.Dr. Ahmet Koç Oregon State University, Genetik Oregon State University, Genetik Biyoloji, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Ali Çağır Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Organik Kimya University of Virginia, Organik Kimya Kimya, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Alper Arslanoğlu University of East Anglia, Norwick, Moleküler Biyoloji University of Warwick, Biyoloji ve Moleküler Viroloji Biyoloji, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Ayşegül Batıgün Ortadoğu Teknik Üniversitesi University of California Davis Kimya Müh., Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Ayten Nalbant University of Southern California, School of Medicine, Biyokimya ve Moleküler Biyoloji University of Southern California, School of Dentistry, Moleküler Biyoloji ve İmmünoloji Biyoloji, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Banu Özen University of Delaware, Newark, Delaware, Gıda Bilimi Purdue University, West Lafayette, Indiana, U.S.A Gıda Bilimi Gıda Mühandisliği, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Bünyamin Akgül Pennsylvania State University, Genetik Pennsylvania State University, Genetik Biyoloji, Biyoteknoloji Doç. Doç.Dr. Canan Tarı Ege Üniversitesi, Gıda Mühendisliği Illinois Institute of Technology, Chicago,Illinois,ABD, Kimya Mühendisliği Gıda Mühendisliği, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Çağlar Karakaya Clemson University, Botanik Clemson University, Tohum, Toprak ve Çevre Bilimi Biyoloji, Biyoteknoloji 25 Yrd. Doç.Dr. Ekrem Özdemir Drexel Uninersity, Philadelphia, USA, Biyokimya Müh. University of Pittsburgh, Pittsburgh, USA, Kimya Müh. Kimya Mühendisliği, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Ferda Soyer Clemson University, Mikrobiyoloji ve Moleküler Tıp Clemson University, Mikrobiyoloji ve Moleküler Tıp Biyoloji, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Figen Korel Clemson University, Clemson, South Carolina, U.S.A. Gıda Mühendisliği University of Florida, Gainesville, Florida, U.S.A, Gıda Bilimi ve Beslenme Gıda Mühendisliği, Biyoteknoloji Doç.Dr. Figen Tokatli Ortadoğu Teknik Üniversitesi, Gıda Mühendisliği Illinois Institute of Technology, Chicago, Illinois, ABD, Kimya Mühendisliği Gıda Mühendisliği, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Gülşah Şanlı Virginia Commonwealth University, School of Medicine , Biyokimya Florida State University, Department of Chemistry, Biyokimya Kimya, Biyoteknoloji Doç. Dr. Oğuz Bayraktar West Virginia University, Morgantown, West Virginia , ABD, Kimya Mühendisliği West Virginia University, Morgantown , West Virginia , ABD, Kimya Mühendisliği Kimya Mühendisliği, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Ritchie Curtis Eanes - Clemson University, Kimya Kimya, Biyoteknoloji Doç.Dr. Sami Doğanlar Cornell University, Bitki Yetiştirme ve Genetik Bölümü Cornell University, Bitki Islahı ve Genetik Bölümü Biyoloji, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Serdar Özen Rensselaer Polytechnic Institute, Elektrik Mühendisliği Rensselaer