ARRAY CGH TEKNOLOJİSİ VE BLASTOKİST TRANSFERİ. DÜNÜ, BUGÜNÜ VE YARINI Prof. Dr. Muhterem BAHÇE Preimplantasyon Genetik Tanı; YÜT sonuçlarını arttırmak Tekrarlayan gebelik kayıplarını azaltmak Kalıtsal hastalıkları önlemek 3.Gün biyopsi ve FISH analizleri Hipotez: Embriyoların %50 si kromozomal olarak anormal ise normal embriyoların transferi implantasyonu 2 kat arttırmalıdır. (Munné et al. 1993) Sonuç: 3.gün biyopsi ve FISH analiz sonuçları beklentiyi karşılamıyor ve PGT nin tüm potansiyelini gösteremiyor. 3. Gün biyopsisi ve FISH analizinde karşıt veriler Pozitif etki Gianaroli et al. 1999 Munné et al 1999 Gianaroli et al 2001a Gianaroli et al. 2001b Munné et al. 2003 Gianaroli et al. 2004 Munné et al. 2005 Munné et al 2006 Verlinsky et al. 2005 Colls et al. 2007 Garrisi et al. 2009 Rubio et al. 2009 Rubio et al. 2013 * Etki yok Werlin et al. 2003 * Staessen et al. 2004 * Platteau et al. 2005 * Jansen et al. 2008 * Mersereau et al. 2008 * Schoolcraft et al. 2009 * Negatif etki Mastenbroek et al. 2007 * Hardarson et al. 2008 * * CRT Optimal PGD methods for FISH Biopsy media Biopsy time / embryo # cells biopsied Fixation method # chromosomes tested # analysts / case Reanalysis no results Large experience Error rate Number of zygotes Optimal Questionable with aminoacids 1 min one Carnoy’s ≥8 2 yes yes <10% >5 simple media > 5 min two Tween 20 6 1 no no 10-50% 5 Munné et al. (2010) Fertil. Steril. 94:408 3. Gün biyopsisi ve FISH analizinde olumsuz sonuçların nedenleri Biyolojik: - Mozaisizm - Self-correction Teknik: - Yeterli sayıda kromozom analiz edilmiyor - Standart olmayan yöntemler - Biopsi basamağı Technical differences: high error rates Technical errors are lab dependent and the best measure to assess a PGD laboratory: Study: Baart et al 2004 Li et al. 2005 Gleicher et al. 2009 Munné et al. 2002 Geraedts et al 2011 Colls et al., 2007 Scott et al. 2012 Magli et al. 2007 Gutierrez-Mateo et al. 2011 Technique FISH FISH FISH FISH array CGH FISH qPCR FISH array CGH Error rate 50.0% 40.0% 15-20% 7.2% 6.0% 4.7% 4.0% 3.7% 1.8% Mozaisizm 592 anormal embriyonun tüm blastomerleri kullanılarak tekrar analiz edilmiş ve: normal <49% anormal 50-99% anormal 100% anormal Colls et al. Fertil Steril 2007;88(1):53–61 13 27 124 528 7% Analiz edilen kromozom sayısı 24-kromozom testleri (CGH, aCGH, etc) FISH-12 ye göre % 50 daha fazla anomali yakalıyor ancak sadece % 20 daha fazla embriyo anormal tanı alıyor. Colls et al. (2009) Reprod Biomed Online 19:532-538 3.gün embriyolarında morfoloji kromozomal anomaliler için uygun belirteç midir? 56% % abnormal embryos Morphology: Maternal age Embryos analyzed: 6054. Morphologically normal embryos: 3751. Source: Munné et al. 2007. Similar results also found by Munne et al 1995, Marquez et al. 2000, Magli et al. 2007. 5.gün embriyolarında morfoloji kromozomal anomaliler için uygun belirteç midir? 55% of best morphology blastocysts were aneuploid Time-laps ile morfoloji anöploidi ile kısmi korelasyon gösteriyor • • • Hızlı ve yavaş gelişen blastosistler benzer anöploidi oranlarına sahip(2) 2.gündeki anöploid embriyoların %30’u öploid embriyolar ile aynı gelişimi gösteriyor(3) Blastula oluşumu anöploid embriyolarda gecikiyor(1,4), ancak hala iyi gelişen blastosistlerin %50’sinde anöploidi mevcut(1) Euploid Euploid Complex abn. Trisomy 21,22 (1) Melzer et al (in press) (2) Stevens et al. (2012), (3) Chavez et al. (2012), (4) Campbell et al. (2013) Time-lapse ve anöploidi: Melzer ve ark.ları (2013) 18 • Only timing of compaction was correlated by aneuploidy Only gross morphological abnormalities (group E) were more likely aneuploid. 