DERS ÖĞRETİM PLANI Dersin Kodu Dersin Adı MBT212 Biyokimya II Dersin Türü Zorunlu Yıl 2 Yarıyıl 4 AKTS 6 Dersin Seviyesi Lisans Dersin Amacı Amaç: Öğrenciler hücresel bölümlendirmenin ve regülasyonu ile ilgili bilgilerin yanı sıra, proteinler, lipidler moleküler ve hücresel fonksiyonların temel anlayışını ve metabolizmayı öğreneceklerdir. Dersi Veren Öğretim Görevlisi / Görevlileri Öğretim Türü Örgün Eğitim Dersin Ön Koşulu Olan Dersler Biyokimya I Dersin İçeriği Giriş: peptidler, protein katlanması: Kovalent olmayan zayıf etkileşimler Tripsin inhibitörünün katlanması Şaperon: GroEL ve GroES Amino asit ve protein analizi: immünoblot, iki boyutlu elektroforez afinite kromatografisi, jel kromatografisi, tuz çökelmesi Protein karakterizasyonu: antikor yapısı, B hücreleri ve T hücreleri, monoklonal antikorların seçilmesi Primer dizi tayini: uç grup analizi, amino asidi bileşimi, tek tek alt birimlerin parçalanması, Edman bozundurması, proteom Proteinler: miyoglobin, hemoglobin, T ve R, konformasyon, orak hücre anemisi işlevi Enzim kinetiği: Michaelis-Menten, enzimatik kataliz mekanizmaları Biyolojik zarlar: eritrosit membran, membran proteinleri, glikoproteinler Biyolojik membranlar yoluyla taşıma: salgılama ve ekzositoz, mitokondri, membran taşıma Kolaylaştırılmış difüzyon kinetiği, iyonoforlar (gramicidin), giriş Lipoproteinler: Triasilgliserollerin taşınması LDL: model alıcı endositoz, geri dönüşüm Yağ asidi metabolizması: parçalanma: düzenleme, enerji dengesi Yağ asidi metabolizması: yağ asidi sentaz döngüsü karşılaştırma bozulması / biyosentez Araşidonik asit metabolizması: prostaglandinler, prostasiklinler, tromboksanlar Enerji metabolizması: Genel serbest enerji, ATP, kreatin, enerji şarj Enerji metabolizması: glikoliz, seçilen enzim mekanizmaları ve protein yapılarının karşılaştırılması, glikoliz ve glukoneojenez, piruvat dekarboksilaz Enerji metabolizması: glikoliz, glukoneogenez, Fosfofruktokinaz düzenlenmesi Krebsz döngüsü (trikarboksilik asit döngüsü): Düzenleme mitokondriyal membran taşıma Membrana bağlı ATP sentezi: elektron taşıma proton gradyan, bakteriyorodopsin, mitokondriyal elektron taşıma zinciri, ATPaz: Dönme mekanizması Pentoz fosfat döngüsü: oksidatif ve oksidatif olmayan dal Toksik radikallere karşı korumak için hücresel mekanizmalar t, glutatyon redüktaz Amino asitlerin dağılımı: üre döngüsü, birleştirme üre döngüsü-sitrat döngüsü, metabolizma koordinasyonu, Glikojen metabolizması ve hücresel sinyal iletimi Ders Kitabı/ Malzemesi / Önerilen Kaynaklar Voet, Donald / Voet, Judith G. / Pratt, Charlotte W. Lehrbuch der Biochemie, Herausgegeben von Beck-Sickinger, Annette / Hahn, Ulrich Lehninger Biochemie, David L. Nelson Michael M. Cox (Lehninger Principles of Biochemistry, Fourth Edition 4th Edition by David L. Nelson (Author), Michael M. Cox (Author)) Değerlendirme Dersin Sunulduğu Dil Almanca Staj Durumu İş Yükü Hesaplaması