Polytechnic Institute, Elektrik Mühendisliği Elektronik ve Haberleşme Mühendisliği, Biyoteknoloji Doç.Dr. Serhan Özdemir Illinois Institute of Technology, University of Florida, Makina Mühendisliği Makina Mühendisliği, Biyoteknoloji Makina ve Uzay Mühendisliği Yrd. Doç.Dr. Sevcan Ünlütürk Illinois Institute of Technology, Chicago, Illinois, ABD, Kimya Mühendisliği Illinois Institute of Technology, Chicago, Illinois, ABD, Kimya Mühendisliği Gıda Mühendisliği, Biyoteknoloji Yrd. Doç.Dr. Bilge Karaçalı North Carolina State University, Elektronik Mühendisliği North Carolina State University, Elektronik Mühendisliği Elektronik Haberleşme Mühendisliği 26 Tablo 4.4 İYTE’de Tamamlanmış veya Halen Yürütülmekte Olan Biyomühendislik Alanı ile İlgili Projeler Sır a Proje Kodu Proje Adı Proje Yürütücüsü 1 1996 DPT 96K120240 “Doğal Zeolitlerden Seramik Üretimi” Prof. Dr. Semra Ülkü 2 1996-İYTE AFP “Mikrobiyal yolla üretilen bazı enzimlerin saflaştırılması” Prof. Dr. Şebnem Harsa 3 DPT 98K122120 “Biyomalzemelerin Hazırlanması, Karakterizasyonu ve Kullanımı” Prof. Dr. Şebnem Harsa No Prof. Dr. Muhsin Çiftçioğlu 4 1999-İYTE MÜH 05 “Depolanacak ve işlenecek meyve ve sebzelerin kalite ve raf ömrünün artırılmasında düşük sıcaklıkta ısı uygulamalarının kullanılması” Doç. Dr. Ahmet Yemenicioğlu 5 1999-İYTE MÜH 03 “Peyniraltı Suyundan L(+)-laktik Asit Fermentasyonu” Prof. Dr. Şebnem Harsa 6 2001-İYTE FEN 20 “Türkiye mikroorganizma florasının moleküler karakterizasyonu” Doç. Dr. Ali F. Yenidünya Prof. Dr. Şebnem Harsa 7 2001-İYTE MÜH 04 “L(+)-laktik Asit Üretimi ve Saflaştırılması” Prof. Dr. Şebnem Harsa 8 2002-İYTE 12 “Ticari olarak kullanılabilecek niteliklere sahip pektin metilesteraz ve polifenol oksidazın tarım endüstrisi atıklarından üretilmesi” Prof. Dr. Ahmet Yemenicioğlu 9 2002-İYTE 09 “Pestisid ile kirlenmiş toprakların arıtılmasında biyosurfaktanların etkileri” Yrd. Doç. Dr. Handan Ertürk 10 2002 IYTE 16 “Asimetrik Membran Kaplı Kontrollü İlaç Salım Sistemlerinin Geliştirilmesi” Prof. Dr. Sacide A. Altınkaya 11 2002 DPT “Metal Sabunları Üretimi ve Prosesinin Geliştirilmesi” Prof. Dr. Devrim Balköse 12 2002 İYTE 15 “Timol ve karvakrol gibi fenollerin zeolit katalizörler kullanarak sıvı fazda oksidasyonu ile thymoquinone üretimi” Doç. Dr. Oğuz Bayraktar 13 2002 IYTE 17 “Fibroin/ Hyaluronic asit- zeolit matrikslerin transdermal yakılarda ilaç rezarvuarı olarak iyontoforetik yöntemle kullanılması” Yrd. Doç.Dr. Ayşegül Batıgün 14 2002-TÜBİTAK MİSAG 221 “Biyoprezervatifler Kullanılarak Antimikrobiyel ve Antioksidant Etkisi Bulunan Çok Fonksiyonlu Gıda Ambalajlarının Üretilmesi” Prof. Dr. Ahmet Yemenicioğlu 15 DPT 2002K120390 “Doğal Bacillus suşlarının cry genlerinin tanımlanması ve klonlanması ve çok amaçlı kristal Doç. Dr. Ali F. Yenidünya 27 proteini üretimi için metodların geliştirilmesi” Prof. Dr. Hatice Güneş Prof. Dr. Şebnem Harsa 16 17 DPT 2003K120690 2003-TÜBİTAK TOGTAG-3163 18 19 2003-İYTE 35 2003-İYTE 01 “Sanayilik domateslerde AB-QTL (Advanced Backcross Quantitative Trait Loci) analizler: tarımsal, biyolojik, insan sağlığı ve teknolojik