ENZİMLER (BİYOLOJİK KATALİZÖRLER) Vücut ısısı Reaksiyonların gerçekleşmesi için gereken başlangıç enerjisine aktivasyon enerjisi denir. Katalizör denilen maddeler ise başlangıç için gereken bu enerjiyi aşağıya çekerler. Katalizörler, canlı sistemlerin dışında inorganiktir. Dolayısıyla ısıtılırlarsa kinetik enerji artacağından, çalışma hızları da artar. Canlı vücudu içinde bulunan organik yapılı (protein) katalizörlere ise ENZİM denir. Enzimler organik olduklarından fazla ısıtılamazlar. Bu bir dezavantaj gibi görünse de düşük 18 H2O2 ısılarda çalışabilmesi bir üstünlüktür. H2O + ½ O2 Katalaz Reaksiyonlardan enzimler görüleceği reaksiyonun gibi başlaması için gereken enerjiyi aşağı çekerler. Dikkat edilmesi gereken şeylerden biri enzimlerin reaksiyonu Sadece başlamış başlatamazlar. reaksiyonları hızlandırabilirler. başlatan Reaksiyonları aktivasyon (ısı veya atp) enerjisidir. Basit ve bileşik enzim olmak üzere iki çeşittir. Basit Enzim Sadece kısmı Bileşik Enzim protein Protein kısmının (apoenzim) (apoenzim) ile çalışabilir. aktifleşebilmesi için yardımcı kısma (ko…………) ihtiyaç duyarlar. Ör; Üreaz, pepsin Ör; Sitokrom oksidaz vb enzim Olaya enzim dahil edildiğinde reaksiyonlar daha HIZLI daha KISA SÜREDE ve daha AZ ENERJİ gerçekleşebilir. Örneğin ; H2O2 H2O + ½ O2 5 Kcal MnO2 yardım eden kısım organik yapılı ise KOENZİM adını alır. Ör; vitamin, Nad, Fad vb. Enzime yardım eden kısım inorganik ise KOFAKTÖR adını alır. Ör; Fe, Ca, vb mineraller. 18 Kcal H2O2 ile Enzime H2O + ½ O2 Unutmayalım reaksiyona girecek molekülleri Atp reaksiyonu kontrol aktifleştirirken, eden aktifleştiren Ko……………..lerdir. enzimi Apoenzim , koenzim veya kofaktör ile aktifleşerek Holoenzime dönüşüyor. Enzimin substrata gerekli etkiyi yapabilmesi için, substrata yüzeyinden geçici bir bağ kurması gerekiyor. Gerekli etkiyi yaptıktan sonra, enzim substrattan ayrılıyor. enzimler hücre içi veya hücre dışında Enzim substratı dönüştürdükten ürüne sonra, hiçbir şey çalışabilir. reaksiyonlar olamayacağından, Atp yapısına Enzimler isteyen bu iki sebepten dolayı 19 Bu yüzden Hücre dışında çalışması mantığı reaksiyondan çıkan enzim miktarı sütten peynir yapımı (peynir mayası aynıdır, değişmez. (sabittir) ile), Enzim ile substrat arasında anahtar- yapımı kilit uyumu vardır. enzimlerle de yapılabilir.), hamurun Yani enzimler özgül (substrata özel) ekşitilmesi, bazı hastaların kullandığı moleküllerdir. hazır pankreas enzimleri…. substratı tanıyan-seçen üzümden ise enzimleri hariç. kontrolünde yapılı ve üretilmiş, kişiye özel O zaman üreteceği bozulan kişinin apoenzim de değişeceğinden, doğru enzim üretilemeyebilir. Genetik Ör; hemofili hastaları ile, kanın pıhtılaşmasında kullanılan bazı Faktör’leri üretemezler. Her hücre ribozomunda kendi enzimini üretir. Lakin kendi ki hazır Solunum ve sindirim Enzimler genellikle takım halinde E1 + AB +E2C +E3 D Bir enzimin ürünü diğer enzimin substratı olabilir. X kromozomundaki bozuk gen sebebi , çalışırlar bazı hastalıklar bu şekilde ortaya çıkar. de şarap A + Enzim <--------> B + Enzim Dna’sı yada Bazı enzimler tersinir (çift yönlü) çalışırlar. Dna sirke (bakterilerle kısmı apoenzim kısmıdır. Apoenzim moleküldür. hücre birçok olayda kullanılmaktadır. Ör; protein sadece içinde olur. giren reaksiyonlar gerektiren ve Enzimin reaksiyone Atp gibi, Enzimler ürünün dışında belirttiğimiz hücre tekrar tekrar kullanılabilirler. sayfamızda olmamış gibi reaksiyondan ayrılır. katılmazlar. İlk Dolayısıyla enzimler takım halinde çalışırlar. Her enzim çalışır. bir gen kontrolünde zorunda değildir. Ör; hidroliz ve kolaylaştırılmış difüzyonda enzim var ama Atp yoktur. Şekle dikkat maddelerine edebiliyor. edersek