14 14 Number of embryos • 16 16 12 11 10 10 9 8 8 7 Aneuploid 6 4 4 3 2 1 0 Category A Category B Euploid Category C Hierarchal Classification Melzer et al. (2013) Reprod Biomed Online, in press Category D Category E Figure 1 Reproductive BioMedicine Online 2013; 27:140-146 Copyright © 2013 Reproductive Healthcare Ltd The previously established three-class aneuploidy risk model applied to embryos with known fetal heart beat outcome (gestational weeks 6–8). Blue crosses represent embryos that resulted in a fetal heart beat and red lines represent embryos that did not result in a fetal heart beat. Area under the ROC curve is 0.75. tSB = time from insemination to the start of blastulation; tB = time from insemination to the formation of a ‘full blastocyst’. … 6.gün öploid embriyolar hala implante olabiliyor • 5.gün morulalar 6. güne kadar kültüre edildiler ve blastosiste ulaştıklarında biyopsi edildiler. • 5 veya 6. günde biyopsi edilen blastosistlerden tek blastosist transferi yapıldı. Day-5 biopsy Implantation: 58% Day-6 biopsy 21% p<0.005 Grifo et al., unpublished 3.Gün ve blastosist biyopsisinin karşılaştırılması Implantation rate cleavage stage biopsy not blastocyst biopsy not 31% 52% P<0.05 53% 54% N.S. …but biopsy is an operator-dependent procedure and its effect may vary Scott et al. (2013) Fertil Steril PGD v.2: • Array ile 24 kromozom analizi • Blastosist biopsisi Blastosist biopsisi: Avantaj ve Dezavantajları • Daha fazla DNA: Daha az sonuç yok • Daha az mozaisizm ve hata • Daha az biopsi etkisi • Daha az iş yükü ve maliyet • Daha fazla tek embriyo transferi • Frozen siklus: Endometriyum optimizasyonu Dezavantajları: • Bütün embriyolar aynı gün blastosiste ulaşmıyor Sonuç yok: 3. gün vs. 5. gün Biopsi aşaması Cleavage Blastosist Sonuç yok embriyo %3.2 %2.3 Merkez* dağılımı %1 - %5 %0 - %18 En deneyimli Deneyimsiz Gutierrez-Mateo et al. (2011) Fertil Steril and Reprogenetics data on 9049 embryos * Centers with >20 cycles done for that biopsy stage Trofoektoderm analizi ICM yansıtıyor mu? • ICM veTE %97 (31/32) uyumlu (aCGH) (a). • aCGH ile anormal olan blastosisler FISH ile tekrar analiz edildiğinde %97.5 yine anormal (39/40)(b). (a) Capalbo et al. (2013) , (b) Colls et al. (in preparation) Array Comparative Genome Hybridization Normal DNA Embryo DNA Trisomy Monosomy Normal Örnek kabulu Tüm genom amplifikasyonu (3 saat) DNA işaretleme (3 hrs) Hybridizasyon (min. 6 saat) Yıkama (30 dk) Tarama ve değerlendirme (45 dk) Raporlama DNA nın bir bölümü yedekleme için veya tekrar analiz için saklanır 46,XY 46,XX+7-10 aCGH avantajları • 24 kromozoma ait anöploidileri ve translokasyonları tanımlayabiliyor. • Sonuçlar 16-24 saat: 5.gün biyopsi ve 6. gün sabah transfer • Parental DNA analizi gerektirmez PGS evolution 100% 90% 80% 70% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0% 1993-1995: Cornell Univ. ; 1996-2000: Saint Barnabas; 2001-present: Reprogenetics data aCGH day 5 aCGH day 3 CGH FISH 12 FISH 5-9 Day 5: Prognosis depending on age and ovarian response Ata, Munne et al. (2012) Reprod Biomed Online (875 cycles, 4600 embryos) and unpublished data. Euploidy significantly decreased with age (p<0.001) but Overall clinical results CGH, blastocyst biopsy and vitrification: clinical results Cycles Mat. Prev. embryos implant. age failed replaced (+ sac) cycles CGH : 45 37.7 2.4 2.0 72% control : 113 37.1 1.2 2.7 46% p=0.0003 Schoolcraft et al. (2010) Fertil. Steril. 