öneme sahip karakterleri kontrol eden genlerin yabani domates türlerden belirlenmesi” Doç. Dr. Sami Doğanlar “Bazı kültür ve yabani domates, biber ve patlıcan türlerinde antioksidant özelliği olan karakter ve diyet lifi içeriği için mevcut genetik varyasyonun tayin edilmesi ve bu karakterleri kontrol eden genlerin moleküler haritalanması” Doç. Dr. Sami Doğanlar “Peynir suyunun seramik membranlar kullanılarak bileşenlerine ayrıştırılması” Prof. Dr. M. Çiftçioğlu “Biyomalzeme yüzeyinde biyofilm oluşturan bakterlerin izolasyonu ve bağlanma mekanizmalarının araştırılması” Prof. Dr. Hatice Güneş Prof. Dr. Ahmet Yemenicioğlu Prof. Dr. Ahmet Yemenicioğlu Prof. Dr. Şebnem Harsa Prof. Dr. Şebnem Harsa 20 2003-İYTE 50 “Alkalifilik Bacillus suşlarından alkali proteazların üretimi üzerine çalışmalar” Doç. Dr. Canan Tarı 21 2003-İYTE 36 “Hidroksiapatit/kitosan kompozitlerinin hazırlanması ve karakterizasyonu” Prof. Dr. Muhsin Çiftçioğlu “Peynir suyunun seramik membranlar kullanılarak bileşenlerine ayrıştırılması” Prof. Dr. Şebnem Harsa 22 2003-İYTE 35 Prof. Dr. Şebnem Harsa Prof. Dr. Muhsin Çiftçioğlu 23 2003-İYTE 51 “Peynir suyundan laktik asit eldesinin kinetik modeli” Doç. Dr. Figen Tokatlı 24 2004-İYTE 08 “Sıvı ortam küf fermentasyonunda morfolojiye etki eden oksijen transferinin incelenmesi ve matematiksel modellenmesi” Yrd. Doç. Dr. Sevcan Ünlütürk Doç. Dr. Canan Tarı 25 2004-İYTE 04 “Aspergilus sojae morfolojisinin pektinaz enzimi üzerine olan etkisi ve fermentasyon koşullarının optimizasyonu” Doç. Dr. Canan Tarı 26 2004-İYTE 22 “Fototrofik mikroçoğaltma yöntemiyle Türkiyenin bazı gıda bitkilerinin üretilmesi” Yrd. Doç. Dr. Handan Ertürk 27 2004-İYTE 05 “Bitkisel kökenli materyallerden antioksidan proteinlerin karakterizasyonu ve modifikasyonu” Prof. Dr. Ahmet Yemenicioğlu 28 2004-İYTE 20 “Süt ve süt bazlı ürünlerden laktik asit bakterilerinin izolasyonu, tanmlanması, ve laktaz enzimi üretim yeteneklerinin araştırılması” Prof. Dr. Şebnem Harsa “Biyo bozunur Polilaktid Bazlı Polimerlerin Sentezi Doç. Dr. Funda Tıhmınlıoğlu 29 2004 İYTE-BAP 02 ve Karekterizasyonu” 28 Prof. Dr. Hatice Güneş 30 2005-İYTE BAP “Türkiye’de Yetişen Bazı Bitkilerin Antioksidan ve Antimikrobiyal Özelliklerinin Tesbiti” Yrd. Doç. Dr. Banu Özen 31 2005-İYTE BAP “Antimikrobiyal Özelliğe Sahip Yenebilir Filmlerin Geliştirilmesi ve Plastik Ambalaj Materyalleri ile Birleştirilmesi” Yrd. Doç. Dr. Figen Korel 32 2005-İYTE BAP “Değişik Coğrafi Bölgelerde Üretilen Türk Zeytinyağlarının Fenolik Bileşiklerine Göre Sınıflandırılması” Yrd. Doç. Dr. Figen Tokatlı 33 2005-TÜBİTAK Kariyer projesi “Doğal antimikrobiyallerin kullanıldığı bioaktif gıda koruma sistemleri geliştirilmesi” Yrd. Doç. Dr. Banu Özen 34 DPT-YUUP 2005K120570 “Süt Sanayii için peynir ve yoğurt kültürleri ile laktaz enzimi üretimi: Laktoz tahammülsüzlüğüne karşı geleneksel ve modern çözümler” Prof. Dr. Şebnem Harsa 35 2005-TÜBİTAK “Sıvı yumurta ürünlerinin Ultra Viole (UV) Işık ile dezenfeksiyonu” Yrd. Doç. Dr. Sevcan Ünlütürk TOVAG 104 O 210 36 2005-İYTE BAP “Süt ve süt ürünlerinde hızlı antibiyotik test