iki Z farklı Ama ve enzim E2 sadece A + E 1 B + E1 Y A + E 2 K + E2 etki Y Ör; pepsin enzimi sadece sindirir iken, proteini Enzimlerin substrata bağlandığı kısmına “Aktif Bölge” denir. maddesine etki edebiliyor. Enzim değişirse ürün de değişir. protein sindiren enzimler ise birkaç çeşittir. O halde “HER ENZİMİN ETKİ ETTİĞİ BELLİ BİR MADDE VARDIR. BİR 20 SUBSTRATA İSE BİRKAÇ ENZİM tutunan ETKİ EDEBİLİR.” ve onları “Durduran” maddelere ise İnhibitör denir. Ör; Böylece hücrede tepkime çeşiti kadar ağrı kesiciler, yılan ve böcek zehirleri, enzim çeşiti olmak zorundadır. Substrat taklidi yaparak enzimlere uyuşturucu ve alkol, ağır metaller Ayrıca her enzime yardımcı olacak birer inhibitördürler. koenzim yada kofaktör bellidir ve bir çeşittir. Mesela X enzimi sadece B6 vitamini ile çalışır. Ama B6 vitamininin yardım ettiği tek enzim X enzimi olmayabilir. Her enzim proteinler protein genlerin içerir ve kontrolünde üretilir. O halde bir gen bir enzim hipotezi devreye girecektir. “Az” eki enzim olduğunu , “ojen” eki ise pasif bir enzim olduğunu gösterir. Bazı enzimler iki apoenzimden oluşabilir. Ör; Tripsin Tripsinojen + Enterokinaz = Tripsin Atp olan her yerde enzim vardır. Enzim olan her yerde atp olmak Gereken ürün miktarına ulaşılmış ise, enzim aktivitesi durdurulabilir. Buna geri bildirim denir. ısıtıyoruz. Bazı gıdalarımızı buzdolabında tutuyoruz. Çünkü parazitlerin enzimleri soğuk ortamda çalışamazlar ve gıdalarımız sağlam kalır. 2. Ph Her enzimin çalıştığı belli bir Ph değeri vardır. Ör; mide enzimleri asit Enzimleri hızlandıran maddelere ise “Aktivatör” denir. Vücutta enzimsiz reaksiyon yoktur. O halde enzimi etkileyen her şey canlıyı da etkiler. 21 Bazı enzimler işi bittikten sonra , monomerlerine parçalanırlar. ortamda çalışabilir. Eğer ph’ını değiştirirsek ortamın enzimler çalışamayabilir. Daha önce kan Ph’ını anlatırken değinmiştik. 15 günde turşusu Ör; salatalık çürürken yapılırken , turşu salatalık suyuna katılan limon veya sirke turşunun ph’ını düşürdüğünden, salatalık bir yıl bozulmaz. ( bu arada en iyi turşu limon suyu ile olur ) ENZİM HIZINA ETKİ EDEN FAKTÖRLER 1. SICAKLIK Enzimler proteinden olduklarından, sıcaklıkta yapılı proteinler bozulurlar. “Denaturasyon” yüksek Bu olaya denir. Denature olan enzim soğutulsa bile artık çalışamaz. 0 Co de enzimler durur ve çalışamazlar. Ama 3. SU MİKTARI ısıtılırlarsa çalışabilirler. Enzimlerin en iyi Enzimler ancak %15 ve üzerinde su çalıştığı bulunan sıcaklığa “Optimum Sıcaklık” denir. Genellikle bu sıcaklık 35-37 Co’dir. ortamda çalışabilirler. Dolayısıyla su miktarı az olan ortamda çalışamazlar. Ör; yapısında uzaklaştırdığımız kayısı kurutularak bulunan suyu zaman aylarca çürümüyor. Bal veya reçel su oranı düşük olduğu için bakterilerin enzimleri Gıdalarımızı enzimleri bozan bozulsun parazit diye canlıların gıdalarımızı tarafından kolay kolay bozulamıyor. Süzme yoğurt haftalarca bozulmadan kalabiliyor. Mumyaların yapısındaki su 8. ÜRÜN MİKTARI çıkarıldığı için binlerce yıl bozulmuyor. Ürün artarsa , enzim ürünü tekrar ilk substrata 4. SUBSTRAT MİKTARI Substrat enzimin etkilediği çalışan maddedir. Dolayısıyla ne kadar çok substrat varsa enziminde Haliyle ona bağlanması substrat miktarı geri döndürebilir.( enzimler). Bu tersinir da ürün oluşumunu yavaşlatır. 