94:1700 Clinical results with fresh transfer: qPCR Average age: 32, average blastocysts biopsied: 8 Control Ongoing implant. rate 47.8% PGD 66.4% P=0.01 Ongoing preg. rate 84.7% P=0.01 67.5% Scott et al., 2013 Fertil Steril. Prospective Randomized Trial in patients <35 with day 5 biopsy, day 6 transfer Patients Maternal age Biopsy on day 5 Transfer on Embryos euploid (N) Embryos replaced (av.) Pregnancy rate (sac) Ongoing preg rate Multiple pregnancies Control 48 <35 no day 6 n/a 48 (1) 45.8% 41.7% 0 Yang et al. (2012) Molec Reprod PGD (aCGH) 55 <35 yes day 6 53.2% (425) 55 (1) 70.9% p<0.05 69.1% p<0.05 0 Array CGH with Day 5 biopsy: Results from centers with >20 cycles cycles: Maternal age: # blasts biopsied: Implantation after PGD Pregnancies / cycle Pregnancies / transfer total range per center 2015 35.6 5.5 52% 50% 66% 20-378 35 – 38.4 5.3-8.2 37-82% 28-71% 52-91% Reprogenetics data to 1/2013 qPCR with Day 5 biopsy: CRT results Good prognosis patients. Control replaced on day 5, test biopsied on day 5 and replaced on day 6 age PGD 32.2 Control 32.2 N blastocysts 72 8 83 7.9 Emb replaced implantation Sustained implant Delivery rate 1.9 79.8% 66.4% 84.7% 2.0 63.2% 47.9% 67.5% Scott et al. (2013) Fertil Steril P=0.002 P=0.03 P=0.01 Fresh or Frozen? Day 5 biopsy and vitrification: Other center results ongoing pregnacy rate 1 euploid blastocyst 2 untested blastocyst Fresh transfer 65% 70% Frozen transfer 55% 52% NS NS Blastocyst biopsy fresh vs. frozen: Array CGH results ongoing pregnancy rate / transfer cycles FET day 6 Center 1 104 55% 66% NS Center 2 110 46% 61% NS Data from: Reprogenetics, unpublished Four-hour quantitative real-time polymerase chain reaction–based comprehensive chromosome screening and accumulating evidence of accuracy, safety, predictive value, and clinical efficacy Nathan R. Treff, Ph.D.,a,b,c and Richard T. Scott Jr., M.D.a,b a Reproductive Medicine Associates of New Jersey, Morristown; b Division of Reproductive Endocrinology, Department of Obstetrics, Gynecology, and Reproductive Science, University of Medicine and Dentistry of New Jersey–Robert Wood Johnson Medical School, New Brunswick; and c Department of Genetics, Rutgers–State University of New Jersey, Piscataway, New Jersey Although there are many advantages, it is also important to note the requirement and capital equipment expenses associated with the need for multiple real-time PCR instruments to handle concurrent processing of multiple embryo biopsies and to maintain quality control for each of the individual components of the procedure. ÖZET Blastosist biopsisi: aCGH • Daha fazla DNA: Daha az sonuç yok• 24 kromozoma ait anöploidileri ve • Daha az mozaisizm ve hata translokasyonları tanımlayabiliyor. • Daha az biopsi etkisi • Sonuçlar 16-24 saat: • Daha az iş yükü ve maliyet 5.gün biyopsi ve 6. gün sabah transfer • Daha fazla tek embriyo transferi • Parental DNA analizi • Frozen siklus: Endometriyum gerektirmez optimizasyonu Dezavantajları: • Bütün embriyolar aynı gün ve saatte blastosiste ulaşmıyor • Maliyet Taze / Donmuş İki çalışmada fark yok