kitlerinin geliştirilmesi” Yrd. Doç. Dr. Canan Tarı 37 2005-TÜBİTAK TOVAG “Ekonomik değeri yüksek zeytinlerden üretilen Türk zeytinyağlarının sınıflandırılması ve zeytinyağlarında tağşişin belirlenmesi” Doç. Dr. Figen Tokatlı 38 2005-TÜBİTAK Yrd. Doç. Dr. Figen Korel MAG “Laktik asit bakterileri, lisozim ve laktoperoksidaz kullanılarak antimikrobiyal özellik taşıyan yenebilir filmlerin geliştirilmesi, plastik ambalaj materyallerine ve çeşitli gıdalara uygulanması” 39 2005-TÜBİTAKTOVAG-COST 928 (104 O 270) “Süt ürünlerimizden izole edilen mikroorganizmalardan laktaz enzimi üretimi, saflaştırılması ve immobilizasyonu” Prof. Dr. Şebnem Harsa 40 2005 İYTE 32 “Hemodiyaliz membranların hazırlanması, karakterizasyonu ve test edilmesi” Prof. Dr. Sacide A. Altınkaya 41 2005 İYTE-BAP 34 “Kimyasal Çapraz Bağlama ile Kitosan Bazlı Hidrojellerin Hazırlanması ve Biyomalzeme Olarak Uygunluğunun Araştırılması” Doç. Dr. Funda Tıhmınlıoğlu 42 2009İYTE03 “Protein Nanotüpleri Geliştirilmesi Amacıyla Peyniraltı Suyundan Alfa-Laktalbumin İzolasyonu ve Saflaştırılması” Prof. Dr. Şebnem Harsa 29 4.3 D.E.Ü. BİYOMÜHENDİSLİKLE İLİŞKİLİ BÖLÜMLER ve ARAŞTIRMALAR ELEKTRIK VE ELEKTRONİK MÜHENDİSLİĞİ ANABİLİM DALI (DEÜ) Biyomatematik, biyomedikal işaret ve görüntü işleme, biyomedikal gömülü sistemler, sistemsel biyoloji, yapay sinir ağları ve örüntü tanıma konularında dersler verilecek ve laboratuar olanakları kullanıma açılacaktır. BİLGİSAYAR MÜHENDİSLİĞİ ANABİLİM DALI (DEÜ) Bilgisayar Mühendisliği Yüksek Lisans Programı içerisindeki tıp ve biyolojide bilgisayar uygulamaları alanlarındaki dersler için Bilgisayar Mühendisliği Bölümü öğretim üyesi desteği ve ilgili laboratuvarları kullanma olanağı sağlayacaktır. SBE MULTİDİSİPLİNER ANABİLİM DALI (DEÜ) Medikal İnformatik ve Biyomekanik Multidisipliner Anabilim Dalları SBE’deki mevcut lisansüstü programlarındaki bazı dersleri önerilen ortak programa sunacaklar ve laboratuarlar kullanma olanağı sağlayacaklardır. SBE BİYOFİZİK ANABİLİM DALI (DEÜ) Beyin biyofiziği, görüntüleme ve uyku dinamiği ile ilgili ders desteği ve laboratuar kulanım desteği sağlayacaklardır. Tablo 4.5 D.E.Ü.’de Biyomühendislik Alanında Çalışma Yapan ve Ortak Programa Destek Verecek Olan Öğretim Üyeleri Unvan Ad Soyad Yüksek Lisans Derecesi Doktora Görev Aldığı Lisansüstü Programlar Prof. Dr. Cüneyt Güzeliş İstanbul Teknik Üniversitesi İstanbul Üniversitesi Teknik Elektrik-Elektronik Müh. Y. Doç.Dr. Güleser Kalaycı Demir DEU Elektrik Elektronik Müh. DEU Elektrik Elektronik Müh. Elektrik-Elektronik Müh. Y. Doç. Dr. Nalan Özkurt DEU Elektrik Elektronik Müh. DEU Elektrik Elektronik Müh. Elektrik-Elektronik Müh. Y. Doç. Dr. Ahmet Özkurt DEU Elektrik Elektronik Müh. DEU Elektrik Elektronik Müh. Elektrik-Elektronik Müh. ve Mekatronik Y. Doç. Dr. Metehan Makinacı DEU Elektrik Elektronik Müh. DEU Elektrik Elektronik Müh. Elektrik-Elektronik Müh. Y. Doç. Dr. Mehmet Kuntalp DEU Elektrik Elektronik Müh. NorthWestern U. ElektrikElektronik Elektrik-Elektronik Müh. 30 Y. Doç. Dr. Yavuz Şenol DEU Elektrik Elektronik Müh. Sussex Universitesi Elektrik-Elektronik