9. SUBSTRAT kolaylaşır. YÜZEYİ artarsa, biri zamanda substrata bağlanan enzim arttıkça miktarı reaksiyon hızı da artar. Tabii enzimlerin hızlanır. tamamı dolana kadar. Eğer boşta enzim Ör; 100 gr kıyma , 100 gr kuşbaşı kalmazsa reaksiyon son hızına ulaşır ve ete göre daha kolay sindirilir. sabit hızda devam eder. artacağından reaksiyon Konu Sonu Sorular bu grafikte T1 anında ne olmuş olabilir? Alttaki 22 grafikte miktarının 5. ENZİM MİKTARI Enzim miktarı arttıkça reaksiyon hızı da en ortamdaki fazla olduğu ürün nokta hangisidir? Neden? belli bir yere kadar artar. Eğer substrat da enzim gibi sürekli artarsa reaksiyon hızı da sürekli artar. Bazen reaksiyon ilerledikçe substrat giderek azalır ve sonuçta biter. O zaman reaksiyon hızı da sıfır olur. Ör; midemizdeki besinler sindirilince ince barsağa geçer ve biter. Dolayısıyla midede reaksiyon durur. Substrat miktarı artınca enzim zarından hangi hızlanır mı? Neden ? Enzim hücre yöntemle geçer? Alttaki grafikten ne anlıyorsunuz? 6. AKTİVATÖRLER 7. İNHİBİTÖRLER 100 gr kıyma ve 100 gr parça et sindirildiğinde oluşan ürün miktarı ilişkisi ne olur? Karaciğer sorularına hazır mısınız? Yarışmalı ve yarışmasız inhibitörlerin farkları nelerdir? Enzim hidroliz edildiğinde kesinlikle ne oluşur? 23 ATP (Adenozin tri fosfat) Atp hücre içinde yapılır ve tüketilir. Nükleotid yapısında bir organik bileşik (hidroliz ve difüzyon gibi olaylar hariç) olan Atp, Enerji kullanılabilir enerji molekülüdür. Hücre ne şekilde enerji üretirse üretsin, mutlaka Atp haline çevirdikten sonra o enerjiyi kullanabilmektedir. Atp yapısında azotlu organik bir baz olan adenin (Dna ve Rna’da da) var. Ayrıca 5 karbonlu bir şeker olan Riboz (Rna’da da var) ve 3 tane fosforik asit bulunur. üretimi endergoniktir. (ısı veya enerji alan tepkime). 24 Dehidrasyon olayıdır. Anaboliktir (yapım). Virüsler hariç tüm canlılarda sentezlenir. Atp yapım ve yıkımı tersinirdir. Atp asla depolanmaz. Gerektiğinde her yerde bulunur. Atp’nin son fosfatı koptuğunda enerji açığa çıkar. Ayrıca Adp ve P oluşur. Atp + Su -- Adp + P + 7300 kalori Atp yapımına (PO4 eklenmesi) fosforilasyon denir. 4 şekilde gerçekleşir; 1-Substrat Düzeyde Fosforilasyon : Besinlerden üretmek Her hücre her an atp üretmektedir. Atp gereken enzimler yardımıyla demektir. Tüm Atp canlılar stoplazmasında gerçekleştirmek (glikoliz) zorundadır. Mitokondride de yapılabiliyor. 2-Oksidatif Fosforilasyon : Oksijen yardımıyla üretmek besinlerden demektir. Oksijenli Atp solunum hızlı yapan canlılarda görülür. (Birkaç bakteri Atp yapısında bulunan adenin ve riboz Stoplazma yada mitokondride yapılır. sentezlenir. Depolanmadığı için üretilip hızlı tüketilir. arasında glikozit bağı bulunurken, riboz ile fosfat arasında ise ester bağı vardır. Fosfatlar arasında fosfat bağı vardır. ise yüksek enerjili grubu hariç neredeyse tüm canlılar). Organik bileşiği oksitlemek de demektir. 3-Foto Fosforilasyon : Klorofil yardımıyla ışıktan Atp üretmek demektir. Kloroplast yada stoplazmada yapılabilir. Ör; Yeşil bitkiler, öglena, bazı bakteriler, algler ve bazı arkeler. 4-Kemo fosforilasyon : İnorganik bileşikleri oksitleyerek Atp elde etmek demektir. Dünyada sadece bir gurup bakteri yapabilir. ve metanojen arkeler Nükleozit trifosfatlar içersinde hücre enerjisi için en önemlileri "Adenozin trifosfat (ATP) ve Guanozin trifosfat (GTP) " dir. Çünkü çok miktarda bir enerji bu moleküllerin gruplarında son fosfat bulunmaktadır.) Her hücrede ~ bir milyar ATP molekülü vardır. Bu miktar hücrenin sadece birkaç dakikalık nedenle ihtiyacı bu için molekül yeterlidir. hızlı bir Bu şekilde yenilenmek (recycle) zorundadır. İnsanda yüz trilyon hücrenin olduğu düşünülürse ~ 10²³ ATP molekülü bulunmaktadır. Her ATP molekülünde dakikada üç defa son fosfat molekülü eklenip, kopartılıyor. 25 (Kornberg, 1989, p-65) İnsan vücudunun tamamındaki ATP sadece 50g gelmektedir ve bu miktar mutlaka her gün yenilenmelidir. ATP 'nin kaynağı ise besinlerdir. 24 saatini sadece dinlenerek yatakta geçiren kişinin hücreleri ~ 40kg ATP molekülü kullanır