Müh. Prof.Dr. Mustafa Gündüzalp Boğaziçi Üniversitesi DEU Elektrik Elektronik Elektrik-Elektronik Müh. Y. Doç. Dr. Damla Kuntalp Illinois Institute Of Technology ElektrikElektronik Müh. Illinois Institute Of Technology ElektrikElektronik Elektrik-Elektronik Müh. Y. Doç. Dr Adil Alpkoçak Ege Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği Ege Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği Bilgisayar Müh. Prof.Dr. Oguz Dicle , Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fak. Radyaloji ABD Doç.Dr. Murat Özgören Ege Üniversitesi Miami Üniversitesi Biyofizik ABD Tıp Fak. Biyofizik ABD * DEÜ’de biyomühendislik, biyomedikal mühendisliği ve biyoteknoloji alanında çalışmakta olan ve projeler yürüten Mühendislik ve Tıp Fakültelerinde görev yapmakta olan ve yukarıdaki Tablo’ya eklenebilecek bir çok öğretim üyesi bulunmaktadır. Yukarıdaki Tablo, önerilen ortak programın kapsamının DEÜ SBE’nün “Biyomekanik” ve “Medikal İnformatik” gibi mevcut programları ile çakışmaması amacıyla sadece ortak programda kapsanması planlanan biyomedikal işaret işleme, enstrümantasyon ve biyoinformatik konularında eğitim ve araştırma etkinliği yürüten öğretim üyeleri göz önüne alınarak oluşturulmuştur. 31 Tablo 4.6 D.E.Ü.’de Tamamlanmış veya Halen Yürütülmekte Olan Biyomühendislik Alanı ile İlgili Projeler Proje Kodu Proje Adı Proje Yürütücüsü TUBITAK EEAG 104E178 Radyal Tabanlı Ağlar ile Tıbbi Hacim Bölütleme ve Klinik Uygulamalarda Kullanılan Bir Tıbbi Görüntüleme Sistemine Entegrasyonu Prof.Dr.Cüneyt GÜZELİŞ TUBİTAK 107E217 Sayısal Mamografi Görüntüleri için İçerik tabanlı Tıbbi Görüntü Erişim Sistemi Yard.Doç.Dr. Adil Alpkoçak DEU-BAP 2008.KB.FEN.034 Sanal Mikroskopiye Yönelik Görüntüleme Sistemi Tasarımı Yrd.Doç.Dr. Güleser K. Demir DEU-BAP Mühendislik Ve Tip Alaninda Sanal Gerçeklik Kullanarak Eğitim Ve Tasirim Ortamlari Geliştirilmesi Yrd.Doç.Dr.Ahmet Özkurt, DEU-BAP 03.KB.FEN.010 Biomedikal Laboratuarının Kurulumu Yard.Doç.Dr. Mehmet Kuntalp DEU-BAP 03.KB.FEN.011 ECG Kayıtlarından Ani Ölüm Riskinin Tahmini Yard.Doç.Dr. Mehmet Kuntalp DEU-BAP Ekg Kayıtlarından Genel Amaçlı Otomatik Aritmi Sınıflandırma Sistemi Yard.Doç.Dr. Mehmet Kuntalp Çekirdek Tabanli Gözü Kapalı Kaynak Ayriştirma Yöntemi İle Görüntü Analizi Yrd.Doç.Dr. Nalan Özkurt Uyaran Parametrelerinin EEG’de Dinamik Etkileri Doç.Dr. Murat Özgören Uyku Dinamiğinin Çoklu Uyaranlarla İncelenmesi Doç.Dr. Murat Özgören 2008.KB.FEN.027 2007.KB.FEN.020 DEU-BAP 2006.KB.FEN.038 DEU-BAP 2006.KB.SAG.017 DEU-BAP 2007.KB.SAG.061 DEU-BAP 2007.KB.SAG.065 TUBİTAK 1085113 Bilinç Düzeyi Deişikliklerinin Beyin Biyofiziği Yöntemleri ile İncelenmesi Doç.Dr. Murat Özgören Duyusal Engelli Bireylerde Beyin Plastisite ve Kapasite Kullanımının Elektrofizyolojik İrdelenmesi Doç.Dr. Murat Özgören * DEÜ’de biyomühendislik, biyomedikal mühendisliği ve biyoteknoloji alanında gerçekleştirilen bir çok araştırma projesi bulunmaktadır. Yukarıdaki Tablo’ya sadece ortak programda DEÜ tarafının sunacağı dersler ve araştırmalar ile ilgili olanlar alınmıştır. 32 BÖLÜM 5. BÖLGE ÜNİVERSİTELERİNDE BİYOMÜHENDİSLİK ARAŞTIRMALARI İÇİN VAROLAN FİZİKSEL ALTYAPI 5.1 Labaratuvarlar ve Cihazlar: Tablo 5.1 Ege Üniversitesi’nde Mevcut Cihazların Listesi ADI BULUNDUĞU YER Sayı Soğutmalı set üstü santrifüj (1.5 -250 ml hacimli tüpler, 96,24, 6 gözlü kültür plakaları ile kullanılabilir, maksimum 5.000 rpm, g/ rpm çevirimli) Müh. Fak./Biyomüh. 1 Floresan mikroskop, inverted, Müh. Fak./Biyomüh. 1 İnverted ışık mikroskobu Müh. Fak./Biyomüh. 1 Binoküler mikroskop Müh. Fak./Biyomüh. 1 CO2 inkubatör Müh. Fak./Biyomüh. 1 İnkubatör Müh. Fak./Biyomüh. 1 Vertikal akışlı laminar akışlı kabin (Sınıf II) Müh. Fak./Biyomüh. 1 Derin dondurucu Müh. Fak./Biyomüh. 2 o (-20-30 C) (tezgah altı) UV-vis. mikroplaka okuyuculu spektrofotometre Müh. Fak./Biyomüh. 1 Kesintisiz Güç Kaynağı (Jeneratör) Müh. Fak./Biyomüh. 1 Çift Kapılı Dik Tip -86C Derin Dondurucu Müh. Fak./Biyomüh. 1 Saf su + Ultra Saf Su Cihazı Müh. Fak./Biyomüh. 1 Sirkülatörlü Su Banyosu Müh. Fak./Biyomüh. 1 pH/İyonmetre Müh. Fak./Biyomüh. 1 Otoklav Müh. Fak./Biyomüh. 1 Sıvı Azot Depo Tank Sistemi Müh. Fak./Biyomüh. 1 Sıvı Azotlu Örnek Saklama Tankı Müh. Fak./Biyomüh. 2 33 Sıvı Azotlu Örnek Taşıma Tankı Müh. Fak./Biyomüh. 1 Vorteks Müh. Fak./Biyomüh. 1 Thermomixer Müh. Fak./Biyomüh. 1 Isıtıcılı Manyetik Karıştırıcı Müh. Fak./Biyomüh 2 Karıştırmalı biyoreaktör Müh. Fak./Biyomüh. 7 (değişik hacimlerde-50ml5L) Analitik terazi Müh. Fak./Biyomüh. 1 Vakum pompası Müh. Fak./Biyomüh. 1 Membran filtrasyon sistemi Müh. Fak./Biyomüh. 1 (tam değil) Glikozimetre Müh. Fak./Biyomüh. 34 1 Tablo 5.2 İ.Y.T.E.’de Mevcut Laboratuarlar ve Cihazların Listesi Laboratuar Adı Alan (m2) Cihaz Adı Merkezi Biyomühendislik Laboratuvarı 315 Karbondioksit inkübatörü, yüksek hızlı soğutmalı santrifuj, biyogüvenlik kabini, dikey yatay elektroforez sistemi (250 V, 500 mA), elektroforez güç kaynağı, miniblot modülü, minicell primo submarine jel sistemi, midicell primo submarine gel sistemi, dikey mini jel elektroforez sistemi, çalkalamalı su banyosu, çalkalamalı soğutmalı inkübatör, ultrasonik homojenizatör, ultrasonik temizleyici, kuru blok soğutucu ve ısıtıcı, peristaltik pompa, buzdolabı, pH metre, digital kuru blok ısıtıcı, otoklavlanabilibir otomatik pipet seti, masaüstü vorteks karıştırıcı, ısıtıcılı manyetik karıştırıcı, sabit hacimli otomatik pipet seti, şarjlı cam pipet pompası, otoklav, derin dondurucu, buz makinesi, buzdolabı, inverted faz kontrast mikroskop, flow cytometry, santrifuj rotoru, soğutmalı ultrasantrifuj, sabit açılı titanyum rotoru, masaüstü soğutmalı santrifuj, açılır tip titanyum rotor Merkezi Biyoteknoloji Laboratuvarı 300 Modüler temiz oda, Fermentör, Soğutmalı Santrifüj, Soğutmalı çalkalamalı inkübatör, -80 °C derin dondurucu, spektrofotometre, jel görüntüleme sistemi, Real-Time PCR, Filtrasyon Sistemleri, Çoklu Fermentör, HPLC, GC, DNA Sekans Cihazı, PFGE, FPLC, Faz Kontrast ve diğer Mikroskoplar, PCR, Elektroporatör, Elektrforezler, PI ölçüm Cihazı Merkezi Spektroskopi Laboratuarı 150 LC-MS, Maldi-Toff-MS, 2-D Elektroforez (tüm proteomik çalışmaları için) Bitki Doku Kültürü Lab. 45 Sıcaklık ve nem kabini, Temiz oda, Jel görüntüleme sistemi Proje laboratuarıBiyomalzeme 50 Etüvler, Karıştırıcılar, Mikrofiltrasyon, Liyofilizatör, Püskürtmeli Kurutucu Proje laboratuarı 15 Zeta Potansiyel Ölçüm Cihazı Malzeme Karakterizasyon Laboratuvarı 150 Taramalı Elektron Mikroskop (SEM), X ışınları Kırınım Cihazı (X-RD), Universal Test Cihazı, Atomik Kuvvet Mikroskobu ICP laboratuarı 20 ICP cihazı Biyokimya Lab. 25 Vakumlu Etüv, Su Banyoları, Penetrometre, Dijital refraktometre, Liyofilizatör, Türbidimetre Mikrobiyoloji Lab. 45 Laminer Akışlı Kabin, Otoklavlar, CO2 İnkübatörü, Soğutmalı İnkübatör, Soğutmalı Makrosantrifüj Örnek Hazırlama Lab. 45 Çeker Ocaklar, Soğutucular, Kheltech Protein Tayin Cihazı, Su banyoları, Sterilizatör, Döner Vakumlu Buharlaştırıcılar, Bidistile S.S. Enstrümental Analiz Lab. 50 UV-VIS Spektrofotometreler, HPLC Deiyonize Su Ünitesi 15 Deiyonize Su Ünitesi Fermentasyon Lab. 30 Fermentörler, Çalkalamalı inkübatör, Soğutmalı Mikrosantrifüj Kromatografi kolonları, Fraksiyon toplayıcı, Otomatik Titratör, Zeta Potansiyometre 35 Elektroforez, Dijital refraktometre, Derin Dondurucu, pH metre Araştırma Lab. I 60 Fırınlar, Karıştırıcılar, Buz makinesı Gaz Kromatografi Lab. 35 Gaz Kromatograflar, Reaktörler Tane Boyutu Analiz Lab. 20 Tane Boyutu Analiz Cihazı Lisans laboratuarı 70 Lisans Öğrenci Deney Setleri Mikrokolorimetri Laboratuvarı 20 Calve tipi Mikrokolorimetre Proje Laboratuvarı II 60 PVC Termomat Manyetik Askılı Terazi Araştırma Laboratuvarı II 60 Vakum Etüvler, Film Aplikatörü, Nem ve Sıcaklığı Kontrol Edebilen Kabin, Pres Karıştırıcılar Spektroskopi Laboratuvarı 25 IR Spektrometre, UV-VIS Spektrofotometre, HPLC, Optik Mikroskoplar Termal Analiz Laboratuvarı 25 DTA-50, TGA-51, DSC-50 Yüzey laboratuarı 15 Mikromeritics ASAP-2000 Araştırma laboratuarı III 70 BOD, COD Ölçer Proje Laboratuvarı I 40 Ekstruder Plastograf Hücre Kültürü Lab. 60 Hücre Santrifüjü, Mikrosantrifüj, Işık mikroskobu, Laminer Akışlı Kabin, Karbondioksitli İnkübatör, Inverted Mikroskop, Buzdolabı, ELISA Okuyucu, Densitometre, Su Banyosu, pH metre, Manyetik Karıştırıcı, Terazi, Hassas Terazi, Etüv, Soğutmalı Mikrosantrifüj, Doku Homojenizatörü Moleküler Biyoloji Lab. 60 Mikrosantrifüj, Buzdolabı, -20 Derin Dondurucu, -80 Derin Dondurucu, Etüv, Yüksek Devirli Santrifüj, PCR aleti (thermal cycler), Transilluminatör, Polaroid Kamera, Horizantal Jel Elektroforez Setleri, Mini Vertikal Jel Elektroforez Seti, Çeker Ocak, Mikrodalga Fırın, Otoklav, Hücre santrifüjü Moleküler Mikrobio.Lab. 60 Manyetik Karıştırıcılar, Etüv, PCR Aleti (thermal cycler), Pulsefield Jel Elektroforez Seti Moleküler Spektr. Lab. I 60 Gaz Kromatograf-Kütle Spektrometre (GC-MS) Moleküler Spektrometri Lab. II 60 Yakın İnfrared Spektrometre (NIR), Fourier Dönüşümlü Infrared Spektrometre (FT-IR), UV-VIS Spektrometre (2 adet) Kromatografi Lab. 60 Gaz Kromatograf (GC) (FID, ECD Oto örnekleyici aksesuarlarıyla birlikte)Yüksek Basınç Sıvı Kromatograf (HPLC) (Diode Array Detector, DAD, ile birlikte) Atomik Spektrometri Lab. 60 Atomik Absorpsiyon Spektrometre (AAS) (Alevli AAS, FAAS; Grafit fırın GFAAS) Organik Kimya Ar. Lab. 80 Yatay Tüp Fırın, Yüksek Basınçlı Reaktör 36 Tablo 5.3 D.E.Ü.’de Mevcut Laboratuarlar ve Cihazların Listesi Laboratuar Adı Alan (m2) Cihaz Adı Biyomedikal Laboratuarı 45 Portatif EKG Kayıt Cihazı (12 kanal yorumlu EKG yapabilen kalp grafiği cihazı), Genel Amaçlı Biyomedikal İşaret Kayıt Cihazı (EKG, EEG, EMG, EOG, vb. biyomedikal kökenli işaretlerin kayıt edilmesi, işlenmesi ve görüntülenmesi için kullanılabilen genel amaçlı bir biyomedikal işaret kayıt cihazı), yazıcı, sunucu bilgisayarı sistemi ve bilgisayarlar Akıllı Sistemler ve Kontrol Laboratuarı 100 Araştırma Mikroskobu (Işık), 3 boyut hareket kabiliyetli robot (nano ölçekte), CCD kamera, çeşitli kabiliyetlerde PLC’ler, operator panel ,çeşitli sensörler, yakıt hücre setleri, veri toplama kartları. İleri Mikroelektronik Laboratuvarı 100 Çok işlemcili, yüksek görüntüleme kabiliyetine sahip ve paralel işlem yapabilen iş istasyonu, programlanabilir 50Mhz Sinyal Jeneratörü, 450 Mhz, karışık işaret osilaskobu (MSO), 100 Mhz, sayısal işaret osilaskobu (DSO), laboratuvar tipi güç kaynağı, 36 Kanal 1Ghz. Sayısal Çözümleyici (Logic Analyzer), programlanabilir 32 Kanal örüntü üreteci (Pattern Generator), baskı devre CNC cihazı, çok katlı baskı devre presi, 1 adet delik içi kaplama fırını, sıvı lehimleme fırını, kameralı baskı devre SMD baskı devre yerleştirme istasyonu, ESD uyumlu lehimleme ve lehim sökme istasyonu, baskı devre gönye kesme için tezgah üstü testere Sanal Gerçeklik Laboratuarı 20 Çeşitli boyutlarda LCD monitörler, çeşitli Head Mounted Display’ler, Hareket İzleyici (Motion tracker) ve izleyici Multimedya Lab. 30 İş İstasyonu, sunucular ve multimedya yazılımlar. Görüntüleme Lab. 30 İş istasyonları, Curry, sLoreta,Loreta gibi yazılımlar Beyin Biyofiziği Lab. 30 Neuroscan & Nsstim & matlab Stim PC, kamera, monitör, sayısal ECG, somatosensorial stimulus birimi, olfactorial stimulus birimi, A3 scanner, EEG kayıt birimi Uyku Dinamiği 30 Nicoletone v32 polysomnography & BIS, Neurofax, Matlab Stim ve Matlab Analiz PC * Ayrıca laboratuvarlarda alt yapı destek cihazları olarak fırınlar, etüvler, inkübatörler, teraziler, su banyoları, vakum pompaları, pH metreler, mikserler, viskozimetreler, reaktörler, kriyostat, elekler, ultrasonik banyolar, bilyalı değirmenler ve su üretim sistemleri bulunmaktadır. 37 5.2 Bilgiye Erişim Altyapısı: Her 3 üniversite, uzaktan erişimli online servisler içeren bilgi altyapısına sahiptir. Online katalog ve biyomühendislik ile ilgili konu başlıklarında çeşitli basılı ve online dergiler, her 3 üniversitede de mevcuttur. Üniversitelerimizin tamamlanmış yüksek lisans, doktara, tıpta uzmanlık vb. tezlerin yanısıra araştırma projelerininde oluşturduğu koleksiyonlara, elektronik ortamda tam metin olarak erişilebilmektedir. Bütün kaynakların erişime açık olduğu, kütüphane web sitelerinin adresleri aşağıdadır. Ege Üniversitesi http://kutuphane.ege.edu.tr/ İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü http://library.iyte.edu.tr/ Dokuz Eylül Üniversitesi http://www.deu.edu.tr/DEUWeb/Icerik/Icerik.php?KOD=109 38